新鸟小纲

新鸟小纲（学名：Neoaves，又名：新鸟类）这个鸟类演化支包括现生鸟类绝大部分鸟种，除了古颚下纲（平胸鸟类，如鸸鹋、鸵鸟）和鸡雁小纲（雁形目、鸡形目之类）^[2]，现存大约1万种鸟种中，有将近95%属新鸟小纲^[3]。

新鸟类 化石时期：白垩纪晚期 – 现今, 69–0 Ma PreЄ Є O S D C P T J K Pg N [1]
欧洲椋鸟（Sturnus vulgaris）
科学分类
界：	动物界 Animalia
门：	脊索动物门 Chordata
纲：	鸟纲 Aves
演化支：	今颚类 Neognathae
演化支：	新鸟类 Neoaves Sibley（英语：David Allen Sibley） et al., 1988
演化支
夜鸟类 Strisores 鸽鸨类 Columbaves 鹤形目 Gruiformes 水滨鸟类 Aequorlitornithes 望外鸟类 Inopinaves

新鸟小纲各群开始分化出现得十分快速，大约在白垩纪﹣古近纪灭绝事件左右^[4][5]，因此试图解开他们各群之间的关系，往往会出现许多争议^[6][7]。

谱系学

由于新鸟小纲各群在白垩纪-古近纪灭绝事件期间分化的太过快速^[5]，导致试图解决他们之间的亲缘关系问题异常复杂，尤其在早期的研究中，甚至出现矛盾的研究成果^[6][7][8]。无论如何，近期对新鸟小纲的一些大规模谱系基因学（英语：phylogenomic）研究，已经对新鸟小纲下的目和总目的定义导引出许多进展，虽然这些研究并未对高阶的鸟群分类位阶取得共识^{[8][9][10][11]}。埃里希·贾维斯等人在2014年针对48分类群所做的基因学研究，把新鸟小纲分成两个主演化支：鸽鸨类和雀类，而理查德·普鲁姆等人在2015年分析198个分类群，则恢复许多新鸟小纲里、早期分化出的许多分类群^[9][10]。2017年，雷迪等人使用延伸的资料组重新分析，认为这只不过是排序资料型态的差异，编码序列对普鲁姆等人的分类位阶有利^[11]。对这种分类位阶持反对意见者，像瑞典乌普萨拉大学的亚历山大·苏，在2016年就透过更大型的谱系基因学研究，甚至提出有9个演化支的实多分支（英语：hard polytomy），直接就隶属在新鸟小纲之下^[12]。到了2019年，美国古生物学家彼得·厚德等人的分析结果，重新采用鸽鸨类，以及搭配6个实多分支的雀类^[13]。

总合来说，这些研究都同意有许多总目，雷迪在2017年取了一个特殊的名称叫“大哉七”，搭配3个独立目，构成新鸟小纲^[11]。有意思的是，他们都包含一大群鸟种的陆鸟演化支──陆鸟类，以及一大群鸟种的水鸟演化支──水滨鸟类。下面是雷迪定义的鸟类分类群：

• 大哉七总目演化支：

1. 陆鸟类 Telluraves
2. 水滨鸟类 Aequornithes
3. 日鳽总目 Eurypygimorphae（日鳽、鹭鹤和热带鸟）
4. 鸨形总目 Otidimorphae（蕉鹃、鸨和杜鹃）
5. 夜鸟类 Strisores（夜鹰、雨燕和蜂鸟）
6. 鸽形总目 Columbimorphae（拟鹑、沙鸡和鸠鸽）
7. 奇迹鸟类 Mirandornithes（火鹤和鸊鷉）

• 3个独立目：
  • 麝雉目 Opisthocomiformes（麝雉科）
  • 鹤形目 Gruiformes（鹤科和秧鸡科）
  • 鸻形目 Charadriiformes（涉禽, 鸥、海雀科）

Jarvis et al. (2014)[2]

鸠鸽类 Columbea   奇迹鸟类 Mirandornithes（红鹤、鸊鷉）     鸽形总目 Columbimorphae (鸠鸽、拟鹑、沙鸡)     雀类 Passerea   Otidae（英语：Otidae）   鸨形总目 Otidimorphae（杜鹃、鸨、蕉鹃）     夜鸟类 Strisores（蜂鸟、雨燕、夜鹰）           Gruae（英语：Gruae）   麝雉目 Opisthocomiformes（麝雉）   鹤形总目 Gruimorphae   鹤形目　Gruiformes（鹤、秧鸡）     鸻形目　Charadriiformes（涉禽）           鹭形类 Ardeae   水鸟类 Aequornithes（核心水鸟）     日鳽总目 Eurypgimorphae（日鳽、鹭鹤、热带鸟）     陆鸟类 Telluraves   非洲禽类 Afroaves     南鸟类 Australaves   （核心陆鸟）

