Fez-подобные белки

Fez-подобные белки — семейство белков эукариотических организмов, которое, как полагают, вовлечено в процессы роста аксонов нейронов и образования пучков нервных волокон^[9]. N-конец аминокислотной последовательности этих белков менее эволюционно консервативен, чем C-конец, и обладает высокой кислотностью^[9].

Fez-подобные белки
Идентификаторы
Псевдонимы	FEZF1, FEZ, ZNF312B, HH22, FEZ family zinc finger 1
Внешние ID	OMIM: 613301 MGI: 1920441 HomoloGene: 19252 GeneCards: FEZF1
Расположение гена (человек) Хр. 7-я хромосома человека[1] Локус 7q31.32 Начало 122,301,303 bp[1] Конец 122,310,691 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 6-я хромосома мыши[2] Локус 6|6 A3.1 Начало 23,245,043 bp[2] Конец 23,248,361 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в olfactory zone of nasal mucosa left testis right testis Наибольшая экспрессия в external naris respiratory epithelium lumbar spinal ganglion cредний мозг lateral hypothalamus Дополнительные справочные данные BioGPS н/д
Генная онтология Молекулярная функция ДНК-связывающий связывание с ионом металла RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding nucleic acid binding DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Компонент клетки клеточное ядро цитозоль Биологический процесс forebrain anterior/posterior pattern specification дифференцировка клеток ДНК-зависимая регуляция транскрипции neuron migration negative regulation of transcription by RNA polymerase II транскрипция, ДНК-зависимая развитие нервной системы ДНК-зависимая позитивная регуляция транскрипции развитие многоклеточного организма telencephalon development positive regulation of neuron differentiation развитие переднего мозга olfactory bulb development негативная регуляция пролиферации клеток Аксональное наведение cell dedifferentiation regulation of neurogenesis Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 389549 73191 Ensembl ENSG00000128610 ENSMUSG00000029697 UniProt A0PJY2 Q0VDQ9 RefSeq (мРНК) NM_001024613 NM_001160264 NM_028462 RefSeq (белок) NP_001019784 NP_001153736 NP_082738 Локус (UCSC) Chr 7: 122.3 – 122.31 Mb Chr 6: 23.25 – 23.25 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Fez-подобные белки
Идентификаторы
Псевдонимы	FEZF2, FEZ, FEZL, TOF, ZFP312, ZNF312, FKSG36, FEZ family zinc finger 2
Внешние ID	OMIM: 607414 MGI: 1859823 HomoloGene: 9957 GeneCards: FEZF2
Расположение гена (человек) Хр. 3-я хромосома человека[5] Локус 3p14.2 Начало 62,369,681 bp[5] Конец 62,374,324 bp[5]
Расположение гена (Мышь) Хр. 14-я хромосома мыши[6] Локус 14|14 A1 Начало 10,121,574 bp[6] Конец 10,127,669 bp[6]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в ventricular zone sural nerve Region I of hippocampus proper secondary oocyte Наибольшая экспрессия в ventricular zone CA3 field Region I of hippocampus proper hippocampus proper Дополнительные справочные данные BioGPS н/д
Генная онтология Молекулярная функция ДНК-связывающий связывание с ионом металла nucleic acid binding RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific chromatin binding sequence-specific DNA binding RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding chromatin DNA binding DNA-binding transcription factor activity Компонент клетки клеточное ядро Биологический процесс дифференцировка клеток ДНК-зависимая регуляция транскрипции транскрипция, ДНК-зависимая развитие нервной системы развитие многоклеточного организма negative regulation of transcription by RNA polymerase II transcription by RNA polymerase II Аксональное наведение axonal fasciculation locomotory behavior негативная регуляция пролиферации клеток dendrite development telencephalon development развитие зубчатой извилины forebrain anterior/posterior pattern specification cerebral cortex GABAergic interneuron migration cerebral cortex neuron differentiation commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain развитие переднего мозга cell dedifferentiation negative regulation of neuron differentiation positive regulation of neuron differentiation ДНК-зависимая позитивная регуляция транскрипции положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор neuron fate determination regulation of neurogenesis regulation of axon guidance Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 55079 54713 Ensembl ENSG00000153266 ENSMUSG00000021743 UniProt Q8TBJ5 Q9ESP5 RefSeq (мРНК) NM_018008 NM_080433 RefSeq (белок) NP_060478 NP_536681 Локус (UCSC) Chr 3: 62.37 – 62.37 Mb Chr 14: 10.12 – 10.13 Mb Поиск по PubMed Искать[7] Искать[8]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

