Gisèle Séginger rejoint en 2004 l'université de Marne-la-Vallée[2], où elle fonde et dirige depuis 2007 le master Édition livre papier et numérique[6], dont la moitié des enseignements environ sont destinés à la production assistée par ordinateur et au multimédia[7]. Elle y crée aussi en 2004 l'unité de recherche LISAA, qu'elle dirige jusqu'à 2015[8].
Gisèle Séginger propose en 2001 une édition critique de Salammbô chez GF Flammarion[12]. Elle dirige le Dictionnaire Flaubert publié en 2017 aux éditions Honoré Champion[13],[14], qui contient plus de 650 articles sur l'écrivain et son œuvre[15], rédigés par plus de 100 universitaires[16]. ainsi que les œuvres complètes du romancier chez la même maison d'édition. Elle contribue aux tomes II et III des Œuvres complètes de Flaubert dans la Pléiade[17], et dirige en 2021 la publication du tome IV[18], qui contient notamment L'Éducation sentimentale[19].
Elle est aussi spécialiste des illustrations de l'œuvre de Flaubert, ayant notamment dirigé l'ouvrage Flaubert et la peinture[20] en 2010, et publié en 2021 L’Orient de Flaubert en images[21],[22]. Ces travaux alimentent aussi ses enseignements dans le master Édition qu'elle dirige, où elle aborde les questions relatives au rapport entre texte et image[23].
Elle reçoit en 2022 le prix René Dumesnil pour son ouvrage Berlioz, Flaubert et l’Orient, codirigé avec Cécile Reynaud.
Sur les liens entre sciences du vivant et littérature
Depuis les années 2010, Gisèle Séginger mène des travaux de recherche concernant les liens entre sciences du vivant et littérature, en particulier au XIXe siècle, dans le cadre de programmes de recherche qu'elle coordonne tels que Biolographes, financé par l'Agence nationale de la recherche et la Fondation allemande pour la recherche de 2014 à 2017[28] ou Urbanature[29], financé par l'I-SITE Future porté par l'université Gustave Eiffel[30].
Porteuse de plusieurs programmes de recherche sur les savoirs du vivant soutenus par la Fondation Maison des sciences de l'homme[31],[32], elle coordonne aussi avec Christine Maillard depuis 2013 le réseau pluridisciplinaire inter-MSHVIVANLIT, Penser le vivant: les échanges entre littérature et sciences de la vie de la fin du XVIIIesiècle à l’époque contemporaine[33].
Elle co-dirige ainsi les ouvrages Penser le vivant aux éditions de la FMSH en 2017[34], Biological Time, Historical Time. Transfers and Transformations in 19thCentury Literature aux éditions Brill en 2018[35] et Littérature française et savoirs biologiques au XIXesiècle Traduction, transmission, transposition chez De Gruyter en 2020[36].
Auguste Dezalay et Gisèle Séginger, Zola à l'oeuvre: hommage à Auguste Dezalay: actes du colloque Zola, génétique et poétique du roman, 9 et 10 décembre 2002, Strasbourg, Presses universitaires de Strasbourg, , 244p. (ISBN2-86820-207-1 et 978-2-86820-207-9, OCLC54205322, lire en ligne)
Sylvain Ledda, Frank Lestringant et Gisèle Séginger, Poétique de Musset: [actes d'un colloque organisé à Cerisy-la-Salle en août 2010], Rennes, Presses universitaires de Rouen et du Havre, , 334p. (ISBN978-2-87775-584-9 et 2-87775-584-3, OCLC842855554, lire en ligne)
Laurence Dahan-Gaida, Christine Pflieger-Maillard, Laurence Talairach-Vielmas et Gisèle Séginger, Penser le vivant, Paris/58-Clamecy, Éditions de la Maison des sciences de l'homme / Impr. Laballery, , 404p. (ISBN978-2-7351-2383-4 et 2-7351-2383-9, OCLC1011588147, lire en ligne)
Gustave Flaubert, La Tentation de saint Antoine [de 1849], La Tentation de saint Antoine [de 1856], Salammbô et Le Conte oriental, Œuvres complètes, sous la direction de Claudine Gothot-Mersch, Bibliothèque de la Pléiade, Gallimard, tomes II et III, 2013.
Gustave Flaubert, Œuvres complètes, tome IV (avec la collaboration de Philippe Dufour et de Roxane Martin), Bibliothèque de la Pléiade, Gallimard, 2021.
Gisèle Séginger, «La tentation» et ses métamorphoses. Étude génétique et textuelle de «La tentation de Saint-Antoine» de Gustave Flaubert (1849-1874) (thèse de doctorat en littérature française), Université Paris VIII, (présentation en ligne)
Ildikó Lőrinszky, «Flaubert et la peinture. Textes réunis et présentés par Gisèle Séginger», Flaubert. Revue critique et génétique, (ISSN1969-6191, lire en ligne, consulté le )
(en) Biological Time, Historical Time: Transfers and Transformations in 19th Century Literature, Leiden/Boston, Brill, (ISBN978-90-04-38516-0, lire en ligne)