אתר ישיבה הוא האתר הישיבתי השני שקם אחרי אתר ישיבת הר עציון ואתר היהדות הסלולרי הראשון. מטרת הקמת האתר, בהמשך להקמת ערוץ 7 ואתר ערוץ 7 על ידי צוות הישיבה, הייתה לפנות אל הקהל הרחב, ולפתוח שער אל עולמה של התורה לכל יהודי באשר הוא, בישראל ומחוצה לה. כיום הישיבה מעסיקה 16 עובדים בתחזוקת האתר.
באתר יש כ-50,000 שיעורים שונים בעברית ובאנגלית, ולמעלה מ-100,000 תשובות שנענו במדור "שאל את הרב", והוא מפיק כמאתיים שידורים חיים בשנה.
בית המדרש - מאגר שיעורים של רבנים, בעיקר מהציונות הדתית. השיעורים קיימים כקובציוידאו, שמע או טקסט, כאשר חלק מהשיעורים קיימים בכמה סוגי קבצים (כל שיעורי הווידאו קיימים גם כקובצי שמע). השיעורים מחולקים לפי עץ נושאים מפורט ונרחב מאוד. בין הנושאים: גמרא, הלכה, אמונה, תנ"ך, פרשת השבוע, מועדים ועוד. כמו כן, מקודמים על בסיס יום-יומי שיעורים בלימודים יומיים כגון: הדף היומי, לימוד משנה יומית, לימוד יומי באמונה והרמב"ם היומי.
שאל את הרב - מאגר של אלפי שאלות ותשובות של רבנים שונים, כמעט כולם מהציונות הדתית. השאלות האחרונות מתפרסמות בדף הבית של האתר. סמוך לחגי ישראל ומועדיו מצורף לינק לשאלות רלוונטיות לאותו מועד. מדי פעם מאגר זה משמש את "nrg יהדות" או "ynet יהדות"[2] כדי לבדוק התייחסות של רבני הציונות הדתית למצב הנוכחי. במסגרת המדור צמח גם "בית הוראה לטהרת המשפחה", הנותן מענה לשאלות בנושאים אלה תוך 3 שעות. בין המשיבים באתר ניתן למצוא את הרבנים זלמן מלמד, אביגדר נבנצל, יעקב אריאל, דוב ליאור, אליעזר מלמד, דוד חי הכהן, נריה גוטל, יהושע שפירא, אליקים לבנון וכן אנשי הרבנות הראשית לישראל, הרבנות הצבאית, מכון פוע"ה ומכון התורה והארץ. בנוסף, כחלק ממדור שאל את הרב, נפתחו קבוצות וואטסאפ לשאלות ותשובות. בכל קבוצה חברים מספר רבנים, השואלים שולחים את השאלות בקבוצה והרבנים משיבים. קישור ההצטרפות לקבוצות מופץ ואנשים מרחבי הארץ והעולם מצטרפים בצורה עצמאית. עד היום נפתחו למעלה מ10 קבוצות כאלו.
לוח שנה - לוח שנה עברי וזמני היום הנוגעים להלכה. זמניהיום מותאמים למאות אזורים בארץ ובעולם, והדבר נעשה במאמץ הלכתי וממוחשב כאחד. האתר מאפשר לבדוק זמנים שונים וגם להירשם לשירות דואר אלקטרוני ששולח את הזמנים המבוקשים על פי התאמה אישית. לוח השנה אף מאפשר לפרסם לציבור אירועים שונים בעלי אופי תורני, כגון תפילות, שיעורי תורה וימי עיון תורניים.
ויקישיבה - בחודש תמוזה'תשס"ח (יולי-אוגוסט2008) יצאה הישיבה במיזם ליצירת אנציקלופדייתאינטרנט למושגי יהדות, המבוססת על תוכנת מדיה-ויקי. בשונה מוויקיפדיה, מטרת ויקישיבה היא לעסוק אך ורק בנושאים תורניים ומושגים הקשורים ליהדות, ולהגדיר אותם באופן סובייקטיבי על פי היהדות. "ויקישיבה" יצרה, בשיתוף עם פרויקט השו"ת של אוניברסיטת בר-אילן, תבנית לקישור ציוני מקורות מאתר ויקישיבה לעמוד המכיל את הטקסט במקורו באתר "פרויקט השו"ת". מיזם "ויקישיבה" בנוי בטכנולוגיית ויקי, ופתוח לעריכה על ידי כל גולש אינטרנט. האתר אוסר שימוש מסחרי בטקסט. בראשית העשור השני של המאה ה-21 נוספו לאתר ערכי ה"מיקרופדיה התלמודית", מיזם תמציתי של האנציקלופדיה התלמודית.
ערוץ טלוויזיה אינטרנטי בו משודרים שיעורי תורה בכל שעות היממה, ובו מועברים מעת לעת שידורים חיים מיוחדים כגון כנסים וימי עיון, שידורים חיים לשאלות ותשובות עם רבנים וכדומה. שיא הצפייה בערוץ היה בעת שידור לווייתו של הרב מרדכי אליהו. שידור זה אף הועבר לראשונה באמצעות המכשירים הסלולריים.