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國立北京醫學專門學校,創建於1912年10月26日,是中華民國教育部依靠中國自己的力量開辦的第一所專門傳授西方醫學的國立學校。
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1903年,清朝政府在京師大學堂設立醫學實業館,1904年,醫學實業館改稱醫學館,遷入和平門外八角琉璃井由興勝寺廟宇改建的館舍,1907年停辦。1910年,此館舍被施醫總局(當時的衛生部門)買去,為日後創立國立北京醫學專門學校提供了條件。
1911年,辛亥革命一舉推翻了清王朝,建立了中華民國,在當時向西方學習的風潮下,西醫在中國的地位,有了明顯的變化。1912年9月,中華民國教育部電召從日本留學歸來正在籌建浙江省立醫學專門學校的杭州人湯爾和到京,籌劃創立醫學校事宜。教育部以價銀10,000兩購買了已經停辦的醫學館館舍,劃撥給國立北京醫學專門學校使用,10月16日,中華民國教育部任命組織學教授湯爾和為北京醫學專門學校校長,至此,中國第一所國立西醫學校正式誕生。當時教職工9人,首批學生72人。
1917年,北京醫學專門學校首批學生畢業,共22人。其中包括後來成了著名寄生蟲學家的洪式閭、著名藥理學家的徐佐夏、著名組織胚胎學家的鮑鑒清和陶瓷學家和攝影家的陳萬里(第一個到敦煌的中國人)。
1923年,國立北京醫學專門學校改名為北京醫科大學。
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