![cover image](https://wikiwandv2-19431.kxcdn.com/_next/image?url=https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/91/2bnh_topview.png/640px-2bnh_topview.png&w=640&q=50)
Ponavljanje bogato leucinom
From Wikipedia, the free encyclopedia
Ponavljanje bogato leucinom () je proteinski strukturni motiv koji formira strukturu α/β potkovice.[1][2] On se sastoji od ponavljanja koja su 20–30 aminokiselina duga, i koja su obično bogata u hidrofobnoj aminokiselini leucinu. Tipično, svaka jedinica ponavljanja ima beta lanac-okret-alfa heliks strukturu. Domen formiran od mnogih takvih ponavljanja ima oblik potkovice sa unutrašnjom paralelnom beta ravni i spoljašnjim nizom heliksa. Jedno lice beta ravni i jedna strana niza heliksa su izloženi rastvaraču i stoga su bogati u hidrofilnim ostacima. Region između heliksa i ravni je proteinska hidrofobna osnova i čvrsto je sterično pakovana leucinskim ostacima.
![]() Primer proteina sa ponavljanjem bogatim leucinom, svinjski inhibitor ribonukleaze | |||||||||
Identifikatori | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Simbol | LRR_1 | ||||||||
Pfam | PF00560 | ||||||||
Pfam klan | CL0022 | ||||||||
InterPro | IPR001611 | ||||||||
SCOP | 2bnh | ||||||||
SUPERFAMILY | 2bnh | ||||||||
OPM protein | 1xwd | ||||||||
|
Varijanta ponavljanja bogatog leucinom | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() Varijanta ponavljanja bogatog leucinom | |||||||||
Identifikatori | |||||||||
Simbol | LRV | ||||||||
Pfam | PF01816 | ||||||||
Pfam klan | CL0020 | ||||||||
InterPro | IPR004830 | ||||||||
SCOP | 1lrv | ||||||||
SUPERFAMILY | 1lrv | ||||||||
|
Ponavljanja bogato leucinom često učestvuju u formiranju međuproteinskih interakcija.[3][4]