Aastatel 1992–1997 õppis Sutrop Konstanzi Ülikooli doktorantuuris kirjandusteadust ja esteetikat. 7. juulil 1997 kaitses ta doktoritöö teemal "Fiction and Imagination: The Anthropological Function of Literature" ("Fiktsioon ja kujutlus: ilukirjanduse antropoloogiline funktsioon"), mille eest pälvis 1998. aastal Konstanzi kreisi auhinna teaduslikule järelkasvule. Doktoriõpingud lõpetas ta ausgezeichnet ('väljapaistvalt') ehk summa cum laude.[5]
Aastatel 1996–1997 ja 1999–2000 töötas Sutrop Konstanzi Ülikoolis teadurina, 1998. aastal oli ta samas ka järeldoktorantuuris. Eestisse naasmise järel spetsialiseerus Sutrop pärast 14-aastast esteetikastuudiumi ümber rakenduseetikale, algatades 2001. aastal Tartu Ülikooli eetikakeskuse loomise, mida on samast aastast ka juhatanud.[6]
12. aprillil2007 esitas filosoofiateaduskonna nõukogu Margit Sutropi Tartu Ülikooli rektori kandidaadiks. Teda toetasid lisaks sotsiaal- ja filosoofiateaduskonnale 22 professorit[8]. 31. mail 2007 toimunud rektorivalimistel sai Sutrop valimiskogus 69 häält, millega jäi 3. kohale[8].
2017. aasta veebruaris esitasid loodus- ja täppisteaduste valdkond, sotsiaalteaduste valdkond ning humanitaarteaduste ja kunstide valdkond Sutropi Tartu Ülikooli rektori kandidaadiks[9]. Valimised toimusid 30. märtsil 2017, 250 valimiskogu liikmest oli kohal 215. Hääled jagunesid: Margit Sutrop 97 ja Volli Kalm 113[10].
Sutrop esitati loodus- ja täppisteaduste valdkonna nõukogu, sotsiaalteaduste valdkonna ning humanitaarteaduste ja kunstide valdkonna poolt rektori kandidaadiks ka 2018. aasta kevadel[11]. Valimised toimusid 26. aprillil 2018, valimiskogu 263 liikmest oli kohal 215 liiget. Esimeses voorus sai Sutrop 95 häält ning teises voorus jätkas 120 häält saanud Toomas Asser.[12]
Riigikogu
Sutrop on alates 27. jaanuarist 2021 XIV Riigikogu liige. Vahemikus 2021 jaanuar–2022 oli Margit Sutrop Riigikogu kultuurikomisjoni ja Euroopa Liidu asjade komisjoni liige.[13]
Oktoobris 2021 asutas Sutrop Riigikogu kõrghariduse toetusrühma.[14] 9. detsembril 2021 korraldas Riigikogu kultuurikomisjon Riigikogu saalis olulise riiklikult tähtsa küsimusena arutelu kõrghariduse rolli, kvaliteedi ja rahastamise aluste kohta[15], milleks Margit Sutrop koostas põhjaliku raporti[16] Eesti Üliõpilaskondade Liit andis toetusrühmale ja Margit Sutropile 2022. aasta septembris autasu tudengite huvide eest seismise eest.[17]
Margit Sutrop, I. Kraav "Koolinoorte väärtused ja väärtuskasvatus" Rmt: "Eesti inimarengu aruanne 2009" Eesti Koostöökogu, 2010, lk 122–127
"Ethical Issues in Governing Biometric Technologies" Rmt: "Ethics and Policy of Biometrics" Springer-Verlag Heidelberg, 2010, pp 102–114.
Sutrop, M. (2011). "How to avoid a dichotomy between autonomy and beneficence? From liberalism to communitarianism and beyond". Journal of Internal Medicine, 269(4)/2011, pp 375–379.
Sutrop, M (2014). Using the Teachers’ Values Game to facilitate teachers’ reflection on their own values. Teacher Education Advancement Network, 6 (1), 55−63.
Cohnitz, Daniel; Sutrop, Margit (2014). Brief aus Estland. Deutsche Zeitschrift für Philosophie, 62 (2), 321−335
Sutrop, M (2015) "What is Estonian Philosophy?", Studia Philosophica Estonica (4-64), Tartu Ülikooli Kirjastus.
Sutrop, M (2015) "Can Values be Taught? The Myth of Value-free Education", Trames: Journal of the Humanities and Social Sciences, 19 (2), 189−202.
Sutrop, M. (2016) "Eesti filosoofia või filosoofia Eestis?" Rmt: Ü Matjus, J. Sooväli, toim. "Tagasi mõteldes. Töid filosoofia ajaloost Eestis" (21−83). Tartu: Tartu Ülikooli Kirjastus.
Sutrop, M (2016) "What Role Do Emotions Play in Moral Disagreements?", Desire: The Concept and its Practical Context (183-199). Transaction Publishers.
Sutrop, M.; Laas-Mikko, K. (2017) "How Do Violations of Privacy and Moral Autonomy Threaten the Basis of Our Democracy?", Technoscience and Citizenship: Ethics and Governance in the Digital Society (99-112). Springer International Publishing AG.
Forsberg, E-M, F O Anthun, S Bailey, G Birchley, H Bout, C Casonato, G González Fuster, B Heinrichs, S Horbach, I Skjæggestad Jacobsen, J Janssen, M Kaiser, I Lerouge, B van der Meulen, S de Rijcke, T Saretzki, M Sutrop, M Tazewell, K Varantola, KJ Vie, H Zwart, M Zöller (2018) "Working with Research Integrity – Guidance for Research Performing Organisations: the Bonn PRINTEGER Statement", Science and Engineering Ethics 24 (4), pp 1023−1034.
Sutrop, M. (2020). Challenges of Aligning Artificial Intelligence with Human Values. Acta Baltica Historiae et Philosophiae Scientiarum, 8 (2), 54−72. DOI: 10.11590/abhps.2020.2.04.
Sutrop, M. (2020). Deep conceptual moral disagreements: Over what do we disagree and why? Trames Journal of the Humanities and Social Sciences, 24 (3), 295−314. DOI: 10.3176/tr.2020.3.03.
Sutrop, M; Simm, K (2020). Developing guidelines for the distribution of scarce medical resources during the COVID-19 pandemic. The Estonian case. Trames Journal of the Humanities and Social Sciences, 24 (2), 251−268. DOI: 10.3176/tr.2020.2.08.
Sutrop, M., Simm, K. (2021). Eetilised valikud COVID-19 pandeemia tingimustes. (Ethical choices in COVID-19 pandemic, in Estonian). Mäetagused, 5−18. DOI: 10.7592/MT2021.81.sutrop_simm.
Lõuk, K., Sutrop, M. (2022). Teaduseetika. Praktilise eetika käsiraamat. koost. K. Simm. TÜ kirjastus [ilmumas].
Sutrop, M.; Lõuk, K. (2022). Ethical research in a global context: A dynamic tension between universal values, principles and contextual applications. In: Iphofen, R. and O’Mathúna, D (Ed.). Ethical Evidence and Policymaking: Interdisciplinary and International Research. Policy Press/Bristol University Press [ilmumas].
Parder, M.-L.; Juurik, M.; Lõuk, K.; Velbaum, K.; Simm, K.; Sutrop, M. (2022). Development and Implementation of a National Research Integrity System. The Case of the Estonian Code of Conduct for Research Integrity. In: Joel Faintuch (Ed.). Integrity of Scientific Research: Fraud, misconduct and fake news in the academic, medical and social environment. Springer, pp 573–584.