gen koji kodira protein u vrsti Homo sapiens From Wikipedia, the free encyclopedia
NWD1, skraćenica za NACHT i WD ponavljajuči domen koji sadrži protein 1, je gen pronađen kod kičmenjaka, koji kodira protein koji sadrži domen NACHT i domen ponavljanje WD40. Prvobitno je identificiran tokom potrage za genima imunskog sistema kod zebrica, kao sekvenca koja kodira protein povezana sa APAF1; ortolozi su naknadno identificirani kod sisarskih vrsta.[5] Dosadašnji podaci ukazuju na uzročnu ulogu prekomjerne ekspresije NWD1 povezane sa tumorom, u poremećaju regulacije signalizacije androgenih receptora tokom progresije karcinoma prostate.[6]
NWD1 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
Aliasi | NWD1, NACHT i WD ponavljajuči domen koji sadrži protein 1 | ||||||||||||||||||||||||
Vanjski ID-jevi | OMIM: 616250 MGI: 2442268 HomoloGene: 72261 GeneCards: NWD1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
Lokacija (UCSC) | Chr 19: 16.72 – 16.82 Mb | Chr 8: 72.65 – 72.72 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MQRGKPCRAL | PTLKCQTFCQ | RHGLMFEVVD | LRWGIRNIEA | TDHLTTELCL | ||||
EEVDRCWKTS | IGPAFVALIG | DQYGPCLIPS | RIDEKEWEVL | RDHLTARPSD | ||||
LELVARYFQR | DENAFPPTYV | LQAPGTGEAC | EPEEATLTSV | LRSGAQEARR | ||||
LGLITQEQWQ | HYHRSVIEWE | IERSLLSSED | REQGATVFLR | EIQDLHKHIL | ||||
EDCALRMVDR | LADGCLDADA | QNLLSSLKSH | ITDMHPGVLK | THRLPWSRDL | ||||
VNPKNKTHAC | YLKELGEQFV | VRANHQVLTR | LRELDTAGQE | LAWLYQEIRH | ||||
HLWQSSEVIQ | TFCGRQELLA | RLGQQLRHDD | SKQHTPLVLF | GPPGIGKTAL | ||||
MCKLAEQMPR | LLGHKTVTVL | RLLGTSQMSS | DARGLLKSIC | FQVCLAYGLP | ||||
LPPAQVLDAH | TRVVQFFHTL | LHTVSCRNFE | SLVLLLDAMD | DLDSVRHARR | ||||
VPWLPLNCPP | RVHLILSACS | GALGVLDTLQ | RVLLDPEAYW | EVKPLSGNQG | ||||
QQMIQLLLAA | ARRTLSPVHT | DLLWASLPEC | GNPGRLRLAF | EEARKWASFT | ||||
VPVPLATTAE | EATHQLCTRL | EQTHGQLLVA | HVLGYIVSSR | HGLSEAELKD | ||||
VLSLDDEVLQ | DVYRDWTPPS | KELLRFPPLL | WVRLRRDLGY | YLARRPVDGF | ||||
TLLAIAHRQL | VEVVRERYLS | GSERAKRHGV | LADFFSGTWS | QGTKKLITLP | ||||
LVGKPLNLDR | KVAPQPLWFS | HTVANLRKLK | ELPYHLLHSG | RLEELKQEVL | ||||
GSMSWISCRG | ISGGIEDLLD | DFDLCAPHLD | SPEVGLVREA | LQLCRPAVEL | ||||
RGMERSLLYT | ELLARLHFFA | TSHPALVGQL | CQQAQSWFQL | CAHPVLVPLG | ||||
GFLQPPGGPL | RATLSGCHKG | ITAMAWGVEE | KLLVIGTQDG | IMAVWDMEEQ | ||||
HVIHMLTGHT | GEVRCVKIFA | KGTLANSASK | DYTLHLWNLL | SGQEKFTIWD | ||||
GGSKNPAEPQ | IWNLHVDEAH | KVVYSASGSK | INAWNLETAE | PVFHILGDAS | ||||
DPWMCMAVLA | SQATLLTVSR | DGVVSLWSSA | TGKLQGKQHM | SSIKEETPTC | ||||
AVSVQKQGKL | VTGFSNGSIS | LVSSKGDRLL | EKLPDAVRFL | VVSEDESLLA | ||||
AGFGRSVRIF | LADSRGFRRF | MAMDLEHEDM | VETAVFGTEN | NLIITGSLDA | ||||
LIQVWSLSEQ | GTLLDILEGV | GAPVSLLARG | GALVASASPQ | SSSFKVWDLS | ||||
DAHRSRVPAP | FLDRTGLTAV | SHNGSYVYFP | KIGDKNKVTI | WDLAEGEEQD | ||||
SLDTSSEIRC | LEVAEQRKLL | FTGLVSGVVL | VFPLNSRQDV | ICIPPPEARK | ||||
AINCMSLSKC | EDRLAIAYDN | IVLVLDITSG | DPCPVIDGPR | YTFYTQLPET | ||||
LSSVAILTDY | RVVYSMTNGD | LFLYECATSK | AFPLETHRSR | VACVEVSHKE | ||||
QLVVSGSEDA | LLCLWDLQAR | KWKFEMSYTS | SYCRGVQCAC | FSKDDKYVYV | ||||
GLKDRSILVW | SVLDGTLLTV | QFVHAVVNRI | IPTTSGFIAP | TRHGYLIREN | ||||
FQCLSAKASP | QDPLKNFKKA | MWMVKSRQRE | ELVAAAGAPQ | DLESESAQGN | ||||
ETKSNKCSQV | CLIV |
Correa et al. (2014) naveli su da NWD1 protein sadrži 1.358 aminokiselina i ima izračunatu molekulsku masu od 150,8 kD. NWD1 ima N-terminalni WD ponavljajući domen od oko 40 aminokiselina, zatim NACHT domen, prostorni region, 10 tandemskih WD ponavljanja, drugi razmaknik, dva dodatna WD ponavljanja, i kratak C-terminalni rep. Kvantitativnom PCR analizom otkrivena je NWD1 ekspresija u većini od 48 ispitanih ljudskih tkiva, sa najsnažnijim ispoljavanjem u prostati, a slijede sjemenici, mrežnjača, dušnik, očni živac, hipofiza i pluća. Epitopno označeni NWD1 eksprimiran je u citosolu transfektiranih ćelija HEK293T.
==Funkcija gena==
Correa et al. (2014) identificirali su obogaćivanje lokusa SRY u promotorskoj regiji gena NWD1. PCR analiza je pokazala indukciju ekspresije NWD1 u transficiranim HEK293T i PPC-1 ćelijama prostatskog karcinoma iz SRY i povezanog transkripcijskog faktora SOX9 . Nokautiranje NWD1 ekspresije putem lentivirusnog gena koji utišavajući dramatično smanjuje održivost u androgeno-responzivnim ćelijama LNCaP-a raka prostate. Utišavanje NWD1 u ćelijama LNCaP abrogiralo je aktivnost virusa zavisnih od androgena. Utišavanje NWD1 je također smanjilo i ekspresiju PDEF-a (SPDEF) u nekoliko linija ljudskih ćelija i možda je imalo manji efekt u smanjenju aktivacije NF-kappa-B. Ekspresija NWD1 je povišen tokom patogeneze ili progresije raka prostate.[7]
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.