FEZ-подобные белки
Идентификаторы
Символ	FEZ
Pfam	PF07763
InterPro	IPR011680
Доступные структуры белков
Pfam	структуры
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	3D-модель

Гомологичный ген у червя Caenorhabditis elegans, называемый UNC-76, играет структурную и организующую, а также сигнальную роль в управлении процессами роста и удлинения аксонов нейронов и в их прикреплении (адгезии) к терминальным нейронам места назначения, и в управлении процессом формирования пучков нервных волокон из отдельных аксонов (то есть процессом фасцикуляции аксонов). Особенно эффективно воздействует ген UNC-76 на рост и развитие аксона и на его прикрепление к нейронам места назначения при наличии на пути роста аксона других нервных клеток^[10]. Такая же роль постулирована и для других белков семейства FEZ^[9]. К белкам семейства Fez относятся, в частности, белки — репрессоры FEZ1 и Fez2, а также белки — факторы транскрипции ДНК — цинковые пальцы FEZF1 и FEZF2^[9].

Для ряда гомологичных белков семейства Fez показана способность взаимодействовать с N-концевым вариабельным доменом V1 протеинкиназы C типа дзета. Это приводит к перемещению молекулы белка семейства Fez, вступившей в такое взаимодействие, в цитоплазму нервной клетки, по крайней мере у млекопитающих^[10].

C-концевой домен белков семейства Fez, вероятно, участвует в образовании связей с регуляторным доменом протеинкиназы C типа дзета^[10].

Ряд членов семейства Fez-подобных белков, в частности белки FEZ1 и Fez2, согласно математической модели, должны иметь вторичную структуру, называемую катушечной катушкой^[10][11]. Предполагается, что такая вторичная структура должна позволять этим белкам взаимодействовать с сигнальными белками семейства RhoA^[10]. Согласно имеющимся математическим моделям, вторичные структуры белков FEZ1 и Fez2 не содержат других характерных структурных мотивов. В то же время белки FEZF1 и FEZF2 имеют характерную для факторов транскрипции вторичную структуру, в которой имеются цинковые пальцы и участок для связывания ДНК^[11].

Некоторые члены семейства Fez-подобных белков, такие, как FEZ1, экспрессируются почти исключительно в головном мозге. В то же время некоторые другие члены семейства Fez-подобных белков, такие, как Fez2, экспрессируются также и в других тканях. Функции этих белков, в частности белка Fez2, во внемозговых тканях пока окончательно не выяснена, но, как предполагается, сходны с их функциями в головном мозге, например, управление ростом, развитием и дифференцировкой клеток^[11].

Примечания

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000128610 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029697 - Ensembl, May 2017
3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000153266 - Ensembl, May 2017
6. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021743 - Ensembl, May 2017
7. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
8. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
9. Bloom L., Horvitz H.R. The Caenorhabditis elegans gene unc-76 and its human homologs define a new gene family involved in axonal outgrowth and fasciculation (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — April (vol. 94, no. 7). — P. 3414—3419. — doi:10.1073/pnas.94.7.3414. — PMID 9096408. — PMC 20384.
10. Kuroda S., Nakagawa N., Tokunaga C., Tatematsu K., Tanizawa K. Mammalian homologue of the Caenorhabditis elegans UNC-76 protein involved in axonal outgrowth is a protein kinase C zeta-interacting protein (англ.) // J. Cell Biol.^[англ.] : journal. — 1999. — February (vol. 144, no. 3). — P. 403—411. — doi:10.1083/jcb.144.3.403. — PMID 9971736. — PMC 2132904.
11. Fujita T., Ikuta J., Hamada J., Okajima T., Tatematsu K., Tanizawa K., Kuroda S. Identification of a tissue-non-specific homologue of axonal fasciculation and elongation protein zeta-1 (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun. : journal. — 2004. — January (vol. 313, no. 3). — P. 738—744. — doi:10.1016/j.bbrc.2003.12.006. — PMID 14697253.

Эта статья использует текст из общественное достояние Pfam и InterPro IPR011680