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北京大學醫學部（英語：Peking University Health Science Center，縮寫：PKUHSC），簡稱北醫，是北京一所以醫藥衛生為主的高等院校，位於北京市海淀區學院路38號。該校原為北京醫科大學，2000年5月4日併入北京大學[3]。
北醫前身是國立北京醫學專門學校，創建於1912年10月26日，是中國政府開辦的第一所國立醫學院校。是民國早期九所著名「國立」高校之一。其歷史淵源可以上溯到1903年－1907年之間曾經存在過的京師大學堂醫學實業館。1913年國立北京醫學專門學校首批學生72人，到1917年首批畢業學生共22人。
1923年，北京醫學專門學校更名為北京醫科大學。1927年，奉系軍閥張作霖率安國軍進入北平，進京後的張作霖改組高等教育，把當時北平「國立」九校合併為「京師大學校」，北醫更名為京師大學校醫科；1928年國民黨的北伐大軍兵臨城下，張作霖離開北京，之後一些高校復校，包括北醫在內未復校的高校成為北平大學的一部分，北醫成為北平大學醫學院。
1937年盧溝橋事變爆發後，北平各高校紛紛西遷南遷，北平大學大部撤離到了古都西安並在那裏和北洋大學等華北名校一起組成了西北聯合大學。與此同時，部分未撤離北平的醫學院教師在日佔區繼續行醫、教學，並組建了北京大學醫學院，院長為鮑鑒清。太平洋戰爭後北京大學醫學院吸收了美屬北平協和醫學院的部分師資。如林巧稚，諸福棠等均曾在這任過職。有人也把1937-1945年這段時期稱為「偽北京大學」醫學院。
1945年，國民政府教育部決定在國立北京大學、國立浙江大學、國立山東大學和國立武漢大學四所高校設立醫學院。原北京大學醫學院改組為北平臨時大學補習班第六分班，該班連同附屬醫院（北大醫院）再次組成北京大學醫學院。院長為馬文昭。部份原醫學院教授遭解職。而新聘師資中雲集了一大批歐美留學博士。這些人代表當時學界最高水平，後來均成為學界泰斗。如
- 基礎學科：組織馬文昭，神經解剖臧玉洤，解剖劉其端，免疫陶善敏、顏春輝，細菌學謝少文、方亮，生化劉思職、張昌穎，醫史李濤，寄生蟲馮蘭洲，病理林振剛，秦光煜；藥理李鉅，生理沈寯淇，公衛林宗揚、嚴鏡清，藥學薛愚、王序等。
- 臨床學科：傳染病吳朝仁，熱帶病鍾惠瀾，腎臟病王叔咸，胃腸陳國楨，心臟病馬萬森，腦外科關頌韜，泌尿外科謝元甫，骨科孟繼懋、陳景雲，胸外王大同，腫瘤外科司徒展，兒科諸福棠，皮膚花柳病胡傳揆，神經精神病許英魁，眼科畢華德、劉家琦，耳鼻喉科劉瑞華、張慶松、徐蔭祥，放射汪紹訓，謝志光，口腔毛燮均、鍾之奇、胡郁斌教授等。
原北平大學醫學院的師生未回北平，而是留在西安建立了西安醫科大學（現為西安交通大學醫學院）。
1952年在全國高校院系調整中，北京大學醫學院脫離北京大學，獨立為北京醫學院。1954年，北京醫學院成為全國六所重點院校之一。1958年，原中央醫院併入北醫，成為第二附屬醫院（現北京大學人民醫院）。從北大醫院、建工醫院和平安醫院新組建了北醫三院。1959年，北京醫學院成為全國十六所重點院校之一。
1960年，北京醫學院組建北京第二醫學院（現首都醫科大學）。同時大批骨幹師資西行洛陽、蘭州、內蒙、酒泉等地支援地方建設。1985年，更名為北京醫科大學。並成為全國10所重點建設院校之一。1996年，成為國家首批「211工程」重點支持的醫科大學。
