From Wikipedia, the free encyclopedia
Podjedinica 5 splajsing faktora 3B jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SF3B5.[5][6]
SF3B5 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
Aliasi | SF3B5 | ||||||||||||||||||||||||
Vanjski ID-jevi | OMIM: 617847 MGI: 1913375 HomoloGene: 41825 GeneCards: SF3B5 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
Lokacija (UCSC) | Chr 6: 144.09 – 144.1 Mb | Chr 10: 12.88 – 12.88 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
|
Pladienolid, herboksidien i spajsostatin identificirani su kao modulatori prerade RNK koji ciljaju SF3B u potkompleksu SF3b. U jednom radu iz 2017. izvješteno je da je PHF5A, još jedna komponenta ovog potkompleksa, također meta ovih spojeva. Mutacije u PHF5A-Y36, SF3B -K 07 , SF3B -R 074 i SF3B -V 078 daju otpor ovim modulatorima, što ukazuje na zajedničko mjesto interakcije. RNK-seq analiza otkriva da PHF5A-Y36C ima minimalan učinak na baznu preradu, ali inhibira globalno djelovanje modulatora prerade. Štaviše, PHF5A-Y36C mijenja profil zadržavanja introna induciranog splajsingom/preskakanjem egzona, koji je povezan sa diferencijalnim sadržajem GC-a između susjednih introna i egzona.
Određena je kristalna struktura ljudskog PHF5A, pokazujući da se Y36 nalazi u visoko konzerviranoj regiji. Analiza krio-EM splajsosomskog kompleksa Bact pokazuje da se rezistencijske mutacije grupiraju u džepu koji okružuje adenozinske tačke grananja, što ukazuje na konkurentan način djelovanja. Zajedno, predloženo je da PHF5A-SF3B čini centralni čvor za vezivanje za ove modulatore splajsinga.[7]
Dužina polipeptidnog lanca je 86 aminokiselina, а molekulska težina 0,35 Da.[8]
=
0 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MTDRYTIHSQ | LEHLQSKYIG | TGHADTTKWE | WLVNQHRDSY | CSYMGHFDLL | ||||
NYFAIAENES | KARVRFNLME | KMLQPCGPPA | DKPEEN |
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.