W skład ministerstwa wchodził Gabinet Polityczny Ministra oraz następujące komórki organizacyjne[6]:
- Departament Administrowania Obrotem
- Departament Analiz i Prognoz Ekonomicznych
- Departament Bezpieczeństwa Energetycznego
- Departament Dialogu i Partnerstwa Społecznego
- Departament Europejskich Spraw Gospodarczych
- Departament Funduszy
- Departament Informatyki
- Departament Inicjatywy INTERREG
- Departament Innowacyjności
- Departament Instrumentów Finansowych
- Departament Inwestycji Zagranicznych i Promocji Eksportu
- Departament Konkurencyjności Gospodarki
- Departament Kontroli Eksportu
- Departament Koordynacji Funduszu Spójności
- Departament Koordynacji Polityki Strukturalnej
- Departament Międzynarodowej Współpracy Dwustronnej
- Departament Polityki Handlowej
- Departament Polityki Przemysłowej
- Departament Polityki Regionalnej
- Departament Prawa Pracy
- Departament Programów Offsetowych
- Departament Programów Pomocowych i Pomocy Technicznej
- Departament Przedsiębiorczości
- Departament Rynku Pracy
- Departament Spraw Obronnych
- Departament Turystyki
- Departament Unii Europejskiej
- Departament Warunków Pracy
- Departament Wdrażania Europejskiego Funduszu Społecznego
- Departament Wdrażania Programów Rozwoju Regionalnego
- Departament Wynagrodzeń
- Departament Zarządzania Europejskim Funduszem Społecznym
- Departament Zarządzania Programem Wzrostu Konkurencyjności Przedsiębiorstw
- Biuro Administracyjno-Budżetowe
- Biuro Dyrektora Generalnego
- Biuro Kadr i Szkolenia
- Biuro Kontroli Resortowej
- Biuro Oceny Legalności Decyzji Nacjonalizacyjnych
- Biuro Ochrony Informacji Niejawnych
- Biuro Prawne
- Sekretariat Ministra
- Stanowisko do Spraw Audytu Wewnętrznego
- Stanowisko do Spraw Komunikacji Społecznej.
Organy nadzorowane przez ministra[5]:
Organy podlegające ministrowi:
Jednostki organizacyjne podległe ministrowi lub nadzorowane[7]:
- Agencja Rezerw Materiałowych
- Beskidzki Instytut Tekstylny w Bielsku-Białej
- Branżowy Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Maszyn Elektrycznych „Komel” w Katowicach
- Centralne Laboratorium Akumulatorów i Ogniw w Poznaniu
- Centralne Laboratorium Naftowe w Warszawie
- Centralne Laboratorium Ochrony Radiologicznej w Warszawie
- Centralne Laboratorium Przemysłu Obuwniczego w Krakowie
- Centralny Instytut Ochrony Pracy – Państwowy Instytut Badawczy
- Centralny Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Maszyn Włókienniczych „POLMATEX-CENARO” w Łodzi
- Centralny Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Opakowań w Warszawie
- Centralny Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Przemysłu Izolacji Budowlanej w Katowicach
- Centralny Ośrodek Chłodnictwa „COCH” w Krakowie
- Centrum Badań i Promocji Biznesu „Ekorno” w Łodzi (w likwidacji)
- Centrum Badawczo-Konstrukcyjne Obrabiarek w Pruszkowie
- Centrum Doskonalenia Kadr Specjalistycznych w Chorzowie-Batorym
- Centrum Elektryfikacji i Automatyzacji Górnictwa „Emag” w Katowicach
- Centrum Mechanizacji Górnictwa KOMAG w Gliwicach
- Centrum Partnerstwa Społecznego „Dialog” im. A. Bączkowskiego
- Centrum Techniki Morskiej – Ośrodek Badawczo-Rozwojowy w Gdyni
- Główna Biblioteka Pracy i Zabezpieczenia Społecznego
- Główny Instytut Górnictwa w Katowicach
- Instytut Architektury Tekstyliów w Łodzi
- Instytut Automatyki Systemów Energetycznych we Wrocławiu
- Instytut Barwników i Produktów Organicznych w Zgierzu
- Instytut Biotechnologii i Antybiotyków w Warszawie
- Instytut Celulozowo-Papierniczy w Łodzi
- Instytut Chemicznej Przeróbki Węgla w Zabrzu
