ZNF263

Cinkoprstni protein 263 je protein koji je kod ljudi kodiran genom ZNF263.^[5] Gross (2014) mapirao je gen ZNF263 na hromosomu 16, sekvenca p13.3, na osnovu poravnanja sekvence ZNF263 (GenBank BC008805) sa genomskom sekvencom (GRCh37).^[6]

ZNF263
Identifikatori
Aliasi	ZNF263
Vanjski ID-jevi	OMIM: 604191 MGI: 1921370 HomoloGene: 4197 GeneCards: ZNF263
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 16 (čovjek)[1] Bend 16p13.3 Početak 3,263,800 bp[1] Kraj 3,301,401 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 16 (miš)[2] Bend 16 A1|16 2.2 cM Početak 3,561,957 bp[2] Kraj 3,568,654 bp[2]
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • vezivanje sa DNK • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • vezivanje iona metala • nucleic acid binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Ćelijska komponenta • intracellular anatomical structure • jedro Biološki proces • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	10127	74120
Ensembl	ENSG00000006194	ENSMUSG00000022529
UniProt	O14978	Q8CF60
RefSeq (mRNK)	NM_005741	NM_148924
RefSeq (bjelančevina)	NP_005732	NP_683726
Lokacija (UCSC)	Chr 16: 3.26 – 3.3 Mb	Chr 16: 3.56 – 3.57 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 683 aminokiseline, a molekulska težina 77.299 Da.^[7].

10		20		30		40		50
MASGPGSQER		EGLLIVKLEE		DCAWSQELPP		PDPGPSPEAS		HLRFRRFRFQ
EAAGPREALS		RLQELCHGWL		RPEMRTKEQI		LELLVLEQFL		TILPQEIQSR
VQELHPESGE		EAVTLVEDMQ		RELGRLRQQV		TNHGRGTEVL		LEEPLPLETA
RESPSFKLEP		METERSPGPR		LQELLGPSPQ		RDPQAVKERA		LSAPWLSLFP
PEGNMEDKEM		TGPQLPESLE		DVAMYISQEE		WGHQDPSKRA		LSRDTVQESY
ENVDSLESHI		PSQEVPGTQV		GQGGKLWDPS		VQSCKEGLSP		RGPAPGEEKF
ENLEGVPSVC		SENIHPQVLL		PDQARGEVPW		SPELGRPHDR		SQGDWAPPPE
GGMEQALAGA		SSGRELGRPK		ELQPKKLHLC		PLCGKNFSNN		SNLIRHQRIH
AAERLCMGVD		CTEIFGGNPR		FLSLHRAHLG		EEAHKCLECG		KCFSQNTHLT
RHQRTHTGEK		PYQCNICGKC		FSCNSNLHRH		QRTHTGEKPY		KCPECGEIFA
HSSNLLRHQR		IHTGERPYKC		PECGKSFSRS		SHLVIHERTH		ERERLYPFSE
CGEAVSDSTP		FLTNHGAHKA		EKKLFECLTC		GKSFRQGMHL		TRHQRTHTGE
KPYKCTLCGE		NFSHRSNLIR		HQRIHTGEKP		YTCHECGDSF		SHSSNRIRHL
RTHTGERPYK		CSECGESFSR		SSRLMSHQRT		HTG

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Kloniranje i ekspresija

Sekvenciranjem cDNK nasumično odabranim iz biblioteke cDNK generirane iz granulocitoidnih ćelija koje su izvedene iz ćelijske linije 60 ljudske promijelocitne leukemije (HL60), Okubo et al. (1995) identificirali su djilomične cDNK koje predstavljaju nekoliko novih gena. Koristeći jednu od ovih cDNK, Yokoyama et al. (1997) izolirali su cDNK pune dužine koja kodira ZNF263, a koju su nazvali FPM315. Izvedeni protein od 683 aminokiseline sadrži devet C-terminalnih domena cinkovog prsta tipa C2H2, od kojih su neki povezani H/C vezama. Tu su i CRAB-kutija koja je u drugim ZNF-ima pokazala da djeluje kao represijski transkripcijski domen i N-terminalna regija bogata leucinom (LeR) koja je također bogata glutaminskim kiselinama, i visoko je konzervirana u podskupini ZNF-ova, a predviđa se da sadrži dva alfa-heliksa. Northern blot analizom otkrivena su glavna transkripta od približno 3,4 i 3,8 kb. ZNF263 je eksprimiran u svim ispitivanim ljudskim tkivima fetusa i odraslih.^[8][9]

Reference

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000006194 - Ensembl, maj 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022529 - Ensembl, maj 2017
3. "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
4. "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
5. "Entrez Gene: Zinc finger protein 263". Pristupljeno 30. 1. 2017.
6. Gross, M. B. Personal Communication. Baltimore, Md. 6/25/2014.
7. "UniProt, O14978". Pristupljeno 11. 7. 2021.
8. Okubo, K., Itoh, K., Fukushima, A., Yoshii, J., Matsubara, K. Monitoring cell physiology by expression profiles and discovering cell type-specific genes by compiled expression profiles. Genomics 30: 178-186, 1995. PubMed: 8586417
9. Yokoyama, M., Nakamura, M., Okubo, K., Matsubara, K., Nishi, Y., Matsumoto, T., Fukushima, A. Isolation of a cDNA encoding a widely expressed novel zinc finger protein with the LeR and KRAB-A domains. Biochim. Biophys. Acta 1353: 13-17, 1997. PubMed: 9256059