γ-变形菌

γ‐变形菌纲（学名：Gammaproteobacteria）属于细菌界变形菌门，是目前所知的细菌中种类最多的一纲，包括一些医学上和科学研究中很重要的类群，如肠杆菌科（Enterobacteraceae）、弧菌科（Vibrionaceae）和假单胞菌科（Pseudomonadaceae）。很多重要的病原菌属于这个纲，如沙门氏菌属（Salmonella）（肠炎和伤寒）、耶尔辛氏菌属（Yersinia）（鼠疫）、弧菌属（Vibrio）（霍乱）、绿脓杆菌（Pseudomonas aeruginosa）（就医时引发的肺部感染或者囊性纤维化）。重要的模式生物大肠杆菌也属于此纲。

γ-变形菌纲
大肠杆菌（Escherichia coli）
科学分类
域：	细菌域 Bacteria
门：	假单胞菌门 Pseudomonadota
纲：	γ-变形菌纲 Gammaproteobacteria Garrity et al., 2005 emend. Williams & Kelly, 2013
目
着色菌目 Chromatiales 酸硫杆菌目 Acidithiobacillales 黄单胞菌目 Xanthomonadales 心杆菌目 Cardiobacteriales 硫发菌目 Thiotrichales 军团菌目 Legionellales 甲基球菌目 Methylococcales 海洋螺菌目 Oceanospirillales 假单胞菌目 Pseudomonadales 交替单胞菌目 Alteromonadales 弧菌目 Vibrionales 气单胞菌目 Aeromonadales 肠杆菌目 Enterobacteriales 巴斯德氏菌目 Pasteurellales 详见细菌分类表

下级分类

本纲包括以下目：^[1]

• Acidiferrobacterales
• 酸硫杆菌目 Acidithiobacillales
• 气单胞菌目 Aeromonadales ，为Enterobacterales的异名
• 交替单胞菌目 Alteromonadales ，为Enterobacterales的异名
• 砂胞菌目 Arenicellales
  • 砂胞菌科 Arenicellaceae
    • 砂胞菌属 Arenicella Romanenko et al., 2010
      • Arenicella chitinivorans Nedashkovskaya et al., 2013
      • 黄色砂胞菌 Arenicella xantha Romanenko et al., 2010
    • Perspicuibacter Teramoto et al., 2015
      • Perspicuibacter marinus Teramoto et al., 2015
• Beggiatoales
• Berkiellales
• 伯克氏菌目 Burkholderiales
• 心杆菌目 Cardiobacteriales
• 着色菌目 Chromatiales
• Competibacterales
• Coxiellales
• Diplorickettsiales
• Ectothiorhodospirales
• 肠杆菌目 Enterobacterales
• Evansiales
• Francisellales
• Granulosicoccales
• Halothiobacillales
• Immundisolibacterales
• 军团菌目 Legionellales
• 甲基球菌目 Methylococcales
• Nevskiales
• Nitrococcales
• Nitrosococcales
• 海洋螺菌目 Oceanospirillales ，为Pseudomonadales的异名
• 巴斯德氏菌目 Pasteurellales ，为Enterobacterales的异名
• Piscirickettsiales
• Porisulfidales
• 假单胞菌目 Pseudomonadales
• Steroidobacterales
• Tenderiales Chuvochina et al. 2023
• 嗜盐硫杆菌目 Thiohalobacterales Sorokin and Merkel 2023
  • 嗜盐硫杆菌科 Thiohalobacteraceae Sorokin and Merkel 2023
    • 嗜盐硫杆菌属 Thiohalobacter Sorokin et al. 2010
      • Thiohalobacter thiocyanaticus Sorokin et al. 2010^[2]
• Thiohalomonadales Sorokin and Merkel 2023，为Chromatiales Imhoff 2005的异名
• Thiohalorhabdales Sorokin and Merkel 2023
  • Thiohalorhabdaceae Sorokin and Merkel 2023
    • Thiohalorhabdus Sorokin et al. 2008
      • Thiohalorhabdus denitrificans Sorokin et al. 2008
• Thiohalospirales
• Thiomicrospirales
• 硫发菌目 Thiotrichales
• 弧菌目 Vibrionales ，为Enterobacterales的异名
• Woeseiales
• 黄单胞菌目 Xanthomonadales

目的地位未定的科：

• Lysobacteraceae Christensen and Cook 1978
• Procabacteriaceae Garrity et al. 2003

目和科的地位未定的属：

• Acidibacter Falagán & Johnson, 2017
• Alkalimonas Ma et al. 2007
• 嗜碱海洋菌属 Alkalimarinus Zhao et al., 2015
• Arsukibacterium Schmidt et al. 2016
  • Arsukibacterium ikkense Schmidt et al. 2016
  • Arsukibacterium indicum Wang et al. 2022^[3]
  • Arsukibacterium perlucidum (Brettar et al. 2006) Wang et al. 2022
  • Arsukibacterium tuosuense (Zhong et al. 2014) Wang et al. 2022
• Flintibacter Lagkouvardos et al. 2016
• Litorivivens Park et al. 2015
• Marinagarivorans Guo et al. 2016
• Marinibactrum Nishijima et al., 2015
• Methylohalomonas Sorokin et al., 2007
• Methylonatrum Sorokin et al., 2007
• Reidiella Russell et al. 2020
• Thiopontia Van Vliet et al. 2021
  • Thiopontia autotrophica Van Vliet et al. 2021

参考文献

1. Gammaproteobacteria. GBIF. [2023-12-24]. （原始内容存档于2023-09-25）.
2. Sorokin DY, Kovaleva OL, Tourova TP, Muyzer G. Thiohalobacter thiocyanaticus gen. nov., sp. nov., a moderately halophilic, sulfur-oxidizing gammaproteobacterium from hypersaline lakes, that utilizes thiocyanate. Int J Syst Evol Microbiol 2010; 60:444-450.
3. Wang Z, Cheng JH, Zhang XY, Xu F, Fu HH, Li CY, Zhang YZ, Chen XL, Song XY, Zhang XY. Arsukibacterium indicum sp. nov., isolated from deep-sea sediment, and transfer of Rheinheimera tuosuensis and Rheinheimera perlucida to the genus Arsukibacterium as Arsukibacterium tuosuense comb. nov. and Arsukibacterium perlucidum comb. nov. Int J Syst Evol Microbiol 2022; 72:5455.