U molekulskoj biologiji domaćinski geni su tipski konstitutivni gen koji su potrebni za održavanje osnovne ćelijske funkcije i ekspresije u svim ćelijama organizama u normalnim i pato-fiziološkim uvjetima.[1][2][3][4] Iako se neki geni za „održavanje domaćinstva“ eksprimiraju relativno konstantno u većini nepatoloških situacija, ekspresija drugih domaćinskih gena može varirati ovisno o eksperimentalnim uvjetima.[1][5]
Porijeklo izraza "gen za održavanje domaćinstva" (domaćinski gen) ostaje nejasno. Literatura iz 1976. koristila je ovaj termin za opisivanje tRNK i rRNK.[6] U eksperimentalne svrhe, ekspresija jednog ili više domaćinskih gena koristi se kao referentna tačka za analizu nivoa ekspresije drugih gena. Ključni kriterij za upotrebu takvih gena na ovaj način je da je odabrani domaćinski gen jednoliko eksprimiran, s malom varijancom i u kontrolnim i u eksperimentalnim uvjetima. Valjaciju domaćinskih gena treba poznavati prije njihove upotrebe u eksperimentima ekspresije gena, poput RT-PCR. Nedavno su web-baze podataka i human[mrtav link] i mouse Arhivirano 6. 11. 2020. na Wayback Machine domaćinski i referentni geni/transkripti, zvani Housekeeping and Reference Transcript Atlas Arhivirano 18. 5. 2021. na Wayback Machine (HRT Atlas), was developed to offer updated list of housekeeping genes and reliable candidate reference genes/transcripts for RT-qPCR data normalization.[1] Ovoj bazi podataka može se pristupiti na adresi http://www.housekeeping.unicamp.br Arhivirano 18. 5. 2021. na Wayback Machine.
Domaćinski geni čine većinu aktivnih gena u genomu, a njihova ekspresija je očito vitalna za preživljavanje. Nivo ekspresije domaćinskih gena fino je podešen, kako bi zadovoljio metaboličke zahtjeve u različitim tkivima. Biohemijske studije o transkripciji) inicijaciji promotora domaćinskog gena bile su teške, dijelom zbog manje karakteriziranih promotorskih motiva i procesa iniciranja transkripcije.
Promotori domaćinskih gena općenito su osiromašeni TATA-kutijama, imaju visok sadržaj GC-a i visoku učestalost CpG-otoka.[7] U rodu Drosophila, gdje promotor nema specifičnih CpG-otoka, promotori domaćinskih gena sadrže elemente DNK kao što su DRE, E-kutija ili DPE.[8] Mjesta početka transkripcije domaćinskih gena mogu se prostirati na području od oko 100 bp, dok su mjesta početka transkripcije razvojno reguliranih gena obično fokusirana na usko područje.[9][10][11] Malo se zna o tome kako je uspostavljena inicijacija disperzirane transkripcije domaćinskih gena. Postoje transkripcijski faktori koji su posebno obogaćeni i reguliraju promotore domaćinskih gena.[12][13] Nadalje, njihove promotore reguliraju poslovi pojačivače, ali ne i razvojno regulirani pojačivači.[14]
Slijedi djelimična lista "domaćinskih gena". Za potpuniji i ažurirani popis, pogledajte HRT Atlas database Arhivirano 18. 5. 2021. na Wayback Machine koji su kompilirali Bidossessi W. Hounkpe et al. Baza podataka izgrađena je rudarenjem više od 12.000 skupova podataka RNK-seq podataka za ljude i miševe.
Ekspresija gena
Faktori transkripcije
- ATF1: NM_005171
- ATF2: NM_001880
- ATF4:[2][15] Aktivirajući transkripcijski faktor 4 NM_001675
- ATF6: NM_007348
- ATF7: NM_001206682
- ATF7IP: NM_018179
- BTF3:[2][15] NM_001207 Ljudski osnovni transkripcijski faktor 3
- E2F4:[2] Ljudski transkripcijski faktor 4 E2F, p107/p130-vezanje (E2F4), iRNK
- ERH:[2][15] Pojačivač rudimentnog homologa Drospohila (što je opet prvi enzimski korak u sintezi pirimidina. Regulira MITF.)
- HMGB1:[2][15] Grupa visoke pokretljivost i koja veže DNK
- ILF2:[2] faktor vezivanja pojačivača interleukina 2 kod Homo sapiens, 45kDa (ILF2), iRNK
- IER2:[2] ranije ETR101, neposredni rani protein?
