Član A porodice sa sličnošću sekvence 181 je protein koji je kod ljudi kodiran genom FAM181A. [5]
| FAM181A | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | FAM181A | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | MGI: 3647570 HomoloGene: 34701 GeneCards: FAM181A | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt |
| ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) |
| ||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 14: 93.92 – 93.93 Mb | Chr 12: 103.28 – 103.28 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 354 aminokiseline, a molekulska težina 38.724 Da.[6].
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MPLEERRSSG | ERNDAAPTNH | RRPGEKRAST | AKQVSSVPFL | GAAGHQQSLP | ||||
| SSWKASCSGP | LVMASDSDVK | MLLNFVNLAS | SDIKAALDKS | APCRRSVDHR | ||||
| KYLQKQLKRF | SQKYSRLPRG | LPGRAAEPYL | KRGSEDRPRR | LLLDLGPDSS | ||||
| PGGGGGCKEK | VLRNPYREEC | LAKEQLPQRQ | HPEAAQPGQV | PMRKRQLPAS | ||||
| FWEEPRPTHS | YHVGLEGGLG | PREGPPYEGK | KNCKGLEPLG | PETTLVSMSP | ||||
| RALAEKEPLK | MPGVSLVGRV | NAWSCCPFQY | HGQPIYPGPL | GALPQSPVPS | ||||
| LGLWRKSPAF | PGELAHLCKD | VDGLGQKVCR | PVVLKPIPTK | PAVPPPIFNV | ||||
| FGYL |
Funkcija
Analizirajući 1,780.295 5-krajnih sekvenci ljudskih cDNK punih dužina, izvedenih iz 164 tipa oligo-cap biblioteka cDNK, identificirano je 269.774 nezavisnih položaja transkripcijskih početnih mjesta (TSS) za 14.628 ljudskih RefSeq gena. Ovi TSS su grupirani u 30.964 klastera koji su međusobno odvojeni za više od 500 bp i stoga vrlo vjerojatno predstavljaju međusobno različite alternativne promotore. Najmanje 7674 (52%) ljudskih gena RefSeq podlijegalo je navodnim alternativnim promotorima (PAP). U prosjeku je bilo 3,1 PAP po genu, sa sastavom jednog promotora koji sadrži CpG-tok po 2,6 promotora bez CpG. U 17% lokusa koji sadrže PAP uočena je specifična upotreba PAP-ova za tkivo.
Najbogatiji izvori tkiva PAP-a specifičnih za tkivo bili su sjemenici i mozak. Također je bilo intrigantno da su promotori koji sadrže PAP obogaćeni genima koji kodiraju proteine povezane sa transdukcijom signala i da su rjeđi u genima koji kodiraju vanćelijske proteine, što možda odražava različite funkcionalne potrebe i ograničenu ekspresiju tih kategorija gena. Obrasci prvih egzona također su bili veoma raznoliki. U prosjeku je bilo 7,7 različitih tipov slternativne prerade prvih egzona po lokusu, koje su djelomično proizveli PAP-ovi, što sugerira da se ovim mehanizmom može postići širok spektar transkripata. Nalazi sugeriraju da bi upotreba alternativnih promotora i posljedična alternativna upotreba prvih egzona trebali imati ključnu ulogu u stvaranju složenosti potrebne za visoko razrađeni molekulski sistem kod ljudi.[7]
Reference
Wikiwand in your browser!
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.
