From Wikipedia, the free encyclopedia
Vaskulin jest protein koji je kod ljudi kodiran genom GPBP1 sa hromosoma 5.[5][6]
Dužina polipeptidnog lanca je 473 aminokiseline, а molekulska težina 53.339 Da.[7]
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAQHDFAPAW | LNFPTPPSST | KSSLNFEKHS | ENFAWTENRY | DVNRRRHNSS | ||||
DGFDSAIGRP | NGGNFGRKEK | NGWRTHGRNG | TENINHRGGY | HGGSSRSRSS | ||||
IFHAGKSQGL | HENNIPDNET | GRKEDKRERK | QFEAEDFPSL | NPEYEREPNH | ||||
NKSLAAGVWE | YPPNPKSRAP | RMLVIKKGNT | KDLQLSGFPV | VGNLPSQPVK | ||||
NGTGPSVYKG | LVPKPAAPPT | KPTQWKSQTK | ENKVGTSFPH | ESTFGVGNFN | ||||
AFKSTAKNFS | PSTNSVKECN | RSNSSSPVDK | LNQQPRLTKL | TRMRTDKKSE | ||||
FLKALKRDRV | EEEHEDESRA | GSEKDDDSFN | LHNSNSTHQE | RDINRNFDEN | ||||
EIPQENGNAS | VISQQIIRSS | TFPQTDVLSS | SLEAEHRLLK | EMGWQEDSEN | ||||
DETCAPLTED | EMREFQVISE | QLQKNGLRKN | GILKNGLICD | FKFGPWKNST | ||||
FKPTTENDDT | ETSSSDTSDD | DDV |
Nedavna analiza supresivne suptraktivne hibridizacije na ljudskoj RNK izvedenoj iz aterosklerotskih plakova otkrila je gene povećane regulacije u plakovima s trombom u odnosu na stabilne plakove. Klon SSH6, koji sadrži dio navodno otvorenog okvira čitanja nepoznatog proteina, dodatno je istražen. cDNK pune dužine, koja kodira protein od 473-aminokiselina (aa), identificirana je u biblioteci cDNK vaskularnih ćelija glatkih mišića (SMC). Bioinformatička pretraga sugerirala je prisustvo više varijanti SSH6 zbog alternativne prerade egzona 3.[5]
Analiza više tkiva Northern blotom pokazala je različit obrazac ekspresije ovih varijanti, jer je sveprisutno izražena SSH6 iRNK kojoj nedostaje egzon 3, otkrivena i van navodnog vaskularnog SMC-specifičnog oblika koji sadrži egzon 3. Western blot analiza pokazala je sveprisutni protein od 35 kDa (SSH6-beta), pored proteina od 45 kDa (vaskulin), otkrivenog u vaskularnom zidu i plazmi. Analiza arterija koje pokazuju različite faze ateroskleroze pokazala je da se omjer vaskulin/SSH6-beta povećava tokom aterogeneze. Imunohistokemijska pretraga pokazala je citoplazmatsku ekspresiju produkata gena SSH6 u makrofagima, endotelnim ćelijama i SMC-ima. Ukratko, identificirna je novua IRNK/protein, vaskulin, u arterijskom zidu i plazmi. Regulirana ekspresija vaskulina u plakovima ukazuje na ulogu u aterogenezi. Štaviše, njegovo prisustvo u plazmi otvara perspektive za vaskulin kao marker za aterosklerozu.[5]
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.