- JUND:[2][15] jun D protoonkogen Homo sapiens (JUND), iRNK
- TCEB2:[2][15]
Represori
Preradni
Faktori translacije
- EIF1:[2][15] SUI1
- EIF1AD
- EIF1B
- EIF2A
- EIF2AK1
- EIF2AK3
- EIF2AK4
- EIF2AK1
- EIF2B2
- EIF2B3
- EIF2B4
- EIF2S2
- EIF3A
- EIF3B
- EIF3D:[2] Bivši EIF3S4
- EIF3G
- EIF3I
- EIF3H
- EIF3J
- EIF3K
- EIF3L
- EIF3M
- EIF3S5
- EIF3S8
- EIF4A1
- EIF4A2[2]
- EIF4A3
- EIF4E2
- EIF4G1
- EIF4G2[2]
- EIF4G3
- EIF4H
- EIF5
- EIF5
- EIF5A
- EIF5AL1
- EIF5B
- EIF6
- TUFM:[2] Mitohondrijski Tu translacijski faktor elongacije
Sinteza tRNK
- AARS: NM_001605 alanil-tRNK sintetaza
- AARS2: NM_020745 mitohondrijska alanil-tRNK sintetaza 2,
- AARSD1: NM_001261434 domen alanil-tRNK sintetaze koji sadrži protein 1
- CARS: NM_001751 cisteinil-tRNA sintetaza
- CARS2: NM_024537 mitohondrijska (navodno) cisteinil-tRNK sintetaza 2
- DARS: NM_001349 aspartil-tRNK sintetaza
- DARS2: NM_018122 mitohondrijska aspartil-tRNK sintetaza 2
- EARS2: NM_001083614 mitohondrijska glutamil-tRNA sintetaza 2
- FARS2: NM_006567 mitohondrijska fenilalanil-tRNK sintetaza 2
- FARSA: NM_004461 alfa podjedinica fenilalanil-tRNK sintetaze
- FARSB: NM_005687 beta podjedinica fenilalanil-tRNK sintetaze
- GARS: NM_002047 glicil-tRNK sintetaza
- HARS: NM_002109 histidil-tRNK sintetaza
- HARS2: NM_012208 mitohondrijska histidil-tRNK sintetaza 2
- IARS: NM_002161 izoleucil-tRNK sintetaza
- IARS2: NM_018060 mitohondrijska izoleucil-tRNA sintetaza 2
- KARS: NM_005548 lizil-tRNK sintetaza (KARS), iRNK Homo sapiens
- LARS2: NM_015340 mitohondrijska izoleucil-tRNK sintetaza 2
- MARS: NM_004990 metionil-tRNA sintetaza
- MARS2: NM_138395 mitohondrijska metionil-tRNA sintetaza 2
- NARS: NM_004539 asparaginil-tRNA sintetaza
- NARS2: NM_024678 mitohondrijska (navodno)asparaginil-tRNA sintetaza 2
- QARS: NM_005051 glutaminil-tRNK sintetaza
- RARS: NM_002884 arginil-tRNK sintetaza
- RARS2: NM_020320 mitohondrijska arginil-tRNK sintetaza 2
- SARS NM_006513 Ljudska sery+il-tRNK sintetaza (SARS), iRNK
- TARS: NM_152295 treonil-tRNK sintetaza
- VARS2: NM_020442 mitohondrijska valil-tRNA sintetaza 2
- WARS2: NM_015836 mitohondrijska triptofanil tRNA sintetaza 2
- YARS: NM_003680 tirozil-tRNA sintetaza (YARS), iRNK Homo sapiens
- YARS2: NM_001040436, ljudska tirozil-tRNK-sintetaza (YARS), mitohondrijska iRNK
RNK-vezujići protein
- ELAVL1:[2]
Ribosomni proteini
- RPL5:[2][15]
- RPL8:[2]
- RPL9:[15]
- RPL10A
- RPL11[2]
- RPL14[2][15]
- RPL25[15]
- RPL26L1
- RPL27[2]
- RPL30[15]
- RPL32[2]
- RPL34[2]
- RPL35[2][15]
- RPL35A
- RPL36AL
- RPS5[15]
- RPS6
