Replikacijski protein A (RPA) je glavni protein koji se vezuje za jednolančanu DNK (ssDNA) u eukariotskim ćelijama.[1][2] In vitro, RPA pokazuje mnogo veći afinitet za ssDNK nego RNK ili dvolančana DNK.[3] RPA je neophodan u replikacijama, rekombinacija i procesima popravka, kao što su popravak ekscizijom nukleotida i homologna rekombinacija.[2][4] Takođe ima ulogu u reagovanju na oštećenje DNK.[4]
Struktura
RPA je heterotrimer, sastavljen od podjedinica RPA1 (RPA70) (podjedinica 70kDa), RPA2 (RPA32) (podjedinica 32kDa) i RPA3 (RPA14) (podjedinica 14kDa). Tri RPA podjedinice sadrže šest OB-nabora (vezivanje oligonukleotida/oligosaharida), sa DNK-vezujućim domenima (DBD) označene kao DBDs A-F, koje vezuju RPA za jednolančanu DNK.[2][3]
DBD-ovi A, B, C i F se nalaze na RPA1, DBD D se nalazi na RPA2, a DBD E se nalazi na RPA3.[4] DBD-ovi C, D i E čine jezgro trimerizacije proteina sa regionima fleksibilnog lnkera koji ih povezuju sve zajedno.[4] Zbog ovih fleksibilnih linkera regiona, RPA se smatra veoma fleksibilnim i to podržava dinamičko vezivanje koje RPA može postići. Zbog ovog dinamičkog vezivanja, RPA je također sposoban za različite konformacije što dovodi do različitog broja nukleotida koje može angažovati.[4]
DBD-ovi A, B, C i D su mjesta koja su uključena u vezivanje ssDNK.[5] interakcije protein-protein između RPA i drugih proteina dešavaju se na N-terminalu RPA1, konkretno DBD F, zajedno sa C-terminalom RPA2.[5] Fosforilacija RPA se odvija na N-terminalu RPA2.[5]
RPA dijeli mnoge karakteristike sa heterotrimerom kompleksa CST, iako RPA ima uniformniju stehiometriju 1:1:1.[6]
Funkcije
Tokom replikacija DNK, RPA sprečava jednolančanu DNK (ssDNA) da se namota na sebe ili da formira sekundarne strukture. Također pomaže u zaštiti ssDNK od napada endonukleaza.[2] Ovo održava nenamotanu DNK da bi je polimeraza replicirala. RPA se također vezuje za ssDNK tokom početne faze homologne rekombinacije, važnog procesa u popravci DNK i profazi I mejoza.
Preosjetljivost na agense koji oštećuju DNK može biti uzrokovana mutacija u genu RPA.[7] Kao i njegova uloga u replikaciji DNK, ovo sprečava ssDNK da se veže za sebe (samokomplementira), tako da rezultirajući nukleoproteinski filament može biti vezan za Rad51 i njegove kofaktore.[7]
RPA se takođe vezuje za DNK tokom procesa popravke ekscizijom nukleotida. Ovo vezivanje stabilizuje kompleks popravke tokom procesa popravke. Bakterijski homolog zove se jednolančani vezujući protein (SSB).
Također pogledajte
- Jednolančani vezujući protein
- Replikacijski protein A1
- Replikacijski protein A2
- Replikacijski protein A3
Reference
Wikiwand in your browser!
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.
