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人體內部有維持恆定現象的機制，此有賴於內分泌系統和神經系統共同運作。內分泌系統（Endocrine）是負責調控動物體內各種生理功能正常運作的兩大控制系統之一，由分泌激素（又稱 荷爾蒙）的無導管腺體（內分泌腺）所組成。（另一個控制系統是神經系統。）而激素是一種化學傳導物質，自腺體分泌出來後，藉由體液或進入血液經由循環系統運送到目標的器官而產生作用。
「內分泌」一詞，是指激素的分泌，或對其分泌形態的描述，但也可作為激素的別稱；例如內分泌失調，其實是指激素失調。
在生物化學中，激素可分為三類：
內分泌系統包括了以下的腺體、組織或細胞。
(控制鈣、磷的濃度)
人類的的內分泌系統中包括幾個會產生反饋的系統。一些重要的反饋系統通過下丘腦和垂體來調節[1]
內分泌系統和免疫系統之間有頻繁的雙向交互作用[2]。 皮質醇主要具有免疫抑制效果[3][4]，而多巴胺有免疫調節的功能[5]。另一方面，發炎時產生細胞因子會激化HPA軸，使三個的準位都到達高準位，得以產生負回授[6]。而且細胞因子會使肝臟釋放鐵調素，最終會導致慢性貧血[7]。
內分泌疾病相關常見[9]，包括糖尿病、甲狀腺疾病以及肥胖症等。 內分泌疾病包括異常的激素分泌（垂體腺瘤）、對激素信號的異常反應（甲狀腺機能低下症）、缺乏特定腺體（1型糖尿病、慢性腎衰竭時的紅細胞生成減少）、或是特定組織（如甲狀腺）的結構性腫大（例如毒性多結節性惡性腫瘤）。內分泌的機能減退可能是因為激素儲備喪失、激素分泌不足、萎縮或是失去活性造成。內分泌的機能亢進可能是因為激素分泌過多、喪失抑制機制、增生或是贅生物影響，或是過度刺激。
內分泌疾病可以分為原發（primary）、繼發（secondary）及三發（tertiary）。原發性內分泌疾病會抑制下游腺體的功用，繼發性內分泌疾病是表示有垂體腺的問題。三發性內分泌疾病是和下丘腦及其釋放激素的功能障礙有關[來源請求]。
文昌魚有哈氏凹窩（Hatschek's pit），具有類似腦下腺的結構，能產生類似脊椎動物促性腺激素的物質，並具備原始的激素調控作用。
海鞘有神經腺（Neural gland），是一個囊狀構造，位於神經節下方，以纖毛漏斗開口於咽部的背方。含有升壓素和類似催產素的物質，但其功能仍有待研究，該腺體與文昌魚的哈氏凹窩相似。在咽部有一個類似甲狀腺的分泌醣蛋白的內分泌腺，該腺體的分泌受血液運送的某物質所控制。
松果眼影響八目鰻的沙床幼蟲隨晝夜的體色變化、變態及生殖作用。
腦垂腺會分泌黑素胞刺激素、精胺酸血管加壓素、生殖促進素。黑素胞刺激素的分泌是由松果眼經由下視丘來控制，可影響體色的變化。八目鰻的腦垂腺具有其它脊椎動物的主要特點，但缺乏足額的激素，控制系統較簡單。
沒有腎上腺，只有腎上腺組織，分散在身體各部分，有兩類細胞。腎間細胞（interrenal cell）在前腎一帶大靜脈的下方形成若干簇。腎上組織（suprarenal tissue）很發達，分布在心臟和大型血管壁上，含有兒茶酚胺，心臟組織中有腎上腺素和正腎上腺素。
在前腸和腸的交接處，有成簇的蘭氏濾泡（follicles of Langerhans），其中只發現一種與哺乳動物分泌胰島素相似的β細胞。若用燒灼法破壞此組織，會引起血糖增高；若注射葡萄糖則這些細胞內會形成液泡，故這些細胞與醣類代謝有關。
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