- Instytut Chemii i Techniki Jądrowej w Warszawie
- Instytut Chemii Nieorganicznej w Gliwicach
- Instytut Chemii Przemysłowej im. Prof. I. Mościckiego w Warszawie
- Instytut Ciężkiej Syntezy Organicznej „Blachownia” w Kędzierzynie-Koźlu
- Instytut Elektrotechniki w Warszawie
- Instytut Energetyki w Warszawie
- Instytut Energii Atomowej w Otwocku-Świerku
- Instytut Farmaceutyczny w Warszawie
- Instytut Fizyki Plazmy i Laserowej Mikrosyntezy im. S. Kaliskiego w Warszawie
- Instytut Inżynierii MateriaΠów Włókienniczych w Łodzi
- Instytut Komputerowych Systemów Automatyki i Pomiarów we Wrocławiu
- Instytut Koniunktur i Cen Handlu Zagranicznego w Warszawie
- Instytut Logistyki i Magazynowania w Poznaniu
- Instytut Lotnictwa w Warszawie
- Instytut Maszyn Matematycznych w Warszawie
- Instytut Materiałów Ogniotrwałych w Gliwicach
- Instytut Mechaniki Precyzyjnej w Warszawie;
- Instytut Mechanizacji Budownictwa i Górnictwa Skalnego w Warszawie
- Instytut Metali Nieżelaznych w Gliwicach
- Instytut Metalurgii Żelaza im. St. Staszica w Gliwicach
- Instytut Mineralnych Materiałów Budowlanych w Opolu
- Instytut Metalurgii Żelaza im. St. Staszica w Gliwicach
- Instytut Nafty i Gazu w Krakowie
- Instytut Obróbki Plastycznej w Poznaniu
- Instytut Obróbki Skrawaniem w Krakowie
- Instytut Odlewnictwa w Krakowie
- Instytut Optyki Stosowanej w Warszawie
- Instytut Organizacji i Zarządzania w Przemyśle „Orgmasz” w Warszawie
- Instytut Pojazdów Szynowych „TABOR” w Poznaniu
- Instytut Pracy i Spraw Socjalnych
- Instytut Problemów Jądrowych im. A. Sołtana w Otwocku-Świerku
- Instytut Przemysłu Gumowego „Stomil” w Piastowie
- Instytut Przemysłu Organicznego w Warszawie
- Instytut Przemysłu Skórzanego w Łodzi
- Instytut Przemysłu Tworzyw i Farb w Gliwicach (w likwidacji)
- Instytut Przetwórstwa Tworzyw Sztucznych „Metalchem” w Toruniu
- Instytut Rynku Wewnętrznego i Konsumpcji w Warszawie
- Instytut Spawalnictwa w Gliwicach
- Instytut Systemów Sterowania w Chorzowie
- Instytut Szkła i Ceramiki w Warszawie
- Instytut Techniki i Technologii Dziewiarskich „TRICOTEXTIL” w Łodzi
- Instytut Techniki Cieplnej w Łodzi
- Instytut Techniki Grzewczej i Sanitarnej w Radomiu
- Instytut Techniki i Aparatury Medycznej ITAM w Zabrzu
- Instytut Technologii Drewna w Poznaniu
- Instytut Technologii Eksploatacji w Radomiu
- Instytut Technologii Elektronowej w Warszawie
- Instytut Technologii Materiałów Elektronicznych w Warszawie
- Instytut Technologii Nafty im. prof. St. Piłata w Krakowie
- Instytut Tele- i Radiotechniczny w Warszawie
- Instytut Turystyki w Warszawie
- Instytut Włókien Chemicznych w Łodzi
- Instytut Włókien Naturalnych w Poznaniu
- Instytut Włókiennictwa w Łodzi
- Instytut Wzornictwa Przemysłowego w Warszawie
- Krajowe Biuro Funduszu Gwarantowanych Świadczeń Pracowniczych
- Ochotnicze Hufce Pracy
- Ośrodek Badawczo-Konstrukcyjny „Koprotech” w Warszawie
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Aparatury Manewrowej „ORAM” w Łodzi
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Automatyki i Urządzeń Precyzyjnych w Łodzi
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Budownictwa Górniczego „BUDOKOP” w Mysłowicach
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Budownictwa Węglowego w Katowicach (w likwidacji)
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Budowy Urządzeń Chemicznych „Cebea” w Krakowie
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Dźwignic i Urządzeń Transportowych DETRANS w Bytomiu
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Elementów i Układów Pneumatyki w Kielcach