- RPS6KA3
- RPS6KB1
- RPS6KB2
- RPS13[2][15]
RPS19BP1
- RPS20[15]
- RPS23[15]
- RPS24[2]
- RPS27[15] Transkribiran ubikvitinom (vidi FAU (gen))
- RPN1[2][15] riboforin usidruje ribosom na hrapavi endoplazmatski retikulum
Proteini mitohondrijskih ribosoma
- MRPL9:[2][15]
- MRPL1
- MRPL10
- MRPL11
- MRPL12
- MRPL13
- MRPL14
- MRPL15
- MRPL16
- MRPL17
- MRPL18
- MRPL19
- MRPL2
- MRPL20
- MRPL21
- MRPL22
- MRPL23
- MRPL24
- MRPL27
- MRPL28
- MRPL3
- MRPL30
- MRPL32
- MRPL33
- MRPL35
- MRPL36
- MRPL37
- MRPL38
- MRPL4
- MRPL40
- MRPL41
- MRPL42
- MRPL43
- MRPL44
- MRPL45
- MRPL46
- MRPL47
- MRPL48
- MRPL49
- MRPL50
- MRPL51
- MRPL52
- MRPL53
- MRPL54
- MRPL55
- MRPL9
- MRPS10
- MRPS11
- MRPS12
- MRPS14
- MRPS15
- MRPS16
- MRPS17
- MRPS18A
- MRPS18B
- MRPS18C
- MRPS2
- MRPS21
- MRPS22
- MRPS23
- MRPS24
- MRPS25
- MRPS26
- MRPS27
- MRPS28
- MRPS30
- MRPS31
- MRPS33
- MRPS34
- MRPS35
- MRPS5
- MRPS6
- MRPS7
- MRPS9
RNK-polimeraza
Prerada proteina
- PPID: Peptidil-prolil cis-trans izomeraza D
- PPIE: Peptidil-prolil cis-trans izomeraza E
- PPIF: Peptidil-prolil cis-trans izomeraza F
- PPIG: Peptidil-prolil cis-trans izomeraza G
- PPIH:[17] Cyclophilin H
- CANX:[2][15] Kalneksin: Sklapanje glikoproteina unutar endoplazmatskog retikuluma
- CAPN1: Podjedinica kalpain
- CAPN7
- CAPNS1:[2][15] Podjedinica kalpain-proteaze subunit
- NACA:[2][15] Složeni alfa polipeptid povezan s novonastalim polipeptidom
- NACA2
- PFDN2: Prefoldin 2
- PFDN4: Prefoldin 4
- PFDN5: Prefoldin 5
- PFDN6: Prefoldin 6
- SNX2: Sortirajući neksin 2
- SNX3:[2] Sortirtirajući neksin 3
- SNX5: Sortiranje neksina 5
- SNX6: Sortiranje neksina 6
- SNX9: Sortiranje neksina 9
- SNX12: Sortiranje neksina 12
- SNX13: Sortiranje neksina 13
- SNX17:[15] Sortiranje neksina 17
- SNX18 Sortiranje neksina 18
- SNX19: Sortiranje neksina 19
- SNX25 Sortiranje neksina 25
- SSR1 : Translokon-asocirani protein TRAPA. Translokacija proteina u ER
- SSR2 :[2] Translokon-povezani protein TRAPB. Translokacija proteina u ER
- SSR3: TRAPG protein povezan sa translokonom. Translokacija proteina u ER
- SUMO1: Ciljanje proteina
- SUMO3: Ciljanje proteina
Proteini toplotnog šoka
Histon
- HIST1H2BC[2]
- H1FX
- H2AFV
- H2AFX
- H2AFY:[2] Potporodica histona 2
- H2AFZ:[2][15] neophodan za embriogenezu
Ćelijski ciklus
Postoji značajno preklapanje funkcija s obzirom na neke od ovih proteina. Konkretno, geni povezani s Rho-om važni su u jedarnoom prometu (tj. mitozi), kao i u pokretljivosti duž citoskeleta općenito. Ovi geni su od posebnog interesa za istraživanje raka.
