SRGN

Serglicin, znan i kao hematopoietski proteoglikanski jezgreni protein ili proteoglikanski jezgreni protein sekrecijskih granula, jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SRGN.^[5] It is primarily expressed in hematopoietic cells and endothelial cells,^[6] and is the only known intracellular proteoglycan.^[7]

SRGN
Identifikatori
Aliasi	SRGN
Vanjski ID-jevi	OMIM: 177040 MGI: 97756 HomoloGene: 2043 GeneCards: SRGN
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 10 (čovjek)[1] Bend 10q22.1 Početak 69,088,103 bp[1] Kraj 69,104,805 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 10 (miš)[2] Bend 10|10 B4 Početak 62,329,612 bp[2] Kraj 62,363,230 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine Ćelijska komponenta • Golđijev aparat • extracellular region • platelet alpha granule lumen • Vanćelijsko • mast cell granule • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse • postsynaptic specialization, intracellular component Biološki proces • negative regulation of bone mineralization • biomineral tissue development • platelet degranulation • protease localization to mast cell secretory granule • granzyme-mediated apoptotic signaling pathway • GO:0097285 apoptoza • protein processing • mast cell secretory granule organization • T cell secretory granule organization • maintenance of protease location in mast cell secretory granule • maintenance of granzyme B location in T cell secretory granule • modulation of chemical synaptic transmission • regulation of postsynapse organization Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	5552	19073
Ensembl	ENSG00000122862	ENSMUSG00000020077
UniProt	P10124	P13609
RefSeq (mRNK)	NM_002727 NM_001321053 NM_001321054	NM_011157 NM_001358965
RefSeq (bjelančevina)	NP_001307982 NP_001307983 NP_002718	NP_035287 NP_001345894
Lokacija (UCSC)	Chr 10: 69.09 – 69.1 Mb	Chr 10: 62.33 – 62.36 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 158 aminokiselina, а molekulska težina 17.652 Da.^[8]

10		20		30		40		50
MMQKLLKCSR		LVLALALILV		LESSVQGYPT		RRARYQWVRC		NPDSNSANCL
EEKGPMFELL		PGESNKIPRL		RTDLFPKTRI		QDLNRIFPLS		EDYSGSGFGS
GSGSGSGSGS		GFLTEMEQDY		QLVDESDAFH		DNLRSLDRNL		PSDSQDLGQH
GLEEDFML

C: Cistein

D: Asparaginska kiselina

E: Glutaminska kiselina

F: Fenilalanin

G: Glicin

H: Histidin

I: Izoleucin

K: Lizin

L: Leucin

M: Metionin

N: Asparagin

P: Prolin

Q: Glutamin

R: Arginin

S: Serin

T: Treonin

V: Valin

W: Triptofan

Y: Tirozin

Funkcija

Ovaj gen kodira protein najpoznatiji kao hematopoetska ćelija proteoglikanskih granula. Proteoglikani pohranjeni u sekrecijskim granulama mnogih hematopoetskih ćelija također sadrže peptidno jezgro otporno na proteazu, koja može biti važna za neutraliziranje hidrolitiskih enzima. Utvrđeno je da je ovaj kodirani protein povezan s makromolekulnim kompleksom granzima i perforina, koji može poslužiti kao posrednik apoptoza posredovanih granulama.^[5]