Prum et al. (2015)[14]
夜鸟类 Strisores（蜂鸟、雨燕、夜鹰）       鸽鸨类   鸽形总目 Columbimorphae (鸠鸽、拟鹑、沙鸡)     鸨形总目 Otidimorphae（杜鹃、鸨、蕉鹃）           鹤形目　Gruiformes（鹤、秧鸡）     水滨鸟类 Aequorlitornithes     鸻形目　Charadriiformes（涉禽）     奇迹鸟类 Mirandornithes（红鹤、鸊鷉）     鹭形类 Ardeae   水鸟类 Aequornithes（核心水鸟）     日鳽总目 Eurypgimorphae（日鳽、鹭鹤、热带鸟）     (水鸟) 望外鸟类 Inopinaves   麝雉目 Opisthocomiformes（麝雉）     陆鸟类 Telluraves（核心陆鸟）

Suh (2016) ─a hard polytomy[12]
鸽形总目 Columbimorphae (鸠鸽、拟鹑、沙鸡)     鸨形总目 Otidimorphae（杜鹃、鸨、蕉鹃）     夜鸟类 Strisores（蜂鸟、雨燕、夜鹰）     麝雉目 Opisthocomiformes（麝雉）     鹤形目　Gruiformes（鹤、秧鸡）     鸻形目　Charadriiformes（涉禽）     奇迹鸟类 Mirandornithes（红鹤、鸊鷉）     鹭形类 Ardeae   水鸟类 Aequornithes（核心水鸟）     日鳽总目 Eurypgimorphae（日鳽、鹭鹤、热带鸟）         陆鸟类 Telluraves   非洲禽类 Afroaves     南鸟类 Australaves   （核心陆鸟）

新鸟小纲分化的不同提议比较

采用Braun & Kimball在2021年提出的总目分类树，下面的分支图说明所有新鸟小纲之下各目的拟议关系^[15]

新鸟小纲

奇迹鸟类   火烈鸟目 Phoenicopteriformes     䴙䴘目 Podicipediformes   Mirandornithes 鸽形总目   鸽形目 Columbiformes       拟鹑目 Mesitornithiformes     沙鸡目 Pterocliformes     Columbimorphae 雀类     鸨形目 Otidiformes     鹃形目 Cuculiformes       蕉鹃目 Musophagiformes     鹤形目 Gruiformes     鸻形目 Charadriiformes     麝雉目 Opisthocomiformes     夜鹰目 Caprimulgiformes   鹭形类 日鳽总目   鹲形目 Phaethontiformes     日鳽目 Eurypygiformes   Eurypygimorphae 水鸟类   潜鸟目 Gaviiformes[16]     南极鸟类   鹱形目 Procellariiformes     企鹅目 Sphenisciformes   Austrodyptornithes     鹳形目 Ciconiiformes       鲣鸟目 Suliformes     鹈形目 Pelecaniformes         Aequornithes Ardeae 陆鸟类 鹰形总目   美洲鹫目 Cathartiformes     鹰形目 Accipitriformes   Accipitrimorphae   鸮形目 Strigiformes   佛法僧总目   鼠鸟目 Coliiformes   穴鸟类   鹃𫁡目 Leptosomiformes       咬鹃目 Trogoniformes   䴕翠鸟类   犀鸟目 Bucerotiformes   Picodynastornithes   佛法僧目 Coraciiformes     䴕形目 Piciformes     Picocoraciae   Cavitaves Coraciimorphae 南鸟类   叫鹤目 Cariamiformes   真隼形类   隼形目 Falconiformes   鹦雀总目   鹦形目 Psittaciformes     雀形目 Passeriformes   Psittacopasserae Eufalconimorphae Australaves Telluraves Passerea

