蝙蝠冠状病毒HKU3(BtCoV HKU3;Bat-SARS-CoV HKU3)属严重急性呼吸道综合征相关冠状病毒(SARSr-CoV),为SARS-CoV相关病毒,在中华菊头蝠样本中发现,是第一个在蝙蝠中发现的SARS相关病毒[1]。HKU3包含13个病毒株,其中HKU3-1、HKU3-2与HKU3-3于2005年发表,在香港的中华菊头蝠中发现;HKU3-4至HKU3-13于2010年发表,在香港与广东的中华菊头蝠样本中发现。

Quick Facts 蝙蝠冠状病毒HKU3, 病毒分类 ...
蝙蝠冠状病毒HKU3
病毒分类 编辑
(未分级) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 套式病毒目 Nidovirales
科: 冠状病毒科 Coronaviridae
属: 乙型冠状病毒属 Betacoronavirus
亚属: SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus
种:
毒株
蝙蝠冠状病毒HKU3 HKU3病毒
Close

发表与研究

Thumb
中华菊头蝠

2004年至2005年,香港大学的研究人员在香港各地采集动物样本,发现中华菊头蝠样本中含有与SARS-CoV相似的冠状病毒,经全基因组定序得到HKU3-1、HKU3-2与HKU3-3等三个病毒株[2][3],是首次在蝙蝠样本中发现SARS相关病毒,此前仅知果子狸鼬獾带有SARS病毒[1][注 1]。HKU3-1、3-2与3-3的基因组约长29700nt,其序列与SARS-CoV相似度为88%,大部分差异位于刺突蛋白(S)、ORF3ORF8,其中尤以ORF8差异最大,与果子狸SARS病毒一样比人类SARS病毒多了一段长29nt的插入序列(但此29个核酸与果子狸病毒的不完全相同),形成一完整的长开放阅读框,而人类SARS病毒的ORF8则是被分成8a与8b等2个较小的开放阅读框[5]

2010年,又有10个与此三个病毒株相近的新病毒株被发表,即为HKU3-4至HKU3-13,基因组长度介于29677nt至29716nt之间,这些病毒株来自2004年至2008年采集的中华菊头蝠样本,其中HKU3-7与HKU3-8来自广东的个体,其他则来自香港的个体,香港的8个毒株彼此序列非常接近(相似度99.9%),和广东的毒株相似度则为98.5%,这10个新病毒株与2005年发表的3个病毒株共同组成一个演化支。除HKU3-8外的9个病毒株的ORF8皆与果子狸SARS病毒、HKU3-1、3-2与3-3一样是一个完整的长开放阅读框,HKU3-8在此处则有一段长26nt的缺失(在人类SARS病毒29nt缺失的附近),将ORF8分为3个较小的开放阅读框[6]

HKU3与许多蝙蝠SARSr-CoV一样在刺突蛋白的受体结合结构域(receptor binding domain, RBD)有两段分别长5和12个氨基酸的序列缺失(但不见于WIV1病毒SHC014病毒[7]

演化树

截至2021年1月 (2021-01)SARS-CoV与相关病毒株的系统发生树

16BO133 与SARS-COV相似度82.8 % · 马铁菊头蝠 · 韩国全罗北道 (2016年采集、2019年发表)[8]

Rf1 87.8 % · 马铁菊头蝠 · 中国湖北宜昌 (2004年采集、2005年发表)[4]

BtCoV HKU3 87.9 % · 中华菊头蝠 · 香港、中国广东 (2004年采集、2005年发表、2010年又发表若干新病毒株)[1]

LYRa11 90.9 % · 中菊头蝠 · 中国云南保山 (2011年采集、2014年发表)[9]

Rp3 92.6 % · 皮氏菊头蝠 · 中国广西南宁 (2004年采集、2005年发表)[4]

SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中国云南禄丰 (2013年采集、2015年发表)[7]

SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中国云南禄丰 (2013年采集、2015年发表)[7]

SHC014 95.4 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明 (2011年采集、2013年发表)[10]

WIV1 95.6 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明 (2012年采集、2013年发表)[10]

WIV16 96.0 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明 (2013年采集、2016年发表)[11]

果子狸SARS冠状病毒 99.8 % · 果子狸 · 中国广东[1]

SARS-CoV 100 %

SARS-CoV-2 79 %

  蝙蝠病毒
  果子狸病毒
  人类病毒


注脚

参考文献

Wikiwand in your browser!

Seamless Wikipedia browsing. On steroids.

Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.

Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.