核糖核酸病毒（英语：RNA virus），又称RNA病毒，其遗传物质为RNA，这些核糖核酸通常是单链RNA（ssRNA），但是也可能是双链RNA（dsRNA）。
不同类型RNA病毒的分类和复制策略
由RNA病毒感染造成的著名人类疾病包括爱滋病（AIDS）、埃博拉出血热、严重急性呼吸道症候群（SARS）、2019冠状病毒病（COVID-19）、流行性感冒、丙型肝炎、西尼罗河热、脊髓灰质炎、麻疹。相较于DNA病毒，RNA病毒具有较高的变异性[1]，因为它们缺乏修正错误的DNA聚合酶机能[2]。
国际病毒分类委员会（ICTV）按照巴尔的摩病毒分类系统的分类方法把RNA病毒定为包含其中第三组（Group III）、第四组（Group IV）、第五组（Group V）的那些病毒，同时不把生活史中出现了DNA的病毒算是RNA病毒。[3]那些把RNA作为遗传物质，但是在复制过程中出现DNA的病毒被称为逆转录病毒：它们包含巴尔的摩分类系统里的第六组（Group VI）。感染人得艾滋病的著名逆转录病毒就有HIV-1和HIV-2。
RNA病毒可以根据它们“RNA的义”进一步分为反义RNA病毒，正义RNA病毒或双义RNA病毒。正义RNA病毒的RNA和mRNA很相似，因此它们能直接在宿主细胞里翻译。反义RNA病毒的RNA则和mRNA互补，所以它们必须被RNA聚合酶转换成正义RNA才能进行翻译。纯化过的正义RNA病毒的RNA，其感染能力没有完整的病毒颗粒强，但是它依然可以直接感染宿主细胞。相比之下，纯化过的反义RNA病毒的RNA则没有感染能力，因为它们需要被转录成正义RNA才能翻译；每一个病毒颗粒都能被转录成几个正义RNA链。双义RNA病毒与反义RNA病毒较为相似，但它们能从反义链及正义链两者翻译基因。[4]
呼肠孤病毒病毒体(reovirus virion)的结构
双链RNA病毒的群体多样，它们寄生的宿主范围很广（人类，动物，植物，真菌，细菌）。这一类病毒包括造成儿童肠胃炎的轮状病毒和造成世界各地的人和动物腹泻，在他们的排泄物里发现的picobirnaviruse。小核糖核酸病毒最近也有报道在一些猪和蓝舌病毒（bluetongue virus），一种会影响牛羊的重要病原体上发现。[5][6]近年来，在确定许多关键病毒蛋白和几种 dsRNA 病毒的病毒体衣壳的原子和亚纳米分辨率结构方面取得了进展，突出了许多这些病毒的结构和复制过程的显着相似之处[7][页码请求]。
- 在自身携带的RNA复制酶作用下，以反链RNA为模板复制出正链RNA。
- 正链RNA一部分作为mRNA，翻译出病毒蛋白质；另一部分作为模板复制出反链RNA，并组成子代±RNA。[注 1]
- ±RNA与蛋白质组装成为子代病毒。
负链RNA病毒包括感染人类的埃博拉病毒、狂犬病病毒、甲型流感病毒和裂谷热病毒，以及感染植物的病毒，如正番茄斑萎病毒属、纤细病毒属和弹状病毒等。[8]（病毒体本身携带RNA复制酶）
- 利用本身所携带的RNA复制酶（RdRp），以亲代负链RNA为模板，制造出互补正链RNA，形成双链形式的复制型中间体。
- 接着此双链可以解链，互补的正链RNA具mRNA的功能，翻译出衣壳蛋白及其他酶。
- 互补的正链RNA又可作为模板，在RdRp作用下，生成大量新的子代负链RNA，达到复制的目的。
- 负链RNA与衣壳蛋白组装成为子代病毒。
The dsRNA Viruses
- 混合病毒科(Amalgaviridae)
- 双核糖核酸病毒科（Birnaviridae）
- 金色病毒科（Chrysoviridae）
- 囊状噬菌体科（Cystoviridae）
- 内源核糖核酸病毒科（Endornaviridae）
- 巨大双分核糖核酸病毒科（Megabirnaviridae）
- 分体病毒科（Partitiviridae）:双分病毒科
- 小双节病毒科(Picobirnaviridae)
- Quadriviridae
- 呼肠孤病毒科（Reoviridae）
- 光滑呼肠孤病毒亚科（Sedoreovirinae）
- 刺突呼肠孤病毒亚科（Spinareovirinae）
- 整体病毒科（Totiviridae）:全病毒科
网巢病毒目（Nidovirales）：成套（套式）病毒目
- 动脉炎病毒科（Arteriviridae）
- 冠状病毒科（Coronaviridae）
- 海洋病毒科（Mesoniviridae）
- 杆状套病毒科（Roniviridae）
小核糖核酸目（Picornavirales）
- 二顺反子病毒科（Dicistroviridae）
- 传染性软化病毒科（Iflaviridae）
- 海洋RNA病毒科（Marnaviridae）
- 微小核糖核酸病毒科（Picornaviridae）：小核糖核酸病毒科
- 伴生豇豆病毒科(Secoviridae)
- Bacillarnavirus
- Labyrnavirus
