60S рибосомный белок L12

60S рибосомальный белок L12 - рибосомальный белок, который в геноме человека кодируется геном RPL12.^[5][6]

60S рибосомный белок L12
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 4V6X, 5AJ0, 3J92, 4V5Z, 5A8L
Идентификаторы
Псевдонимы	RPL12, L12, ribosomal protein L12
Внешние ID	OMIM: 180475 MGI: 98002 HomoloGene: 128047 GeneCards: RPL12
Расположение гена (человек) Хр. 9-я хромосома человека[1] Локус 9q33.3 Начало 127,447,674 bp[1] Конец 127,451,406 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 2-я хромосома мыши[2] Локус 2|2 B Начало 32,851,571 bp[2] Конец 32,855,357 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в olfactory zone of nasal mucosa skin of abdomen skin of leg lactiferous gland Наибольшая экспрессия в ventricular zone Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция связывание с белками плазмы structural constituent of ribosome rRNA binding RNA binding large ribosomal subunit rRNA binding Компонент клетки цитозоль экзосома мембрана cytosolic large ribosomal subunit фокальные контакты рибосома внеклеточный матрикс клеточное ядро ядрышко цитоплазма постсинаптическое уплотнение large ribosomal subunit Биологический процесс translational initiation SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane нонсенс-опосредованный распад ribosomal large subunit assembly viral transcription Биосинтез белка rRNA processing Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 6136 269261 Ensembl ENSG00000197958 ENSMUSG00000038900 UniProt P30050 P35979 RefSeq (мРНК) NM_000976 NM_009076 RefSeq (белок) NP_000967 NP_033102 Локус (UCSC) Chr 9: 127.45 – 127.45 Mb Chr 2: 32.85 – 32.86 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Функция

Рибосомы, клеточные органеллы, обеспечивающие синтез белка (трансляцию), состоят из двух субъединиц: малой - с коэффициентом седиментации - 40S и большой - 60S субъединицы. Эти субъединицы образованы 4 видами РНК и около 80 структурно различными белками. Ген RPL12 кодирует рибосомальный белок, являющийся компонентом 60S субъединицы. Белок принадлежит к L11P семейству рибосомных белков. RPL12 локализуется в цитоплазме клетки. Белок связывает непосредственно 26S рРНК. Ген RPL12 котранскрибируется с мякРНК U65, ген которой расположен в четвёртом интроне гена RPL12. Как это характерно для генов, кодирующих рибосомальные белки, в разных частях генома располагаются несколько процессируемых псевдогенов.

Взаимодействие

Показано, что RPL12 взаимодействует с CDC5L.^[7]

См. также

• 40S рибосомальный белок S28

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000197958 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038900 - Ensembl, May 2017
3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Chu W., Presky D. H., Swerlick R. A., Burns D. K. The primary structure of human ribosomal protein L12 (англ.) // Nucleic Acids Res : journal. — 1993. — March (vol. 21, no. 3). — P. 749. — doi:10.1093/nar/21.3.749. — PMID 8441690. — PMC 309184.
6. Entrez Gene: RPL12 ribosomal protein L12  (неопр.).
7. Ajuh P., Kuster B., Panov K., Zomerdijk J. C., Mann M., Lamond A. I. Functional analysis of the human CDC5L complex and identification of its components by mass spectrometry (англ.) // EMBO J. : journal. — 2000. — December (vol. 19, no. 23). — P. 6569—6581. — doi:10.1093/emboj/19.23.6569. — PMID 11101529. — PMC 305846.

Дальнейшее чтение