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文昌魚（學名：Branchiostoma lanceolatum）是文昌魚屬的一種生物，它沒有脊椎骨，所以是介於無脊椎動物和脊椎動物之間的過渡型動物，並不屬於魚類[2]。文昌魚是生物演化研究中的模式生物[3]，它揭示了現存脊椎動物的起源。
文昌魚
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科學分類 
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| 界： | 動物界 Animalia |
| 門： | 脊索動物門 Chordata |
| 綱： | 頭索綱 Leptocardii |
| 目： | 文昌魚目 Amphixiformes |
| 科： | 文昌魚科 Branchiostomidae |
| 屬： | 文昌魚屬 Branchiostoma |
| 種： | 文昌魚 B. lanceolatum
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| 二名法 | |
| Branchiostoma lanceolatum | |
| 異名[1] | |
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文昌魚不同於香港稱之為「白飯魚」的一種魚。香港白飯魚實是銀魚科的白肌銀魚（Salanx chinensis）及有明銀魚（Salanx ariakensis），屬脊椎動物的魚類。
體長3-5厘米，外表看起來像魚類。身體半透明。同脊椎動物一樣，文昌魚具有一條沿背部下行的神經索，並具有呈條帶狀的肌節。然而，和脊椎動物不同的是，文昌魚的背神經索不是由骨骼所保護，而是由許多柱狀細胞所在組成的具有韌性的膜狀結構所緊密包圍，這種起支撐作用的結構比脊椎簡單得多，又被稱為脊索（notochord）。文昌魚的脊索和脊椎動物的脊椎不同，它一直延伸進入頭部，故文昌魚所屬的亞門被稱作頭索動物亞門（Cephalochordata），其中「cephalo-」在拉丁文的意思就是「與頭部相連」。文昌魚於頭部被稱為腦室的神經索部份比較粗大，但並不是腦部。並且文昌魚嘴的前端長有口笠觸手（oral cirri），起到感覺器官和過濾進入口中的海水的作用。文昌魚擁有血管系統，但沒有心臟，血液由一部份血管的脈動帶動。
文昌魚成熟個體平均體長大約5厘米，壽命約2年8個月。廣泛分佈於各大洋低、中緯度海域的近岸淺水區。它們對地質要求比較嚴格，通常僅在有機質含量較低的粗中砂和中砂中大量出現。幼體運動能力弱，營浮游生活；成體在沙質的淺海中營半穴居生活，身體埋入砂中，僅前端外露，用於進行呼吸和濾食水體中的矽藻。夜間較為活躍，在海水中短暫游泳。
中國青島（Branchiostoma belcheri tsingtauense）、廈門（Branchiostoma belcheri xiameng）是文昌魚的兩個主要棲息地。此外，整個東南亞沿海均有發現文昌魚。在美國加利福尼亞州和佛羅里達州也有分佈。
香港城市大學曾經研究文昌魚，調查發現香港有四種文昌魚，包括:
由於對棲息地的底質及水質的要求較高，人為破壞所造成的棲息地環境改變有可能造成文昌魚種群的消失。例如高集海堤的修建就直接導致了曾經年產60噸文昌魚的劉五店漁場的消失。此外，由於文昌魚具有豐富的營養價值，為東南亞一帶的傳統食物，商業性的捕撈也加速了文昌魚資源的枯竭。文昌魚現為中國的國家二級保護動物。
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