ERCC5 (англ. ERCC excision repair 5, endonuclease) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 186 амінокислот, а молекулярна маса — 133 108[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGVQGLWKLL | | ECSGRQVSPE | | ALEGKILAVD | | ISIWLNQALK | | GVRDRHGNSI |
ENPHLLTLFH | | RLCKLLFFRI | | RPIFVFDGDA | | PLLKKQTLVK | | RRQRKDLASS |
DSRKTTEKLL | | KTFLKRQAIK | | TAFRSKRDEA | | LPSLTQVRRE | | NDLYVLPPLQ |
EEEKHSSEEE | | DEKEWQERMN | | QKQALQEEFF | | HNPQAIDIES | | EDFSSLPPEV |
KHEILTDMKE | | FTKRRRTLFE | | AMPEESDDFS | | QYQLKGLLKK | | NYLNQHIEHV |
QKEMNQQHSG | | HIRRQYEDEG | | GFLKEVESRR | | VVSEDTSHYI | | LIKGIQAKTV |
AEVDSESLPS | | SSKMHGMSFD | | VKSSPCEKLK | | TEKEPDATPP | | SPRTLLAMQA |
ALLGSSSEEE | | LESENRRQAR | | GRNAPAAVDE | | GSISPRTLSA | | IKRALDDDED |
VKVCAGDDVQ | | TGGPGAEEMR | | INSSTENSDE | | GLKVRDGKGI | | PFTATLASSS |
VNSAEEHVAS | | TNEGREPTDS | | VPKEQMSLVH | | VGTEAFPISD | | ESMIKDRKDR |
LPLESAVVRH | | SDAPGLPNGR | | ELTPASPTCT | | NSVSKNETHA | | EVLEQQNELC |
PYESKFDSSL | | LSSDDETKCK | | PNSASEVIGP | | VSLQETSSIV | | SVPSEAVDNV |
ENVVSFNAKE | | HENFLETIQE | | QQTTESAGQD | | LISIPKAVEP | | MEIDSEESES |
DGSFIEVQSV | | ISDEELQAEF | | PETSKPPSEQ | | GEEELVGTRE | | GEAPAESESL |
LRDNSERDDV | | DGEPQEAEKD | | AEDSLHEWQD | | INLEELETLE | | SNLLAQQNSL |
KAQKQQQERI | | AATVTGQMFL | | ESQELLRLFG | | IPYIQAPMEA | | EAQCAILDLT |
DQTSGTITDD | | SDIWLFGARH | | VYRNFFNKNK | | FVEYYQYVDF | | HNQLGLDRNK |
LINLAYLLGS | | DYTEGIPTVG | | CVTAMEILNE | | FPGHGLEPLL | | KFSEWWHEAQ |
KNPKIRPNPH | | DTKVKKKLRT | | LQLTPGFPNP | | AVAEAYLKPV | | VDDSKGSFLW |
GKPDLDKIRE | | FCQRYFGWNR | | TKTDESLFPV | | LKQLDAQQTQ | | LRIDSFFRLA |
QQEKEDAKRI | | KSQRLNRAVT | | CMLRKEKEAA | | ASEIEAVSVA | | MEKEFELLDK |
AKGKTQKRGI | | TNTLEESSSL | | KRKRLSDSKG | | KNTCGGFLGE | | TCLSESSDGS |
SSEDAESSSL | | MNVQRRTAAK | | EPKTSASDSQ | | NSVKEAPVKN | | GGATTSSSSD |
SDDDGGKEKM | | VLVTARSVFG | | KKRRKLRRAR | | GRKRKT |
Коротка інформація Наявні структури, PDB ...
ERCC5
|
---|
|
|
Ідентифікатори |
Символи |
ERCC5, COFS3, ERCM2, UVDR, XPG, XPGC, ERCC5-201, excision repair cross-complementation group 5, ERCC excision repair 5, endonuclease |
Зовнішні ІД |
OMIM: 133530 MGI: 103582 HomoloGene: 133551 GeneCards: ERCC5
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
xeroderma pigmentosum group G[1] |
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• DNA binding • protein homodimerization activity • hydrolase activity, acting on ester bonds • protein N-terminus binding • bubble DNA binding • зв'язування з іоном металу • single-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • nuclease activity • endonuclease activity • double-stranded DNA binding • endodeoxyribonuclease activity • hydrolase activity • RNA polymerase II complex binding • GO:0032403 protein-containing complex binding
|
Клітинна компонента |
• RNA polymerase II, holoenzyme • transcription factor TFIIH holo complex • DNA replication factor A complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • nucleotide-excision repair complex
|
Біологічний процес |
• negative regulation of apoptotic process • cellular response to DNA damage stimulus • УФ-захист • transcription-coupled nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision • response to UV • response to UV-C • nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion
|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
|
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 13: 102.85 – 102.88 Mb |
Хр. 1: 44.19 – 44.22 Mb |
PubMed search |
[2] |
[3]
|
---|
Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію.
Локалізований у ядрі.
- Emmert S., Schneider T.D., Khan S.G., Kraemer K.H. (2001). The human XPG gene: gene architecture, alternative splicing and single nucleotide polymorphisms. Nucleic Acids Res. 29: 1443—1452. PMID 11266544 DOI:10.1093/nar/29.7.1443
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- O'Donovan A., Davies A.A., Moggs J.G., West S.C., Wood R.D. (1994). XPG endonuclease makes the 3' incision in human DNA nucleotide excision repair. Nature. 371: 432—435. PMID 8090225 DOI:10.1038/371432a0
- Habraken Y., Sung P., Prakash L., Prakash S. (1994). Human Xeroderma pigmentosum group G gene encodes a DNA endonuclease. Nucleic Acids Res. 22: 3312—3316. PMID 8078765 DOI:10.1093/nar/22.16.3312
- Cloud K.G., Shen B., Strniste G.F., Park M.S. (1995). XPG protein has a structure-specific endonuclease activity. Mutat. Res. 347: 55—60. PMID 7651464 DOI:10.1016/0165-7992(95)90070-5
- Gary R., Ludwig D.L., Cornelius H.L., MacInnes M.A., Park M.S. (1997). The DNA repair endonuclease XPG binds to proliferating cell nuclear antigen (PCNA) and shares sequence elements with the PCNA-binding regions of FEN-1 and cyclin-dependent kinase inhibitor p21. J. Biol. Chem. 272: 24522—24529. PMID 9305916 DOI:10.1074/jbc.272.39.24522