KHDRBS3

La KHDRBS3 (pour « KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 3 » en anglais) est une protéine codée par le gène KHDRBS3, présent sur le chromosome 8 humain et le chromosome 15 de la souris^[4],[5],[6].

KHDRBS3
Visualisation de la protéine Cristallisée KHDRBS3
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 5ELR, 5ELS, 5EMO, 5ELT, 5EL3
Identifiants
Aliases	KHDRBS3
IDs externes	OMIM: 610421 MGI: 1313312 HomoloGene: 4780 GeneCards: KHDRBS3
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 15 (souris)[1] Locus 15 D3|15 30.36 cM Début 68,800,269 bp[1] Fin 68,973,060 bp[1]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans gyrus temporal moyen cortex préfrontal Brodmann area 9 secondary oocyte Brodmann area 23 sperme Brodmann area 46 gyrus cingulaire cortex orbitofrontal amygdale Fortement exprimé dans septum interventriculaire neural layer of retina dentate gyrus of hippocampal formation granule cell cortex visuel primary visual cortex gyrus frontal supérieur hippocampus proper ventricular zone cortex préfrontal gyrus précentral Plus de données d'expression de référence BioGPS Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology Fonction moléculaire SH3 domain binding liaison protéique liaison ARN Fixation d'acide nucléique protein domain specific binding identical protein binding Composant cellulaire noyau nucléoplasme Processus biologique regulation of transcription, DNA-templated transcription, DNA-templated mRNA processing regulation of mRNA splicing, via spliceosome protein complex oligomerization Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 10656 13992 Ensembl n/a ENSMUSG00000022332 UniProt O75525 Q9R226 RefSeq (mRNA) NM_006558 NM_010158 RefSeq (protéine) NP_006549 NP_034288 Localisation (UCSC) n/a Chr 15: 68.8 – 68.97 Mb Publication PubMed [2] [3]
Wikidata
Voir/Editer Humain Voir/Editer Souris

Interaction

La KHDRBS3 interagit avec la protéine SIAH1 (en)^[7],[8].

Notes et références

• (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « KHDRBS3 » (voir la liste des auteurs).

1. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022332 - Ensembl, May 2017
2. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
3. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
4. (en) Venables JP, Vernet C, Chew SL, Elliott DJ, Cowmeadow RB, Wu J, Cooke HJ, Artzt K, Eperon IC, « T-STAR/ETOILE: a novel relative of SAM68 that interacts with an RNA-binding protein implicated in spermatogenesis », Hum Mol Genet, vol. 8, n^o 6,‎ juillet 1999, p. 959–69 (PMID 10332027, DOI 10.1093/hmg/8.6.959).
5. (en) Lee J, Burr JG, « Salpalpha and Salpbeta, growth-arresting homologs of Sam68 », Gene, vol. 240, n^o 1,‎ janvier 2000, p. 133–47 (PMID 10564820, DOI 10.1016/S0378-1119(99)00421-7).
6. (en) « Entrez Gene: KHDRBS3 KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 3 ».
7. (en) Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M, « Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network », Nature, vol. 437, n^o 7062,‎ octobre 2005, p. 1173–8 (PMID 16189514, DOI 10.1038/nature04209).
8. (en) Venables JP, Dalgliesh C, Paronetto MP, Skitt L, Thornton JK, Saunders PT, Sette C, Jones KT, Elliott DJ, « SIAH1 targets the alternative splicing factor T-STAR for degradation by the proteasome », Hum. Mol. Genet., vol. 13, n^o 14,‎ juillet 2004, p. 1525–34 (PMID 15163637, DOI 10.1093/hmg/ddh165).

Bibliographie

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(en) Venables JP, Dalgliesh C, Paronetto MP, Skitt L, Thornton JK, Saunders PT, Sette C, Jones KT, Elliott DJ, « SIAH1 targets the alternative splicing factor T-STAR for degradation by the proteasome. », Hum. Mol. Genet., vol. 13, no 14,‎ 2005, p. 1525–34 (PMID 15163637, DOI 10.1093/hmg/ddh165) (en) Cohen CD, Doran PP, Blattner SM, Merkle M, Wang GQ, Schmid H, Mathieson PW, Saleem MA, Henger A, Rastaldi MP, Kretzler M, « Sam68-like mammalian protein 2, identified by digital differential display as expressed by podocytes, is induced in proteinuria and involved in splice site selection of vascular endothelial growth factor. », J. Am. Soc. Nephrol., vol. 16, no 7,‎ 2005, p. 1958–65 (PMID 15901763, DOI 10.1681/ASN.2005020204) (en) Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M, « Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network. », Nature, vol. 437, no 7062,‎ 2005, p. 1173–8 (PMID 16189514, DOI 10.1038/nature04209) (en) Zhang L, Guo L, Peng Y, Chen B, « Expression of T-STAR gene is associated with regulation of telomerase activity in human colon cancer cell line HCT-116. », World J. Gastroenterol., vol. 12, no 25,‎ 2006, p. 4056–60 (PMID 16810759) (en) Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M, « Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks. », Cell, vol. 127, no 3,‎ 2006, p. 635–48 (PMID 17081983, DOI 10.1016/j.cell.2006.09.026)

Voir aussi

Liens internes

• KHDRBS1 (en)

• Portail de la biologie cellulaire et moléculaire