Formowanie jednostki rozpoczęto 1 września 2010 na podstawie rozkazu Szefa Inspektoratu Wsparcia Sił Zbrojnych nr Pf-83/Org. z dnia 5 sierpnia 2010. Baza rozpoczęła działalność z dniem 1 stycznia 2011.
Jednostkę sformowano na bazie Garnizonowego Ośrodka Mobilizacyjnego w Krakowie, w kompleksie przy ulicy Montelupich 3 i podporządkowano jej między innymi:
12 lutego 2013 sekretarz stanu Czesław Mroczek działając z upoważnienia Ministra Obrony Narodowej nadał 3 Regionalnej Bazie Logistycznej w Krakowie imię patrona - Hetmana Wielkiego Koronnego Stanisława Jana Jabłonowskiego[1].
Decyzją Nr 288/MON Ministra Obrony Narodowej z 8 października 2013 wprowadzono odznakę pamiątkową oraz oznakę rozpoznawczą Bazy[2].
3 Regionalna Baza Logistyczna (3 RBLog) w Krakowie, wraz z trzema podobnymi bazami, powstawała w latach 2010-2011, urzeczywistniając wytyczone kierunkami zmian w stacjonarnym systemie zabezpieczenia logistycznego Sił Zbrojnych RP, określone przez przełożonych w rozkazie nr PF-83/Org. z dnia 5 sierpnia 2010 roku.
3 RBLog jest stacjonarną jednostką logistyczną, funkcjonującą w ramach systemu zabezpieczenia logistycznego wojsk, podległą bezpośrednio Szefowi Inspektoratu Wsparcia Sił Zbrojnych (IWsp.SZ) i stanowi jego organ wykonawczy przewidziany do:
gromadzenia, przechowywania i rotacji środków zaopatrzenia (śm i tśm) na zaopatrzenie wojskowych oddziałów gospodarczych (WOG), stacjonujących w obszarze odpowiedzialności Bazy;
realizacji zaopatrywania (planowego i doraźnego), prowadzenia procedur przetargowych, realizację zakupów oraz dystrybucja środków zaopatrzenia oraz usług;
utrzymywania, określonych przez Szefa IWsp.SZ, zapasów wojennych oraz depozytów dla wskazanych jednostek wojskowych;
kompletacji amunicji artyleryjskiej, moździerzowej i rakietowej, a także wycofywania i utylizacji nieperspektywicznych środków zaopatrzenia;
realizacji planów rzeczowo-finansowych - opracowywanych na podstawie przydzielonych środków finansowych;
gospodarowania mieniem oraz prowadzenia ewidencji ilościowo - wartościowej aktywów i pasywów jednostki budżetowej;
realizacji zadań w zakresie modernizacji, remontów i obsług sprzętu technicznego oraz przeprowadzania badań diagnostycznych dopuszczających UiSW do eksploatacji;
zabezpieczenia przewozów wojskowych w ramach podsystemu kierowania ruchem wojsk;
realizacji zadań w ramach obowiązków państwa-gospodarza.
Jednostki i instytucje bezpośrednio podporządkowane[4][5]:
Komenda 3 RBLog – Kraków
Dowództwo
Sztab
Sekcja Personalna (S-1)
Sekcja Operacyjna (S-3)
Sekcja Wsparcia Dowodzenia i Łączności (S-6)
Wydział Materiałowy
Sekcja Służby Żywnościowej
Sekcja Służby Mundurowej
Sekcja Służby MPS
Sekcja Środków Bojowych
Wydział Techniczny
Sekcja Czołgowo-Samochodowa
Sekcja Uzbrojenia i Elektroniki
Sekcja Inżynieryjno-Saperska i OPBMR
Sekcja Łączności, Informatyki i WE
Wydział Techniki Lotniczej
Sekcja Eksploatacji i Remontu
Sekcja Naziemnej Obsługi Statków Powietrznych i Wysokościowo-Ratowniczej