- ARHGAP35
- ARHGAP5
- ARHGDIA[2][15]
- ARHGEF10L: Faktor izmjene rhoguanin nukleotida 10L
- ARHGEF11: Faktor izmjene roguanin nukleotida 11
- ARHGEF40: Faktor izmjene roguanin nukleotida 40
- ARHGEF7: Faktor izmjene roguanin nukleotida 7
- RAB10: NM_016131 Muške GTPaze Rab ključni su regulatori promerta unutaćelijske membrane, od stvaranja transportnih vezikula do njihove fuzije s membranama
- RAB11A: NM_004663
- RAB11B: NM_004218
- RAB14: NM_016322
- RAB18: NM_021252
- RAB1A: NM_004161 Ljudski RAB1A, član porodice onkogena RAS (RAB1A), iRNK
- RAB1B: NM_030981
- RAB21: NM_014999
- RAB22A: NM_020673
- RAB2A: NM_002858
- RAB2B: NM_001163380
- RAB3GAP1: NM_012233
- RAB3GAP2: NM_012414
- RAB40C: NM_021168
- RAB4A: NM_004578
- RAB5A: NM_004162
- RAB5B: NM_002865
- RAB5C: NM_004583
- RAB6A: NM_002868
- RAB7A: NM_004637
- RAB9A: NM_004251
- RABEP1: NM_004703
- RABEPK: NM_005833
- RABGEF1: NM_014504
- RABGGTA: NM_004581
- RABGGTB: NM_004582
- CENPB:[2] Centromerni protein B
- CTBP1:[2][15] Centromerni protein T
- CCNB1IP1: NM_021178 E3 ubikvitin-proteinska ligaza. Modulira nivo ciklina B i učestvuje u regulaciji progresije ćelijskog ciklusa kroz fazu G2
- CCNDBP1: NM_012142 Može negativno regulirati napredovanje ćelijskog ciklusa
- CCNG1: NM_004060 Može odigrati ulogu u regulaciji rasta
- CCNH: NM_001239 Uključen u kontrolu ćelijskog ciklusa i u transkripciju RNK pomoću RNK- polimeraze II. Njegova ekspresija i aktivnost su konstantni tokom ćelijskog ciklusa
- CCNK: NM_001099402 Regulatorna podjedinica ciklin-zavisnih kinaza koja posreduje u fosforilaciji velike podjedinice RNK-polimeraze II
- CCNL1: NM_020307 Transkripcijski regulator koji sudjeluje u reguliranju procesa prerade pre-iRNK
- CCNL2: NM_030937 Transkripcijski regulator koji sudjeluje u reguliranju procesa prerade pre-iRNK. Također modulira ekspresiju kritičnog apoptotskog faktora, što dovodi do ćelijske apoptoze
- CCNY: NM_145012 Pozitivna regulatorna podjedinica ciklin-zavisnih kinaza CDK14/PFTK1 i CDK16. Djeluje kao regulator ćelijskog ciklusa signalnog puta Wnt tokom G2/M faze
- PPP1CA: NM_002708 Proteinska fosfataza koja se povezuje s preko 200 regulatornih proteina i tvori visoko specifične holoenzime koji defosforiliraju stotine bioloških meta
- PPP1CC: NM_002710
- PPP1R10: NM_002714
- PPP1R11: NM_021959 Ljudski protein fosfataza 1, regulatorna (inhibitorna) podjedinica 11 (PPP1R11),
- PPP1R15B: NM_032833
- PPP1R37: NM_019121
- PPP1R7: NM_002712
- PPP1R8: NM_002713
- PPP2CA: NM_002715
- PPP2CB: NM_001009552
- PPP2R1A: NM_014225 [15] Negativni regulator rasta i ćelijskih dioba kod Homo sapiens protein-fosfataza 2 (bivša 2A), regulatorna podjedinica A (PR 65),
- PPP2R2A: NM_002717
- PPP2R2D: NM_018461
- PPP2R3C: NM_017917
- PPP2R4: NM_021131
- PPP2R5A: NM_006243
- PPP2R5B: NM_006244
- PPP2R5C: NM_002719
- PPP2R5D: NM_006245
- PPP2R5E: NM_006246
- PPP4C: NM_002720
- PPP4R1: NM_005134
- PPP4R2: NM_174907
- PPP5C: NM_174908
- PPP6C: NM_002721
- PPP6R2: NM_014678
- PPP6R3: NM_018312
- RAD1 homolog: Ljudska ribonukleaza/inhibitor angiogenina (RNH), iRNK
- RAD17: NM_002872 Neophodan za održivi [[ćelijski rast, održavanje hromosomske stabilnosti i aktivaciju kontrolne tačke zavisne od ATR-a, nakon oštećenja DNK
- RAD23B: NM_002873
- RAD50: NM_005732
- RAD51C: NM_002874
- IST1:[2][15] (nalazi se na centralnoj liniji za razdvajanje ćelija koje dijele)
Apoptoza
- DAD1:[2][15] Branitelj protiv ćelijske smrti
- DAP3:[2] Uključen u posredovanje ćelijske smrti izazvane interferonom-gama.
- DAXX:[2] Protein povezan sa smrću 6
Onkogeni
Popravak/replikacija DNK
Metabolizam
- PRKAG1:[2] Osjeća nivo energije i inaktivira HMGCoA reduktazu i acetil CoA karboksilazu
- PRKAA1: NM_006251 Katalitska podjedinica AMP-aktivirane protein-kinaze (AMPK), protein kinaznog senzora energije koja ima ključnu ulogu u regulaciji ćelijskog energetskog metabolizma
- PRKAB1: NM_006253 Ne-katalitska podjedinica AMP-aktivirane protein-kinaze (AMPK), protein kinazni senzor energije koja ima ključnu ulogu u regulaciji metabolizma ćelijske energije
- PRKACA: NM_002730 Fosforilizira veliki broj supstrata u citoplazmi i jedru.