芜菁黄花叶病毒目(Tymovirales)
- 甲型线形病毒科（Alphaflexiviridae）
- 乙型线形病毒科(Betaflexiviridae)
- 丙型线形病毒科(Gammaflexiviridae)
- 芜菁发黄镶嵌病毒科（Tymoviridae）
（以下未设目）
- Alphatetraviridae
- Alvernaviridae
- 星状病毒科（Astroviridae）
- 杆菌状核糖核酸病毒科（Barnaviridae）
- 甜菜坏死黄脉病毒科Benyviridae
- 甜菜坏死黄脉病毒属（Benyvirus）-代表种：甜菜坏死叶脉变黄病毒（Beet necrotic yellow vein virus）
- 雀麦花叶病毒科（Bromoviridae）
- 杯状病毒科（Caliciviridae）：嵌杯病毒科
- Carmotetraviridae
- 修道院病毒科（Closteroviridae）
- 黄病毒科（Flaviviridae）
- 肝炎病毒科（Hepeviridae）
- 低毒性病毒科（Hypoviridae）：
- 光滑病毒科（Leviviridae）：光滑噬菌体科
- 黄症病毒科（Luteoviridae）
- 裸露核糖核酸病毒(Narnaviridae)
- 野田病毒科('Nodaviridae')
- Permutotetraviridae
- 马铃薯Y病毒科（Potyviridae）
- 披衣病毒科（Togaviridae）
- 番茄丛矮病毒科（Tombusviridae）
- 帚状病毒科(Virgaviridae): 植物杆状病毒科
- 烟草镶嵌病毒属（Tobamovirus）-代表种：烟草镶嵌病毒（Tobacco mosaic virus）
- 烟草脆裂病毒属（Tobravirus）-代表种：烟草脆裂病毒（Tobacco rattle virus）
- 大麦病毒属（Hordeivirus）大麦蛋白病毒属-代表种：大麦条纹镶嵌病毒（Barley stripe mosaic virus）
- 真菌传杆状病毒属（Furovirus）-代表种：土传小麦镶嵌病毒（Soil-borne wheat mosaic virus）
- 花生丛簇病毒属（Pecluvirus）-代表种：花生矮丛矮病毒（Peanut clump virus）**马铃薯病毒属（Pomovirus）马铃薯拖把（帚）状顶部病毒属-代表种：马铃薯拖把状顶部病毒（Potato mop-top virus）
（以下未设科）
- Cilevirus
- Higrevirus
- 悬钩子病毒属（Idaeovirus）-代表种：覆盆子丛矮病毒（Raspberry bushy dwarf virus）（木莓；红刺莓）
- 欧尔密病毒属(Ourmiavirus)
- 一品红潜隐病毒属(Polemovirus)
- 南方菜豆花叶病毒属（Sobemovirus）-代表种：南方豆镶嵌病毒（Southern bean mosaic virus）
The negative-sense ssRNA Viruses
单股反链病毒目（Mononegavirales）
- 玻那病毒科（Bornaviridae）博尔纳病毒科
- 玻纳病毒属（Bornavirus）
- 玻纳疾病病毒（Borna disease virus）
- 纤维病毒科（Filoviridae）
- Cuevavirus
- 伊波拉病毒属（Ebolavirus）埃波拉病毒属
- 萨伊伊波拉病毒(Zaire ebolavirus):伊波拉病毒
- 马尔堡病毒属（Marburgvirus）
- 维多利亚湖马尔堡病毒（Lake Victoria marburgvirus）
- Nyamiviridae
- 副黏液病毒科(Paramyxoviridae):麻疹病毒
- 炮弹病毒科（Rhabdoviridae）杖竿状病毒科
（以下未设目）
- 沙状病毒科（Arenaviridae）砂粒状病毒科
- 本雅病毒科（Bunyaviridae）布尼亚病毒科；崩芽病毒科
- 蛇形病毒科(Ophioviridae)
- 正黏液病毒科（Orthomyxoviridae）
（以下未设科）
- Deltavirus
- Emaravirus
- Tenuivirus
- 叶脉曲张病毒属（Varicosavirus）
Feng, Mingfeng; Li, Zhenghe; Tao, Xiaorong; Wang, Xianbing; Feng, Zhike. Advances in reverse genetics system of plant negative-strand RNA viruses. Chinese Science Bulletin. 2020-12-01, 65 (35): 4073–4083. doi:10.1360/TB-2020-0671.
