From Wikipedia, the free encyclopedia
Replikacijski protein A (RPA) je glavni protein koji se vezuje za jednolančanu DNK (ssDNA) u eukariotskim ćelijama.[1][2] In vitro, RPA pokazuje mnogo veći afinitet za ssDNK nego RNK ili dvolančana DNK.[3] RPA je neophodan u replikacijama, rekombinacija i procesima popravka, kao što su popravak ekscizijom nukleotida i homologna rekombinacija.[2][4] Takođe ima ulogu u reagovanju na oštećenje DNK.[4]
RPA je heterotrimer, sastavljen od podjedinica RPA1 (RPA70) (podjedinica 70kDa), RPA2 (RPA32) (podjedinica 32kDa) i RPA3 (RPA14) (podjedinica 14kDa). Tri RPA podjedinice sadrže šest OB-nabora (vezivanje oligonukleotida/oligosaharida), sa DNK-vezujućim domenima (DBD) označene kao DBDs A-F, koje vezuju RPA za jednolančanu DNK.[2][3]
DBD-ovi A, B, C i F se nalaze na RPA1, DBD D se nalazi na RPA2, a DBD E se nalazi na RPA3.[4] DBD-ovi C, D i E čine jezgro trimerizacije proteina sa regionima fleksibilnog lnkera koji ih povezuju sve zajedno.[4] Zbog ovih fleksibilnih linkera regiona, RPA se smatra veoma fleksibilnim i to podržava dinamičko vezivanje koje RPA može postići. Zbog ovog dinamičkog vezivanja, RPA je također sposoban za različite konformacije što dovodi do različitog broja nukleotida koje može angažovati.[4]
DBD-ovi A, B, C i D su mjesta koja su uključena u vezivanje ssDNK.[5] interakcije protein-protein između RPA i drugih proteina dešavaju se na N-terminalu RPA1, konkretno DBD F, zajedno sa C-terminalom RPA2.[5] Fosforilacija RPA se odvija na N-terminalu RPA2.[5]
RPA dijeli mnoge karakteristike sa heterotrimerom kompleksa CST, iako RPA ima uniformniju stehiometriju 1:1:1.[6]
Tokom replikacija DNK, RPA sprečava jednolančanu DNK (ssDNA) da se namota na sebe ili da formira sekundarne strukture. Također pomaže u zaštiti ssDNK od napada endonukleaza.[2] Ovo održava nenamotanu DNK da bi je polimeraza replicirala. RPA se također vezuje za ssDNK tokom početne faze homologne rekombinacije, važnog procesa u popravci DNK i profazi I mejoza.
Preosjetljivost na agense koji oštećuju DNK može biti uzrokovana mutacija u genu RPA.[7] Kao i njegova uloga u replikaciji DNK, ovo sprečava ssDNK da se veže za sebe (samokomplementira), tako da rezultirajući nukleoproteinski filament može biti vezan za Rad51 i njegove kofaktore.[7]
RPA se takođe vezuje za DNK tokom procesa popravke ekscizijom nukleotida. Ovo vezivanje stabilizuje kompleks popravke tokom procesa popravke. Bakterijski homolog zove se jednolančani vezujući protein (SSB).
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.