- PRKAG1: NM_002733 Ljudske protein-kinaza, aktivirana AMP-om, nekatalitska podjedinica gama 1 (PRKAG1), iRNK
- PRKAR1A: NM_002734 Regulatorna podjedinica protein-kinaza zavisnih od cAMP, uključenih u cAMP signalizaciju u ćelijama
- PRKRIP1: NM_024653 Vezuje dvolančanu RNK. Inhibira aktivnost kinaze EIF2AK2 (po sličnosti).
Metabolizam ugljikohidrata
- ALDOA:[15]
- B3GALT6: NM_080605
- B4GALT3: NM_003779 UDP-Gal: Ljudska betaGlcNAc beta 1,4-galaktoziltransferaza, polipeptid 3
- B4GALT5: NM_004776
- B4GALT7: NM_007255
- GSK3A
- GSK3B
- TPI1[15]
- PGK1:[2][15][17][18] Fosfoglicerat kinaza
- PGAM5[15]
- ENOPH1: Enolazna fosfataza
- LDHA:[17] Laktat-dehidrogenaza
- TALDO1:[2][15] Transaldolaza u pentoznom šantu
- TSTA3:[2] Metabolizam manoze
Ciklus limunske kiseline
- SDHA:[2] NM_004168 Sukcinatna dehidrogenazna podjedinica A
- SDHAF2: NM_017841
- SDHB: NM_002973, Podjedinica proteina gvožđe-sumpor (IP) sukcinat dehidrogenaze (SDH) koja je uključena u kompleks II mitohondrijskog lanca transporta elektrona i odgovorna je za prijenos elektrona iz sukcinata u ubikinon (koenzim Q)
- SDHC: NM_003000 Podjedinica sukcinat dehidrogenaze (SDH) koja učvršćuje membranu i koja je uključena u kompleks II transportnog lanca elektrona mitohondrija i odgovorna je za prijenos elektrona iz sukcinata u ubikinon (koenzim Q).
- SDHD: NM_003001
Metabolizam lipida
Metabolizam aminokiselina
- COMT:[2] Katehol-O-metil-transferaza)
NADH dehidrogenaza
- NDUFA2: NM_002488[2]
- NDUFA3: NM_004542
- NDUFA4: NM_002489
- NDUFA5: NM_005000
- NDUFA6: NM_002490
- NDUFA7:[2] NM_005001 Ljudska NADH dehidrogenaza (ubikinon) 1 alfa potkompleks, 7, 14,5 kDa
- NDUFA8: NM_014222
- NDUFA9: NM_005002
- NDUFA10: NM_004544
- NDUFA11: NM_175614
- NDUFA12: NM_018838
- NDUFA13: NM_015965
- NDUFAF2: NM_174889
- NDUFAF3: NM_199069
- NDUFAF4: NM_014165
- NDUFB2: NM_004546
- NDUFB3: NM_002491
- NDUFB4: NM_004547
- NDUFB5: NM_002492
- NDUFB6: NM_002493
- NDUFB7:[2] NM_004146 Ljudska NADH dehidrogenaza (ubikinon) 1 beta potkompleks, 7, 18 kDa
- NDUFB10: NM_004548
- NDUFB11: NM_019056
- NDUFB8: NM_005004
- NDUFB9: NM_005005
- NDUFC1:[2] NM_ NADH Ljudska dehidrogenaza 002494 (ubikinon) 1, potkompleks nepoznat, 1, 6kDa
- NDUFC2: NM_004549
- NDUFC2-KCTD14: NM_001203260
- NDUFS5:[2]
- NDUFV2[2]
- NDUFS2: NM_004550
- NDUFS3: NM_004551
- NDUFS4: NM_002495
- NDUFS5: NM_004552 Ljudska NADH dehidrogenaza (ubikinon) Fe-S protein 5, 15kDa
- NDUFS6: NM_004553
- NDUFS7: NM_024407
- NDUFS8: NM_002496
- NDUFV1: NM_007103 Ljudska NADH dehidrogenaza (ubikinon) flavoprotein 1, 51 kDa (NDUFV1),
- NDUFV2: NM_021074 Ljudska NADH dehidrogenaza (ubikinon) flavoprotein 2, 24 kDa (NDUFV2),
Citohrom c oksidaza
(Imati na umu da su COX1, COX2 i COX3 mitohondrijski kodirani)
- COX4I1:[2] 001861
- COX5B:[2][15] NM_001862
- COX6B1:[2][15] NM_001863
- COX6C: NM_004374
- COX7A2: NM_001865 Ljudska citohrom c-oksidaza, podjedinica VIIa polipeptid 2 (jetra) (COX7A2),
- COX7A2L:[2] NM_004718
- COX7C:[2] NM_001867
- COX8:[2]
