GATD3A

Mitohondrijski glutamin-amidopeptizoliki protein 3A klase 1 sa domenom jest protein koji je kod ljudi kodiran genom GATD3A sa hromosoma 21.^[5][6]

GATD3A
Identifikatori
Aliasi	GATD3
Vanjski ID-jevi	OMIM: 601659 MGI: 1351861 HomoloGene: 3416 GeneCards: GATD3
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 21 (čovjek)[1] Bend 21q22.3 Početak 44,133,610 bp[1] Kraj 44,210,114 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 10 (miš)[2] Bend 10 C1|10 39.72 cM Početak 77,997,900 bp[2] Kraj 78,005,616 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	8209	28295
Ensembl	ENSG00000160221	ENSMUSG00000053329
UniProt	F2Z2Q0 H7C1F6	Q9D172
RefSeq (mRNK)	NM_004649 NM_198155 NM_001320383 NM_001320384	NM_138601 NM_001364646
RefSeq (bjelančevina)	NP_001307312 NP_001307313 NP_004640 NP_937798 NP_001350687 NP_001350689 NP_001350690	NP_613067 NP_001351575
Lokacija (UCSC)	Chr 21: 44.13 – 44.21 Mb	Chr 10: 78 – 78.01 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Iako peptidima koji ciljaju mitohondrije nedostaje zajednička konsenzusna sekvenca, nedavno je pronađena određena pristranost u pozicijskoj distribuciji aminokiselina. Ovi obrasci povezani su sa cijepanjem proteinskog prekursora proteazama za obradu matriksa. Pronađni su novi motivi sekvenci koji su konzevirani unutar podgrupa mitohondrijalnih ciljanih peptida. Ovi motivi imaju određene zajedničke teme, što ukazuje da su povezani s cijepanjem jedne proteaze. Dva od konzerviranih obrazaca imaju visoku prediktivnu vrijednost, ali čak i za sekvence koje nemaju ove obrasce, pokazalo se da je moguće prilično precizno predviđanje mjesta cijepanja. Također predlaženo je da se dobro konzervirani obrazac smanjenja RXY (S/A) može koristiti za projektovanje efikasno prepoznatih mjesta cijepanja u necijepljene ili umjetne mitohondrijske ciljane peptide.^[7]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 268 aminokiselina, a molekulska težina 28.170 Da.^[7]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MAAVRVLVAS		RLAAASAFTS		LSPGGRTPSQ		RAALHLSVPR		PAARVALVLS
GCGVYDGTEI		HEASAILVHL		SRGGAEVQIF		APDVPQMHVI		DHTKGQPSEG
ESRNVLTESA		RIARGKITDL		ANLSAANHDA		AIFPGGFGAA		KNLSTFAVDG
KDCKVNKEVE		RVLKEFHQAG		KPIGLCCIAP		VLAAKVLRGV		EVTVGHEQEE
GGKWPYAGTA		EAIKALGAKH		CVKEVVEAHV		DQKNKVVTTP		AFMCETALHY
IHDGIGAMVR		KVLELTGK

Također pogledajte

• Glutamin-amidotransferaza