From Wikipedia, the free encyclopedia
HHIP-oliki protein 1 (HHIPL1), znan i kao HHIP2, je protein koji je kod ljudi kodiran genom HHIPL1 na hromosomu 14.[5] Nije značajno eksprimiran u mnogim tipovima tkiva i ćelija, [6] iako je HHIPL1-ova iRNK otkrivena u ćelijama koštanih trabekula.[7] Little is known about the precise biological function of HHIPL1, but the protein has been linked to adenomas.[8] Gen HHIPL1 također sadrži jedan od 27 jednonukleotidnih polimorfizama povezanih sa povećanim rizikom od bolesti koronarnih arterija.[9]
HHIPL1 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
Aliasi | HHIPL1 | ||||||||||||||||||||||||
Vanjski ID-jevi | MGI: 1919265 HomoloGene: 81985 GeneCards: HHIPL1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
Lokacija (UCSC) | Chr 14: 99.65 – 99.68 Mb | Chr 12: 108.27 – 108.3 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
|
Dužina polipeptidnog lanca je 782 aminokiseline, a molekulska težina 86.731 Da.
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MARARAGALL | ALWVLGAAAH | PQCLDFRPPF | RPTQPLRLCA | QYSDFGCCDE | ||||
GRDAELTRRF | WALASRVDAA | EWAACAGYAR | DLLCQECSPY | AAHLYDAEDP | ||||
FTPLRTVPGL | CQDYCLDMWH | KCRGLFRHLS | TDQELWALEG | NLARFCRYLS | ||||
LDDTDYCFPY | LLVNKNLNSN | LGHVVADAKG | CLQLCLEEVA | NGLRNPVAMV | ||||
HARDGTHRFF | VAEQVGLVWA | YLPDRSRLGK | PFLNISRVVL | TSPWEGDERG | ||||
FLGIAFHPSF | QHNRRLYVYY | SVGIRSSEWI | RISEFRVSED | DENAVDHSSE | ||||
RIILEVKEPA | SNHNGGQLLF | GDDGYLYIFT | GDGGMAGDPF | GTFGNAQNKS | ||||
ALLGKVLRID | VDRKERGLPY | GIPPDNPFVG | DPAAQPEVYA | LGVRNMWRCS | ||||
FDRGDPSSGT | GRGRLFCGDV | GQNKFEEVDV | VERGGNYGWR | AREGFECYDR | ||||
SLCANTSLND | LLPIFAYPHT | VGKSVTGGYV | YRGCEYPNLN | GLYIFGDFMS | ||||
GRLMSLQENP | GTGQWQYSEI | CMGHGQTCEF | PGLINNYYPY | IISFGEDEAG | ||||
ELYFMSTGEP | SATAPRGVVY | KIIDASRRAP | PGKCQIQPAQ | VKIRSRLIPF | ||||
VPKEKFIPKT | RSTPRPTARA | PTRAPRRGRP | TAAPPAPTPR | PARPTQQPGS | ||||
RRGGGRRRGR | LNSASRAFRD | GEVRLVRPAG | LSSGSGRVEV | FVGGRWGTVC | ||||
DDSWNISGAA | VVCRQLGFAY | AVRAVKRAEF | GQGGSLPILL | DDVRCAGWER | ||||
NLLECQHNGV | GTHNCEHDED | AGVVCSHQNP | DL |
Gen HHIPL1 nalazi se na hromosomu 14 na pojasu 14q32 i sadrži 13 egzona.[5] Ovaj gen proizvodi dvije izoforme putem alternativne prerade.[10]
Ovaj protein pripada porodici HHIP i jedan je od tri njena člana pronađena kod ljudi.[10] HHIPL1 sadrži SRCR proteinski domen i N-krajev signalni peptid.[7][10] Obrada signalnog peptida dovodi do sekrecije ovog proteina. Kao član HHIP-a, sadrži i konzervirani HHIP-homologni (HIPH) domen, koji se sastoji od 18 cisteinskih ostataka.[7]
Funkcija HHIPL1 nije poznata. Sljedeći odjeljak odnosi se na funkciju HHIP-a.
