Uridin-citidin kinazoiki protein 1 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom UCKL1.[5]
Kloniranje i ekspresija
Pomoću 2-hibridnog skrininga kvašćeve biblioteke limfoblastoidne cDNK s jedarnim antigenom-Epstein-Barr virusom (EBV) (EBNA3) kao mamcem, nakon čega i PCR analiza srčane biblioteke cDNK, Kashuba et al. (2002) klonirali su UCKL1, koji su nazvali F538. Izvedeni protein UCKL1 sadrži 548 aminokiselina. Njegova polovina na N-terminalu ima mjesto vezanja za ATP/GTP i dijeli sličnost s uridin kinazom-1 (UCK1; 609328) i UCK2 (609329), a njegova polovina s C-terminalm dijeli sličnost s uracil-fosforiboziltransferazama. Također su klonirali prerađenu varijantu UCKL1, kojoj nedostaje dio egzona 11. Ova varijanta kodira protein od 395 aminokiselina kojem nedostaje C-terminalna uracil-fosforiboziltransferazna regija. Northern blot analiza otkrila je sveprisutnu ekspresiju 2,4-kb transkripta UCKL1. Fluorescentna mikroskopija pokazala je citoplazmatsku lokalizaciju UCKL1 u transficiranim ćelijama bubrega majmuna.[6]
Funkcija gena
Putem 2-hibridne analize kvasca i testovima vezivanja in vitro, Kashuba et al. (2002) pokazali su da je UCKL1 komunicirao s EBNA3, jedarnim antigenom povezanim s EBV transformacijom. EBNA3 je inducirao translokaciju UCKL1 iz citoplazme u jedro, u transficiranim ćelijama bubrega majmuna, a translokacija je ovisila o C-kraju UCKL1. Zaključili su da je UCKL1 dio puta spašavanja ribonukleotida i sugerirali da jedarna ekspresija UCKL1 izazvana EBNA3 može doprinijeti akumulaciji UTP, neophodnoj za transformaciju eksplozije i brzu proliferaciju.
Analizom 2-hibridnih kvasca, imunoprecipitacijom i analizama mutacija, Fortier i Kornbluth (2006) otkrili su da su prstenasti prsti molekule povezanih sa NKLAM ili IBRDC3, u interakciji s URKL1 u ljudskim embrionskim ćelijama bubrega. Interakcija je rezultirala smanjenim nivoom proteina i povećanom ubikvitinacijom URKL1. Konfokalna mikroskopija pokazala je da su URKL1 lokalizirani u jedru, a NKLAM u citosolu, u blizini vanjske membrane kada su transficirani sami. Međutim, kotransfekcija URKL1 i NKLAM rezultirala je njihovom kolokalizacijom u citosolu. Zaključili su da je URKL1 supstrat za NKLAM, E3 ligazu.[7]
Aminokiselinska sekvenca
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAAPPARADA | DPSPTSPPTA | RDTPGRQAEK | SETACEDRSN | AESLDRLLPP | ||||
VGTGRSPRKR | TTSQCKSEPP | LLRTSKRTIY | TAGRPPWYNE | HGTQSKEAFA | ||||
IGLGGGSASG | KTTVARMIIE | ALDVPWVVLL | SMDSFYKVLT | EQQQEQAAHN | ||||
NFNFDHPDAF | DFDLIISTLK | KLKQGKSVKV | PIYDFTTHSR | KKDWKTLYGA | ||||
NVIIFEGIMA | FADKTLLELL | DMKIFVDTDS | DIRLVRRLRR | DISERGRDIE | ||||
GVIKQYNKFV | KPSFDQYIQP | TMRLADIVVP | RGSGNTVAID | LIVQHVHSQL | ||||
EERELSVRAA | LASAHQCHPL | PRTLSVLKST | PQVRGMHTII | RDKETSRDEF | ||||
IFYSKRLMRL | LIEHALSFLP | FQDCVVQTPQ | GQDYAGKCYA | GKQITGVSIL | ||||
RAGETMEPAL | RAVCKDVRIG | TILIQTNQLT | GEPELHYLRL | PKDISDDHVI | ||||
LMDCTVSTGA | AAMMAVRVLL | DHDVPEDKIF | LLSLLMAEMG | VHSVAYAFPR | ||||
VRIITTAVDK | RVNDLFRIIP | GIGNFGDRYF | GTDAVPDGSD | EEEVAYTG |
Reference
Dopunska literatura
Wikiwand in your browser!
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.