- COX8A: NM_004074 Ljudska citohrom c oksidazna podjedinica VIII (COX8) , kodiranje jedarnih gena
- COX11: NM_004375
- COX14: NM_032901
- COX15: NM_004376
- COX16: NM_016468
- COX19: NM_001031617
- COX20: NM_198076
- CYC1:[2] Ljudski citohrom c-1 (CYC1)
- UQCC: NM_018244 Potrebno za sastavljanje kompleksa ubikinol-citohrom c reduktaze (kompleks mitohondrijskog respiratornog lanca III ili kompleks citohroma b-c1)
- UQCR10: NM_013387
- UQCR11: NM_006830 Podjedinica ubikinol-citohrom c reduktaze (6,4 kD) (UQCR), iRNK Homo sapiens
- UQCRB: NM_006294
- UQCRC1: NM_003365 Ljudska ubikinol-citohrom c reduktazno jezgro proteina I (UQCRC1) iRNK
- UQCRC2: NM_003366
- UQCRHL: NM_001089591
- UQCRQ: NM_014402 Ljudski protein niskomolekulske mase koji veže ubikinon (9,5 kD) (QP-C), mRNA
ATPaza
- ATP2C1: NM_014382
Lizosom
Proteasom
- PSMA1: NM_002786
- PSMA2: NM_002787
- PSMA3: NM_002788
- PSMA4: NM_002789
- PSMA5: NM_002790
- PSMA6: NM_002791
- PSMA7: NM_002792 Ljudska proteasomska podjedinica, tip alfa, 7 (PSMA7),
- PSMB1: NM_002793 Ljudska proteasomska (prosom, makrobol) podjedinica, beta tip, 1 (PSMB1), iRNK
- PSMB2: NM_002794 Ljudska proteasomska (prosom, makrobol) podjedinics, beta tip, 2 (PSMB2), iRNK
- PSMB3: NM_002795
- PSMB4: NM_002796 Ljudska proteasomska (prosome, makropain) podjedinica, beta tip, 4 (PSMB4), mRNA
- PSMB5: NM_002797
- PSMB6: NM_002798
- PSMB7: NM_002799 Ljudska proteasomska (prosom, makropain) podjedinica, beta tip, 7 (PSMB7) [iRNK[]
- PSMC2: NM_002803
- PSMC3: NM_002804
- PSMC4: NM_006503
- PSMC5: NM_002805
- PSMC6: NM_002806
- PSMD1: NM_002807
- PSMD10: NM_002814
- PSMD11: NM_002815 Ljudska proteasomija (prozom, makropain) 26S podjedinica, ne-ATPaza 11
- PSMD12: NM_002816
- PSMD13: NM_002817
- PSMD14: NM_005805
- PSMD2: NM_002808
- PSMD3: NM_002809
- PSMD4: NM_002810
- PSMD5: NM_005047
- PSMD6: NM_014814
- PSMD7: NM_002811
- PSMD8: NM_002812 Ljudska proteasoma (prozom, makropain) 26S podjedinica, ne-ATPaza 8 (PSMD8),
- PSMD9: NM_002813
- PSME2: NM_002818 Ljudska proteasomska (prosome, makropain) podjedinica 2 (PA28 beta)
- PSME3: NM_005789
- PSMF1: NM_006814
- PSMG2: NM_020232
- PSMG3: NM_032302
- PSMG4: NM_001128591
- UBA1: NM_003334 Ljudski enzim E1 koji aktivira ubikvitin (temperatura A1S9T i BN75
- UBA2: NM_005499
- UBA3: NM_003968
- UBA5: NM_024818
- UBA52: NM_003333
- UBAC2: NM_177967
- UBALD1: NM_145253
- UBAP1: NM_016525
- UBAP2L: NM_014847
- UBB: NM_018955 Ljudski ubikvitin B (UBB), iRNK
- UBC: NM_021009 Ljudski ubikvitin C (UBC), iRNK
- UBE2A: NM_003336
- UBE2B: NM_003337
- UBE2D2: NM_003339 Ljudski ubikvtin-konjugirajući enzim E2D 2 (UBC4/5 kvaščev homolog)
- UBE2D3: NM_003340
- UBE2D4: NM_015983
- UBE2E1: NM_003341
- UBE2E2: NM_152653
- UBE2E3: NM_006357
- UBE2F: NM_080678
- UBE2G2: NM_003343
- UBE2H: NM_003344
- UBE2I: NM_003345 Ljudski ubikvitin-konjugirajući enzim E2I (UBC9 kvaščev homolog) (UBE2I),
- UBE2J1: NM_016021
- UBE2J2: NM_058167
- UBE2K: NM_005339
- UBE2L3: NM_003347
- UBE2M: NM_003969 Ljudski ubikvitin-konjugirajući enzim E2M (UBC12 kvaščev homolog) (UBE2M),
