PAX3
From Wikipedia, the free encyclopedia
From Wikipedia, the free encyclopedia
PAX3 (gen 3 uparene kuitije) jest gen koji se kod ljudi balazi na hromosomu 2. Kodira člana uparene kutije ili porodice PAX transkripcijskih faktora.[5] Porodica PAX sastoji se od devet ljudskih (PAX1-PAX9) i devet mišjih (Pax1-Pax9) članova raspoređenih u četiri potporodice. Ljudski PAX3 i mišji Pax3 prisutni su u podporodici zajedno sa visoko homolognim ljudskim PAX7 i mišjim Pax7 genima. Ljudski PAX3 gen nalazi se u hromozomskoj regiji 2q36.1 i sadrži 10 egzona unutar 100 kb regiona.
Alternativna prerafa i obrada generira višestruke PAX3 izoforme koje su otkrivene na nivou iRNK.[6] PAX3e je najduža izoforma i sastoji se od 10 egzona koji kodiraju protein od 505 aminokiselina. Kod drugih vrsta sisara, uključujući miša, najduže iRNK odgovaraju izoformama PAX3c i PAX3d čovjeka, koje se sastoje od prvih osam ili devet egzona gena PAX3. Kraće PAX3 izoforme uključuju iRNK koje preskaču egzon 8 (PAX3g i PAX3h) i iRNK koje sadrže četiri ili pet egzona (PAX3a i PAX3b). U ograničenim studijama koje upoređuju ekspresiju izoforme, PAX3d je izražen na najvišim nivoima. ]Sa funkcionalnog stanovišta, PAX3c, PAX3d i PAX3h stimulišu aktivnosti kao što je rast ćelija, dok PAX3e i PAX3g inhibiraju ove aktivnosti, a PAX3a i PAX3b ne pokazuju nikakvu aktivnost ili inhibiraju ove krajnje tačke.
Uobičajea [[alternativna prerada koja utiče na PAX3 iRNK uključuje sekvencu CAG na 5' kraju egzona 3.[7] Ovaprerada ili uključuje ili isključuje ove tri baze, što rezultira prisustvom ili odsustvom glutamin]skih ostataka u motivu uparene kutije. Ograničene studije sekvenciranja ljudskih cDNK pune dužine identificirale su ovaj događaj prerade kao varijantu izoforme PAX3d, a ova prerašđena izoforma je odvojeno nazvana PAX3i izoforma. Q+ i Q- izoforme PAX3 općenitoo se koeksprimiraju u ćelijama. Na funkcionalnom nivou, Q+ izoforma pokazuje slično ili manje vezivanje DNK i aktivaciju transkripcije od Q- izoforme.
Dužina polipeptidnog lanca je 479 aminokiselina, a molekulska težina 52.968 Da.[8]
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MTTLAGAVPR | MMRPGPGQNY | PRSGFPLEVS | TPLGQGRVNQ | LGGVFINGRP | ||||
LPNHIRHKIV | EMAHHGIRPC | VISRQLRVSH | GCVSKILCRY | QETGSIRPGA | ||||
IGGSKPKQVT | TPDVEKKIEE | YKRENPGMFS | WEIRDKLLKD | AVCDRNTVPS | ||||
VSSISRILRS | KFGKGEEEEA | DLERKEAEES | EKKAKHSIDG | ILSERASAPQ | ||||
SDEGSDIDSE | PDLPLKRKQR | RSRTTFTAEQ | LEELERAFER | THYPDIYTRE | ||||
ELAQRAKLTE | ARVQVWFSNR | RARWRKQAGA | NQLMAFNHLI | PGGFPPTAMP | ||||
TLPTYQLSET | SYQPTSIPQA | VSDPSSTVHR | PQPLPPSTVH | QSTIPSNPDS | ||||
SSAYCLPSTR | HGFSSYTDSF | VPPSGPSNPM | NPTIGNGLSP | QVMGLLTNHG | ||||
GVPHQPQTDY | ALSPLTGGLE | PTTTVSASCS | QRLDHMKSLD | SLPTSQSYCP | ||||
PTYSTTGYSM | DPVTGYQYGQ | YGQSKPWTF |
PAX3 kodira faktor transkripcije sa N-terminalnim DNK vezujućim domenom- koji se sastoji od uparene kutije (PD) kodiranog egzonima 2, 3 i 4, i oktapeptida i kompletnog homeodomena (HD) kodiranpg egzonima 5 i 6.[9] Pored toga, PAX3 protein ima domen transkripcijske aktivacije C-terminala kodiran egzonima 7 i 8. Visoko konzervirani PD sastoji se od regiona od 128 aminokiselina koji se vezuje za DNK sekvence povezane sa TCACGC/G motivom.[10] HD motiv se obično sastoji od 60 aminokiselina i veže se za sekvence koje sadrže motiv jezgra TAAT.[11] The combination of these two DNA binding domains enable the PAX3 protein to recognize longer sequences containing PD and HD binding sites.[12] U C-terminalu PAX3, nalazi se regija bogata prolinom, serinom i treoninom (PST) koja mjeri 78 aminokiselina i stimulira transkripcijsku aktivnost..[13] Postoje i domeni represije transkripcije u HD i N-terminalnom regionu (uključujući prvu polovinu PD), koji potiskuju domen C-terminalne transkripcione aktivacije.[14]
PAX3 funkcionira kao aktivator transkripcije za većinu ciljnih gena, ali također može potisnuti manji podskup ciljnih gena.[15] Ove promene ekspresije se vrše vezivanjem PAX3 za specifična mesta prepoznavanja, koja se nalaze na različitim genomskim lokacijama.[16]
Tabeta 1: Reprezentativni PAX3 transkripcijski ciljni geni
Proteinska kategoroja | Naziv | Fenotipska aktivnost |
Molekula ćelijske adhezije | NRCAM | Međućelijka adhezija |
Hemokinski receptor | CXCR4 | Pokretljivost |
Receptor tirozin-kinaza | FGFR4 | Proliferacija, diferencijacija, migracija |
MET | Proliferacija, migracija, preživljavanje | |
RET | Prolifercija, migracija, diferecijacija | |
Transkripcijsi faktor | MITF | Diferencijacija, proliferacija, preživljavanje |
MYF5 | Diferencijacija | |
MYOD1 | Diferencijacija |
invalid-indicator-name
![]() |
{{{tekst}}} |
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.