2000年4月，北京醫科大學與北京大學合併，組建了新的北京大學[4]，北京醫科大學成為北京大學醫學部。現在的北京大學醫學部集人才培養、科學研究、醫療服務於一體，「醫」「教」「研」並重。醫學部主任是中國工程院院士詹啟敏。北醫學科齊全，科研突出。發表的科技論文，自然科學基金多年來保持中國大陸醫學院校首位。中國的乙肝疫苗，試管嬰兒，變性手術，丙肝疫苗，自身血液回收系統，骨髓移植，頸椎病的治療，腎臟移植等等均率先誕生在北醫。北醫科學家還發現一批世界級的科研成果，如針刺鎮痛的物質基礎，雌激素和諾瓦得士（三苯氧胺）誘發婦科腫瘤的機制等。幾十年來北醫為國家培養了幾萬名畢業生，代表人物如錢壯飛、賀誠、王炳章、林幾、王忠誠、曲綿域、鍾南山、屠呦呦、王存玉和錢煦等。北醫附屬醫院從原先的一所綜合醫院發展成三所綜合型加三所專科醫院。原「深圳市中心醫院」和「首都鋼鐵公司醫療所」在21世紀加入北醫，成為其附屬醫院。
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- 北京積水潭醫院 （第四臨床醫學院）
- 北京醫院 （第五臨床醫學院）
- 北京世紀壇醫院（第九臨床醫學院）
- 航天中心醫院（北京大學航天臨床醫學院）
- 中日友好醫院（北京大學中日友好臨床醫學院）
- 北京地壇醫院（北京地壇醫院教學醫院）
- 民用航空總醫院（北京大學民航臨床醫學院）
- 北京回龍觀醫院（北京大學回龍觀臨床醫學院）
- 首都兒科研究所附屬兒童醫院（北京大學首都兒科研究所教學醫院）
- 北京京煤集團總醫院（北京大學北京京煤集團總醫院教學醫院）
- 北京仁和醫院（北京大學北京仁和醫院教學醫院）
- 中國人民解放軍第三〇二醫院（北京大學解放軍302醫院教學醫院）
- 中國人民解放軍第三〇六醫院（北京大學解放軍306醫院教學醫院）
| 姓名 | 校名 | 職務 | 任期 |
|---|---|---|---|
| 湯爾和 | 國立北京醫學專門學校 | 校長 | 1912.10--1915.12 |
| 葛成勛 | 1915.12--1916.08 | ||
| 湯爾和 | 1916.08--1922.04 | ||
| 周頌聲 | 1922.04--1923.12 | ||
| 洪式閭 | 國立北京醫科大學校 | 1924.01--1925.08 | |
| 張黼卿 | 1925.08--1926.01 | ||
| 孫柳溪 | 1926.01--1927.08 | ||
| 國立京師大學校醫科 | 學長 | 1927.08--1928.11 | |
| 徐誦明 | 國立北平大學醫學院 | 院長 | 1928.11--1932.08 |
| 吳祥風 | 1932.08--1937.09 | ||
| 鮑鑒清 | 國立北京大學醫學院 | 1938.03--1945.08 | |
| 馬文昭 | 北平臨時大學第六分班 | 班主任 | 1945.09--1946.09 |
| 國立北京大學醫學院 | 院長 | 1946.09--1947.08 | |
| 沈寯琪 | 1947.08--1948.08 | ||
| 胡傳揆 | 1948.08--1952.12 | ||
| 北京醫學院 | 1952.12--1968.08 | ||
| 閻登山 軍宣隊 |
北京醫學院革命委員會 | 主任 | 1968.09--1973.12 |
| 薛偉民 | 1975.06--1977.09 | ||
| 胡傳揆 | 北京醫學院 | 名譽院長 | 1979.11--1986.03 |
| 馬 旭 | 院長 | 1979.11--1983.01 | |
| 曲綿域 | 1983.01--1985.05 | ||
| 北京醫科大學 | 1985.05--1991.06 | ||
| 王德炳 | 1991.06--2000.03 |
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