- UBE2N: NM_003348
- UBE2NL: NM_001012989
- UBE2Q1: NM_017582
- UBE2R2: NM_017811
- UBE2V1: NM_021988
- UBE2V2: NM_003350
- UBE2W: NM_018299
- UBE2Z: NM_023079
- UBE3A: NM_000462
- UBE3B: NM_130466
- UBE3C: NM_014671
- UBE4A: NM_004788
- UBE4B: NM_006048
- USP10: NM_005153
- USP14: NM_005151
- USP16: NM_006447
- USP19: NM_006677
- USP22: NM_015276
- USP25: NM_013396
- USP27X: NM_001145073
- USP33: NM_015017
- USP38: NM_032557
- USP39: NM_006590
- USP4: NM_003363
- USP47: NM_017944
- USP5: NM_003481
- USP7: NM_003470
- USP8: NM_005154
- USP9X: NM_001039590
Ribonukleaza
Tioredukaza
- TXN2: NM_012473
- TXNDC11: NM_015914
- TXNDC12: NM_015913
- TXNDC15: NM_024715
- TXNDC17: NM_032731
- TXNDC9: NM_005783
- TXNL1: NM_004786
- TXNL4A: NM_006701
- TXNL4B: NM_017853
- TXNRD1: NM_003330
Strukturni
Citoskeletni
Sinteza organela
- Specijalizacija za ćelijsku signalizaciju
- BLOC1S1[2][15]
- BLOC1S2: NM_173809
- BLOC1S3: NM_212550
- BLOC1S4: NM_018366
- BLOC1S6: NM_012388
- AP1G1: NM_001128
- AP1M1: NM_032493
- AP2A1: NM_014203
- AP2A2: NM_012305
- AP2M1:[2]
- AP2S1: NM_004069
- AP3B1: NM_003664
- AP3D1: NM_003938
- AP3M1: NM_012095
- AP3S1: NM_001284
- AP3S2: NM_005829
- AP4B1: NM_006594
- AP5M1: NM_018229
- ANXA6:[2] Aneksin 6
- ANXA7:[15] Aneksin 7
- AP1B1:[2][15] Oblaže vezikule
- CLTA:[2] Klatrin A (vezikulski)
- CLTB:[2][15] C
Klatrin B (vezikulski)
- CLTC
Mitohondrije
- MTX2
Površina
Ćelijska adhezija
Kanali i transporteri
- ABCB10: NM_012089
- ABCB7: NM_004299
- ABCD3: NM_002857
- ABCE1: NM_002939
- ABCF1: NM_001090
- ABCF2: NM_005692
- ABCF3: NM_018358
- CALM1:[2][15] Kalmodulin zahvata ione kalcija
- MFSD11: NM_024311 sličan MSFD10 zvani TETRAN ili protein sličan transporteru tetraciklina[2]
- MFSD12: NM_174983
- MFSD3: NM_138431
- MFSD5: NM_032889
- SLC15A4: NM_145648
- SLC20A1: NM_005415
- SLC25A11:[2] Nosač mitohondrijskog oksoglutarata/malata
- SLC25A26: NM_173471
- SLC25A28: NM_031212
- SLC25A3: NM_002635
- SLC25A32: NM_030780
- SLC25A38: NM_017875
- SLC25A39: NM_016016
- SLC25A44: NM_014655
- SLC25A46: NM_138773
- SLC25A5: NM_001152
- SLC27A4: NM_005094
- SLC30A1: NM_021194
- SLC30A5: NM_022902
- SLC30A9: NM_006345
- SLC35A2: NM_005660
- SLC35A4: NM_080670
- SLC35B1: NM_005827
- SLC35B2: NM_178148
- SLC35C2: NM_015945
- SLC35E1: NM_024881
- SLC35E3: NM_018656
- SLC35F5: NM_025181
- SLC38A2: NM_018976
- SLC39A1: NM_014437
- SLC39A3: NM_144564
- SLC39A7: NM_006979
- SLC41A3: NM_017836
- SLC46A3: NM_181785
- SLC48A1: NM_017842
Receptori
HLA/imunoglobulinsko/prepoznavanje ćelija
- BAT1:[2] DDX39B koji je uključen u preradu RNK
- BSG:[2] Natporodica basiginskih imunoglobulina, vanćelijske metaloproteinaze
- MIF[2][15] inhibitorni faktor migracije makrofaga
- TAPBP [2]
Kinaze/signalizacija
- ADRBK1:[2] može smanjiti regulaciju odgovora na adrenalin
- AGPAT1:[2][15] acil 3 fosfoglicerol acil-transferaza
- ARF1[2][15]
- ARF3[2]
- ARF4[2]
- ARF5[2][15]
- ARL2[2][15] Natporodica RAS
- CSF1:[2] Faktor stimulacije kolonije nije konstitutivno visoko eksprimiran na 5-12
