From Wikipedia, the free encyclopedia
E3 ubikvitin-proteinski ligazni rififilin je enzim koji je kod ljudi kodiran genom RFFL.[5][6]
Dužina polipeptidnog lanca je 363 aminokiseline, a molekulska težina 40.514.[7].
Coumailleau et al. (2004) otkrili su da se Rffl-GFP lokalizirao na globulskim strukturama u perijedarnoj regiji. Koekspresija Rffl-GFP raznim endosomnim markerima, pokazala je da Rffl pozitivne strukture pripadaju odjeljku za endocitnu reciklažu (ERC). Morfološka analiza HeLa ćelija koje prekomjerno eksprimiraju Rffl otkrila je agregaciju tubula pozitivnih na perijedarni transferin. Eksperimenti pulsiranja pokazali su da je prekomjerna ekspresija Rffl značajno usporila recikliranje od ERC-a do plazmamembrane. Eksperimenti s delecijskim mutantima pokazali su da je Rffl N-terminalni FYVE domen neophodsn i dovoljsn za ciljanje Rffl na ERC i za inhibiranje reciklaže transferina. Suprotno tome, C-terminalni domena cinkovog prsta neophodan je za efekt posredovan prekomernom ekspresijom Rffl na recikliranju endosoma. Upotrebom inhibitora fosfatidilinozitol 3-kinaza, Coumailleau et al. (2004) otkrili su da Rffl djeluje uglavnom na putu neovisnom o PIK3.[8]
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MWATCCNWFC | LDGQPEEVPP | PQGARMQAYS | NPGYSSFPSP | TGLEPSCKSC | ||||
GAHFANTARK | QTCLDCKKNF | CMTCSSQVGN | GPRLCLLCQR | FRATAFQREE | ||||
LMKMKVKDLR | DYLSLHDIST | EMCREKEELV | LLVLGQQPVI | SQEDRTRAST | ||||
LSPDFPEQQA | FLTQPHSSMV | PPTSPNLPSS | SAQATSVPPA | QVQENQQANG | ||||
HVSQDQEEPV | YLESVARVPA | EDETQSIDSE | DSFVPGRRAS | LSDLTDLEDI | ||||
EGLTVRQLKE | ILARNFVNYK | GCCEKWELME | RVTRLYKDQK | GLQHLVSGAE | ||||
DQNGGAVPSG | LEENLCKICM | DSPIDCVLLE | CGHMVTCTKC | GKRMNECPIC | ||||
RQYVIRAVHV | FRS |
Pretragom baze podataka EST, Coumailleau et al. (2004) identificirali su i zatim klonirali rififilin (prstenasti protein i FYVE-sličan domen) iz cDNK mišjeg testisa. Mišija Rffl cDNK kodira dva proteina od 336 i 364 aminokiseline, generirane alternativnom preradom. N-terminalno područje sadrži domen povezan s domenom FYVE dvostrukog cinkovog prsta, koji posreduje u vezanju za fosfatidilinozitol 3-fosfat (PIK3), a C-terminalna regija sadrži konsenzusnu sekvencu za C3HC4 RING prstnu domenu. Analiza Northern blot-a otkrila je sveprisutno izraženi transkript od približno četiri kb i manji od oko dvije kb na vrlo visokom nivou ekspresije u testisima i na umjerenom nivou u jetri. RT-PCR je pokazao da su oba proteina posvuda eksprimirani, s većom izoformom koja se gotovo isključivo eksprimira u ćelijama i bubrezima odraslih miševa i u HeLa ćelijama.
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.