CXCL4

Trombocitni faktor 4 (PF4) jest mali hemokin koji je kod ljudi kodiran genom CXCL4 sa hromosoma 4. Pripada porodici hemokina CXC koja je poznata i kao hemokinski ligand 4 (C-X-C motiv). Ovaj se hemokin oslobađa iz alfa-granule aktiviranih trombocita tokom njihove agregacije i podstiče koagulaciju krvi ublažavanjem učinaka molekula sličnih heparinu . Zbog ovih dejstava, predviđa se da ima ulogu u zarastanju rana i upalama.^[5] Obično se nalazi u kompleksu s proteoglikanom.

PF4
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 1RHP, 1DN3, 1F9Q, 1F9R, 1F9S, 1PFM, 1PFN, 4R9W, 4R9Y, 4RAU
Identifikatori
Aliasi	PF4
Vanjski ID-jevi	OMIM: 173460 MGI: 1888711 HomoloGene: 87791 GeneCards: PF4
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 4 (čovjek)[1] Bend 4q13.3 Početak 73,980,811 bp[1] Kraj 73,982,027 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 5 (miš)[2] Bend 5|5 E1 Početak 90,920,294 bp[2] Kraj 90,921,242 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • cytokine activity • heparin binding • CXCR3 chemokine receptor binding • chemokine activity • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine Ćelijska komponenta • extracellular region • platelet alpha granule lumen • Vanćelijsko • citoplazma • collagen-containing extracellular matrix Biološki proces • cytokine-mediated signaling pathway • chemokine-mediated signaling pathway • positive regulation of macrophage differentiation • platelet degranulation • negative regulation of megakaryocyte differentiation • positive regulation of cAMP-mediated signaling • negative regulation of MHC class II biosynthetic process • leukocyte chemotaxis • Hemotaksija • response to lipopolysaccharide • positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • regulation of cell population proliferation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 Imuni odgovor • positive regulation of tumor necrosis factor production • negative regulation of angiogenesis • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • inflammatory response • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cytolysis • platelet activation • defense response • positive regulation of neutrophil chemotaxis • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • regulation of megakaryocyte differentiation • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway • neutrophil chemotaxis • cellular response to lipopolysaccharide Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	5196	56744
Ensembl	ENSG00000163737	ENSMUSG00000029373
UniProt	P02776	Q9Z126
RefSeq (mRNK)	NM_002619 NM_001363352	NM_019932
RefSeq (bjelančevina)	NP_002610 NP_001350281	NP_064316
Lokacija (UCSC)	Chr 4: 73.98 – 73.98 Mb	Chr 5: 90.92 – 90.92 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je101 aminokiselina, а molekulska težina 10.845 Da.^[6].

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MSSAAGFCAS		RPGLLFLGLL		LLPLVVAFAS		AEAEEDGDLQ		CLCVKTTSQV
RPRHITSLEV		IKAGPHCPTA		QLIATLKNGR		KICLDLQAPL		YKKIIKKLLE
S

Funkcija

Trombocitni faktor-4 je protein od 70 aminokiselina koji se oslobađa iz alfa granula aktiviranih trombocita i veže se s visokim afinitetom za heparin. Čini se da je njegova glavna fiziološka uloga neutraliziranje molekula sličnih heparinu na endotelnoj površini krvnih dugova, čime se inhibira lokalna antitrombinska aktivnost i podstiče koagulacija. Kao snažan hemoatraktant za neutrofile i fibroblaste, PF4 vjerovatno ima ulogu u upali i popravci rana.^[5][7]

PF4 je ima hemotaksijsku aktuvnost aa neutrofil , fibroblast e i monocit, te stupa u interakciju s prerađenim varijantama transkripta receptora hemokina CXCR3, poznatim kao CXCR3-B .^[8]

Klinički značaj

Kompleks heparin: PF4 je antigen u heparin induciranoj trombocitopeniji, idiosinkratskoj autoimunskoj reakciji na primjenu antikoagulansa heparina.^[9] PF4 autoantitijela također su pronađeni kod pacijenata sa trombozom i karakteristikama koje liče na HIT, ali bez prethodne primjene heparina.^[10] Antitijela protiv PF4 implicirana su u slučajevima tromboze i trombocitopenije nakon vakcinacije Oxford–AstraZeneca ili Janssen COVID-19 vakcinama.^[11][12] Ovaj fenomen nazvan je embolija i imunotrombozna trombocitopenija izazvana vakcinom (VITT).^[13]

Povećava se kod pacijenata sa sistemskom sklerozom koji također imaju i intersticijsku plućnu bolest.^[14]

Faktor ljudskih trombocita 4 ubija malarijske parazite unutar eritrocita, selektivnom razlaganjem njihove probavne vakuole.^[15]

Također pogledajte

• Faktor aktivacije trombocita
• Trombocitni faktor rasta