- CSK C-src tirozin-kinaza[2]
- DCT [2][15] dopahrom-tautomeraza
- EFNA3[2]
- FKBP1A[2][15]
- GDI1:[2] Inhibitor disocijacije BDP-a (porodica Rab)
- GNAS1:[2] Sveprisutno izražen, ali različito probojan
- GNAI2[2][15]
- HAX1:[2][15] Povezan s tirozin-kinazama
- ILK:[2] Integrin-vezana kinaza
- MAPKAPK2[2]
- MAP2K2[2][15]
- MAP3K11[2]
- PITPNM:[2] Fosfatidilinozitolni prijenosni protein
- RAC1:[2][15] Ro GTPaza uključena u mnoge signalne puteve
- RAP1B:[2][15] GTPaza uključena u adheziju ćelije
- RAGA:[2][15] GTP-pridruživsnjr vezano za Ras
- STK19[2]
- STK24:[2] Serin/treonin-kinaza
- STK25[15]
- YWHAB:[2][15] Tirozin 3-monooksigenaza/triptofan 5-monooksigenaza aktivacioni protein, beta polipeptid
- YWHAH:[2][15] Tirozin 3-monooksigenaza/triptofan 5-monooksigenaza aktivacioni protein, h polipeptid
- YWHAQ:[2][15] Tirozin 3-monooksigenaza/triptofan 5-monooksigenaza aktivacioni protein, teta polipeptid
- YWHAZ:[2][15] Tirozin 3-monooksigenaza/triptofan 5-monooksigenaza aktivacioni protein, zeta polipeptid
Faktori rasta
Faktor tkivne nekroze
- CD40:[2] bivši TNFRSF5
Kazein kinaza
Ostali
- ALAS1: Sintaza aminolevulinske kiseline tip 1 (tip 2 je eritroidna i povezana je s porfirijom)
- ARHGEF2:[2] Faktor izmjene Rho guaninskih nukleotida
- ARMET:[2][15] Neurotrofni faktor izveden iz mezencefalnskih astrocita
- AES:[2][15] aminoterminalni pojačivač podjela
- BECN1:[2] Uključeni u autofagiju i partneri s PI3K
- BUD31:[2] Ranije majčinski G10 transkript
- Kreatin-kinaza:[2] CKB (ATP rezervoar)
- Citidin-deaminaza:[2] Upitno: uopće nije prisutna na vrlo visokim nivoima
- CPNE1[2]
- ENSA[2]
- FTH1:[2] Teški lanac feritina
- GDI2:[2] Rab/Ras vezikulski promet
- GUK1:[2][15] Gvanilat-kinaza prenosi fosfat iz ATP u GMP
- HPRT:[2][17][18] Hipoksantin-gvanin fosforibosiltransferaza
- IFITM1:[2] Inicira interferonski transmembranski protein
- JTB (gen):[2][15] Preskočna tačka prekida translokacije
- MMPL2:[2]
- NME2:[2][15] (ranije NM23B) Nukleozid difosfat-kinaza
- NONO[2][17]
- P4HB[2][15]
- PRDX1:[2] Peroksireoksin (smanjuje perokside)
- PTMA:[2] Protimozin
- RPA2:[2] Veže DNK tokom replikacije kako bi se ispravila
- SULT1A3:[2] Sulfatna konjugacija (napomena: SULT1C se u ranijoj literaturi navodi kao sveprisutan[15] ali ovo može biti primjer različitih oznaka; koristi se za upućivanje na zajedničko područjedva blisko povezana gena. Ako je oznaka prekratka, onda možda nije dovoljno specifična da se uistinu odredi jedan član porodice gena iz druge)
- SYNGR2:[2][15] Sinaptogirin (može učestvovati u translokaciji vezikula)
- Tetratrikopeptid, TTC1[2] mali glutaminom bogati tetratrikopeptid
Otvoreni okviri čitanja
Sperma/sjemenici
Iako je ovaj članak posvećen genima koji se sveprisutno eksprimiraju, ovaj odjeljak je za gene čiji sadašnji naziv odražava njihovu relativnu regulaciju u testisima.
- Inducibilni gen
- Ekspresija gena
- Gen
- Genom
- Genomika
Wikiwand in your browser!
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.
