LHX2 (англ. LIM homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 406 амінокислот, а молекулярна маса — 44 373[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLFHSLSGPE | | VHGVIDEMDR | | RAKSEAPAIS | | SAIDRGDTET | | TMPSISSDRA |
ALCAGCGGKI | | SDRYYLLAVD | | KQWHMRCLKC | | CECKLNLESE | | LTCFSKDGSI |
YCKEDYYRRF | | SVQRCARCHL | | GISASEMVMR | | ARDLVYHLNC | | FTCTTCNKML |
TTGDHFGMKD | | SLVYCRLHFE | | ALLQGEYPAH | | FNHADVAAAA | | AAAAAAKSAG |
LGAAGANPLG | | LPYYNGVGTV | | QKGRPRKRKS | | PGPGADLAAY | | NAALSCNEND |
AEHLDRDQPY | | PSSQKTKRMR | | TSFKHHQLRT | | MKSYFAINHN | | PDAKDLKQLA |
QKTGLTKRVL | | QVWFQNARAK | | FRRNLLRQEN | | TGVDKSTDAA | | LQTGTPSGPA |
SELSNASLSP | | SSTPTTLTDL | | TSPTLPTVTS | | VLTSVPGNLE | | GHEPHSPSQT |
TLTNLF |
Коротка інформація Ідентифікатори, Символи ...
LHX2
|
---|
|
Ідентифікатори |
Символи |
LHX2, LH2, hLhx2, LIM homeobox 2 |
Зовнішні ІД |
OMIM: 603759 MGI: 96785 HomoloGene: 55848 GeneCards: LHX2
|
---|
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• зв'язування з іоном металу • sequence-specific DNA binding • chromatin binding • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • внутрішньоклітинний
|
Біологічний процес |
• negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • mesoderm development • telencephalon development • neural tube closure • retina development in camera-type eye • cerebral cortex development • transcription, DNA-templated • axon guidance • axon extension • hair follicle development • maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • Нейрогенез • brain development • olfactory bulb development • нейробіологія розвитку • dorsal/ventral pattern formation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • neuron differentiation • anatomical structure formation involved in morphogenesis • telencephalon regionalization • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of gene expression, epigenetic • negative regulation of neurogenesis • positive regulation of neural precursor cell proliferation
|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
|
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 9: 124 – 124.03 Mb |
Хр. 2: 38.23 – 38.26 Mb |
PubMed search |
[1] |
[2]
|
---|
Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504