Neoaves

参考文献

1. Van Tuinen M. (2009) Birds (Aves). In The Timetree of Life, Hedges SB, Kumar S (eds). Oxford: Oxford University Press; 409–411.
2. Jarvis, E.D. (2014) Whole genome analyzes resolve the early branches in the tree of life of modern birds （页面存档备份，存于互联网档案馆）.
3. Ericson, Per G.P.; et al. Diversification of Neoaves: integration of molecular sequence data and fossils (PDF). Biology Letters. 2006, 2 (4): 543–547 [2019-08-29]. PMC 1834003 . PMID 17148284. doi:10.1098/rsbl.2006.0523. （原始内容 (PDF)存档于2009-03-25）.
4. McCormack, J.E.; et al. A phylogeny of birds based on over 1,500 loci collected by target enrichment and high-throughput sequencing. PLOS ONE. 2013, 8 (1): e54848 [2020-10-12]. doi:10.1371/journal.pone.0054848. （原始内容存档于2020-05-05）.
5. Claramunt, S.; Cracraft, J. A new time tree reveals Earth history's imprint on the evolution of modern birds. Sci Adv. 2015, 1 (11): e1501005. PMC 4730849 . PMID 26824065. doi:10.1126/sciadv.1501005.
6. Mayr G. (2011) Metaves, Mirandornithes, Strisores and other novelties - a critical review of the higher-level phylogeny of neornithine birds （页面存档备份，存于互联网档案馆）. J Zool Syst Evol Res. 49:58-76.
7. Matzke, A. et al. (2012) Retroposon insertion patterns of neoavian birds: strong evidence for an extensive incomplete lineage sorting era （页面存档备份，存于互联网档案馆） Mol. Biol. Evol.
8. Braun, Edward L.; Cracraft, Joel; Houde, Peter. Resolving the Avian Tree of Life from Top to Bottom: The Promise and Potential Boundaries of the Phylogenomic Era. Avian Genomics in Ecology and Evolution. 2019: 151–210. ISBN 978-3-030-16476-8. doi:10.1007/978-3-030-16477-5_6.
9. Jarvis, E.D.; et al. Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds. Science. 2014, 346 (6215): 1320–1331 [2020-05-24]. PMC 4405904 . PMID 25504713. doi:10.1126/science.1253451. （原始内容存档于2015-09-24）.
10. Prum, Richard O.; Berv, Jacob S.; Dornburg, Alex; Field, Daniel J.; Townsend, Jeffrey P.; Lemmon, Emily Moriarty; Lemmon, Alan R. A comprehensive phylogeny of birds (Aves) using targeted next-generation DNA sequencing. Nature. 2015, 526 (7574): 569–573. ISSN 0028-0836. PMID 26444237. doi:10.1038/nature15697.
11. Reddy, Sushma; Kimball, Rebecca T.; Pandey, Akanksha; Hosner, Peter A.; Braun, Michael J.; Hackett, Shannon J.; Han, Kin-Lan; Harshman, John; Huddleston, Christopher J.; Kingston, Sarah; Marks, Ben D.; Miglia, Kathleen J.; Moore, William S.; Sheldon, Frederick H.; Witt, Christopher C.; Yuri, Tamaki; Braun, Edward L. Why Do Phylogenomic Data Sets Yield Conflicting Trees? Data Type Influences the Avian Tree of Life more than Taxon Sampling. Systematic Biology. 2017, 66 (5): 857–879. ISSN 1063-5157. PMID 28369655. doi:10.1093/sysbio/syx041.
12. Suh, Alexander. The phylogenomic forest of bird trees contains a hard polytomy at the root of Neoaves. Zoologica Scripta. 2016, 45: 50–62. ISSN 0300-3256. doi:10.1111/zsc.12213.
13. Houde, Peter; Braun, Edward L.; Narula, Nitish; Minjares, Uriel; Mirarab, Siavash. Phylogenetic Signal of Indels and the Neoavian Radiation. Diversity. 2019, 11 (7): 108. ISSN 1424-2818. doi:10.3390/d11070108.
14. Prum, R.O.; et al. A comprehensive phylogeny of birds (Aves) using targeted next-generation DNA sequencing. Nature. 2015, 526: 569–573 [2020-05-24]. PMID 26444237. doi:10.1038/nature15697. （原始内容存档于2020-05-29）.
15. Braun, E.L. & Kimball, R.T. (2021) Data types and the phylogeny of Neoaves. Birds, 2(1), 1-22; https://doi.org/10.3390/birds2010001 （页面存档备份，存于互联网档案馆）
16. Boyd, John. NEORNITHES: 46 Orders (PDF). John Boyd's website. 2007 [30 December 2017]. （原始内容存档 (PDF)于2010-08-06）.

外部链接

• Sushma Reddy （页面存档备份，存于互联网档案馆）
• Alexander Suh