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本科魚眼小，體正常，無鱗片，頭部前方骨變形。無側線且無其他側線孔特化組織，而僅以嗅覺器官代替。吻短，無上頷，舌固定，無鋤骨，前後鼻孔靠近。鰓孔腹位；鰓被架骨無，體色為黑色，脊椎骨88-115。
單頜鰻科其下僅有單頜鰻屬一屬：
- 阿氏單頜鰻(Monognathus ahlstromi)
- 伯氏單頜鰻(Monognathus berteli)
- 貝蒂單頜鰻(Monognathus bertini)
- 貝氏單頜鰻(Monognathus boehlkei)
- 布氏單頜鰻(Monognathus bruuni)
- 赫氏單頜鰻(Monognathus herringi)
- 艾氏單頜鰻(Monognathus isaacsi)
- 傑氏單頜鰻(Monognathus jesperseni)
- 傑斯氏單頜鰻(Monognathus jesse)
- 奈氏單頜鰻(Monognathus nigeli)
- 小眼單頜鰻(Monognathus ozawai)
- 雷氏單頜鰻(Monognathus rajui)
- 羅氏單頜鰻(Monognathus rosenblatti)
- 斯氏單頜鰻(Monognathus smithi)
- 坦氏單頜鰻(Monognathus taningi)
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