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy „Erg” w Jaśle (w likwidacji)
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Gospodarki Energetycznej w Katowicach
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Gospodarki Remontowej Energetyki we Wrocławiu
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Górnictwa Surowców Chemicznych „Chemkop” w Krakowie
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Izotopów – POLATOM w Otwocku-Świerku
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Kauczuków i Tworzyw Winylowych w Oświęcimiu
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Maszyn Przędzalnictwa Wełny „Belmatex” w Bielsku-Białej
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Maszyn Ziemnych i Transportowych w Stalowej Woli (w likwidacji)
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Mechanizacji Pakowania „EMPAK” w Krakowie
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Metrologii Elektrycznej „METROL” w Zielonej Górze
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Motoreduktorów i Reduktorów „Redor” w Bielsku-Białej
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Podstaw Technologii i Konstrukcji Maszyn „TEKOMA” w Warszawie
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy „PREDOM-OBR” w Warszawie
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Przemysłu Oponiarskiego „Stomil” w Poznaniu
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Przemysłu Płyt Drewnopochodnych w Czarnej Wodzie
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Przemysłu Rafineryjnego w Płocku
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Przemysłu Siarkowego „Siarkopol” w Tarnobrzegu (w likwidacji)
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Przemysłu Urządzeń Klimatyzacyjno-Wentylacyjnych i Odpylających BAROWENT w Katowicach (w likwidacji)
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Samochodów Małolitrażowych „BOSMAL” w Bielsku-Białej
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy „SKARŻYSKO” w Skarżysku-Kamiennej (w likwidacji)
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Sprzętu Mechanicznego w Tarnowie
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Środków Organizacyjno-Technicznych „Prebot” w Radomiu
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Urządzeń Mechanicznych OBRUM w Gliwicach
- Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Urządzeń Sterowania Napędów w Toruniu
- Ośrodek Centralnego Szkolenia Maszynistów w Mińsku Mazowieckim
- Ośrodek Centralnego Szkolenia Maszynistów w Radomiu
- Ośrodek Centralnego Szkolenia Maszynistów we Włocławku
- Ośrodek Centralnego Szkolenia Maszynistów we Wrocławiu
- Ośrodek Doskonalenia Kadr w Kępnie
- Ośrodek Doskonalenia Kadr w Mysłowicach
- Ośrodek Studiów Wschodnich
- Polska Agencja Rozwoju Przedsiębiorczości
- Polska Organizacja Turystyczna
- Polskie Centrum Akredytacji
- „Poltegor-Instytut” Instytut Górnictwa Odkrywkowego we Wrocławiu;
- Przemysłowy Instytut Automatyki i Pomiarów „PIAP” w Warszawie
- Przemysłowy Instytut Elektroniki w Warszawie
- Przemysłowy Instytut Maszyn Budowlanych w Kobyłce
- Przemysłowy Instytut Maszyn Rolniczych w Poznaniu
- Przemysłowy Instytut Motoryzacji w Warszawie
- Przemysłowy Instytut Telekomunikacji w Warszawie
- Urząd Dozoru Technicznego
- Wydziały ekonomiczno-handlowe ambasad, konsulatów i stałych przedstawicielstw Rzeczypospolitej Polskiej za granicą
- Zakład Unieszkodliwiania Odpadów Promieniotwórczych w Otwocku-Świerku
- Zakład Wydawniczo-Poligraficzny Ministerstwa Gospodarki i Pracy