Funkcija HHIP-a nije dobro poznata, ali se pokazalo da je usko povezana s funkcijom pluća. Izbacivanje HHIP-a kod miševa je neonatusno smrtonosno, zbog neispravnog grananja u plućima.[11][12] Pokazalo se da heterozigotni nokaut HHIP-a doprinosi težim emfizemima induciranim cigaretnim dimom, u poređenju sa miševima divljeg tipa.[13] Nadalje, u plućima heterozigotnih miševa, pronađen je povećani spontani emfizem i oksidativni stres.[14] I nivo ekspresije i pojačavačka aktivnost HHIP smanjena je u hroničnoj opstruktivnoj plućnnoj bolesti (COPD), što ukazuje na zaštitnu ulogu HHIP-a u patogenezi HOBP-a.[15]
Studije povezanosti genoma identificirale su hromosomaku regiju 14q32 kao mjesto za oboljenje koronarnih arterija. Varijante povezane s bolešću spadaju pod kontrolu do sada neokarakteriziranog gena HHIPL1 , a koji kodira homolog sekvence antagonista ježeve signalizacije. Funkcija HHIPL1 i njegova uloga u aterosklerozi nisu poznati. Ispitana je ćelijska lokalizacija HHIPL1, interakcija sa zvučnim SHH i utjecaj na signalizaciju ježa. Ekspresija HHIPL1 izmjerena je ljudskimim ćelijama bitnim za bolest koronarnih arterija, a lokalizacija proteina procijenjena je kod miševa divljeg tipa i Apoe –/– (s nedostatkom apolipoproteina E). Fenotipovi ćelija glatkih mišića ljudske aorte i signalizacija ježa istraženi su nakon nokdauna gena. Generirani su miševi Hhipl1 –/–i prikupljene su ćelije glatkih mišića aorte za fenotipsku analizu i procjenu signalne aktivnosti ježa. Miševi Hhipl1 –/–uzgajani su i na Apoe –/–i na Ldlr –/– (nokaut sojevima s nedostatkom lipoproteinskih receptora), a opseg ateroskleroze je kvantificiran nakon 12 sedmica prehrane s puno masti. sastav i sadržaj kolagena u aortnim plakovima procijenjeni su imunohistohemijom.
Rezultati in vitro analize otkrili su da je HHIPL1 izlučeni protein koji stupa u interakciju sa SHH i povećava signalnu aktivnost ježnog proteina. Ekspresija HHIPL1 otkrivena je u ljudskim ćelijama glatkih mišića i glatkim mišićima unutar aterosklerotičnih plakova miševa Apoe –/–. Ekspresija Hhipl1 povećavala se s napredovanjem bolesti u korijenima aorte miševa Apoe –/–. Proliferacija i migracija smanjene su u nokaut-mišića Hhipl1 i nokauntnih ćelija aorte HHIPL1, a u ćelijama s nedostatkom HHIPL1-a smanjena je signalizacija ježa. [Nokaut Hhipl1 uzrokovao je smanjenje > 50% tereta ateroskleroze i na apoe –/– i na Ldlr –/– pozadini nokauta, a lezije su karakterizirane smanjenim sadržajem glatkih mišićnih ćelija.[16] Zaključeno je da je HHIPL1 izlučeni proaterogeni protein koji pojačava ježevu signalizaciju i regulira proliferaciju i migraciju ćelija glatkih mišića. Inhibicija funkcije proteina HHIPL1 mogla bi ponuditi novu terapijsku strategiju za bolest koronarnih arterija.
Metilacija DNK jedna je od nekoliko epigenetičkih modifikacija prepoznatih kao obilježja tumorigeneze. U istraživanju genoma specifičnih za podtip specifičnih epigenomnih promjena u adenomu, gen HHIPL1 bio je hipermetiliran u 12 od 13 nefunkcionalnih (NF) adenoma, kao i u adenomima koji luče hormon rasta (GH) i prolektin. Prema tome, HHIPL1 može poslužiti kao biomarker za predviđanje ili karakterizaciju tumorskih obrazaca rasta.[8] Za razliku od drugog člana ljudske porodice gena HHIP, HHIP, koji se smatra farmakogenomskim ciljem na poljima onkologije i vaskularne medicine, HHIPL1 još nije prijavljen s takvim potencijalom.[7]
Pored toga, u kardiovaskularno oblasti, HHIPL1 je povezan s CAD u Evropljana, Južnoazijata i populacije Japanaca.[17][18] However, in another study based on a Japanese population, the association failed to be replicated, suggesting that this association is population-specific.[19]
Studija rezultata procjene genetičkog rizika sa više lokusa, zasnovana na kombinaciji 27 lokusa, uključujući gen HHIFL1, identificirala je osobe s povećanim rizikom za incidente i ponavljajuće događaje bolesti koronarnih arterija, kao i povećanu kliničku korist od terapije statinima. Studija se temeljila na zajedničkoj kohortnoj studiji (studija Malmo Diet and Cancer) i četiri dodatna randomizirana kontrolirana ispitivanja kohorti primarne prevencije (JUPITER i ASCOT) i kohorti sekundarne prevencije (CARE and PROVE IT-TIMI 22).[9]
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.