Y染色体ハプログループ

Y染色体ハプログループ（Yせんしょくたいハプログループ）とは、男性で遺伝するY染色体のハプログループ（＝ハプロタイプの集団）のことである。

Y染色体の最新共通祖先 (Y-MRCA、非公式にはY 染色体 Adamとして知られている) は、現在生きているすべての人間が父系で子孫を残した最新共通祖先 (MRCA )である。

Y染色体を持つアダムは、およそ 236,000年前にアフリカに住んでいたと推定されている。他のボトルネックを調べると、ほとんどのユーラシア人男性 (アフリカ以外の人口からの男性) は、69,000年前にアフリカに住んでいた男性 ( Haplogroup_CT ) の子孫である。

他の主要なボトルネックは約5万年前と5千年前に発生し、その後、ほとんどのユーラシア人の祖先は、5万年前に生きていた4 人の祖先に遡ることができた。彼らはアフリカ人の子孫だった (E-M168）。言語学上の語族の分布と相関性が高い（父系言語仮説^[1]）が、外見上の人種区分とは違うパターンが少なからずある（これは遺伝子の系統と集団の系統が異なる不完全遺伝子系統仕分けによるものである）。

人類共通祖

A0000

A000-T

PR2921

A00

A0

A1a

A1b1

M60

L1090

P305

V221

M42

M168

E系統

YAP

D系統

A5580.2

M15

Y34637

M174

CTS11577

Z3660

M64.1

L1366

フィリピン

※以下縄文人の系統

CTS131

CTS220

CTS10495

Z17176

BY113470

FT413039

CTS11285

PH2316

Z38287

Z38284

Z38289

CTS1824

CTS11811

CTS288

CTS1815

Y456902

礼文島人骨

Z40665

M116.1

CTS6609^^

CTS103

Z42462

伽耶王陵骨

CTS1897

CTS11032

CTS218

CTS6909

加徳島人骨

F8521.3

CTS3033

M151

P120

CTS1964

BY169023

CTS964

CTS722

BY169030

Z30644

CTS4292

Z31517

CTS429

Z31512

CTS1798

M125

CTS291

P12.1

JST022457

P53.2

Page3

CTS3397

Z1500

Z1504

BY149852

FGC34008

L137.3

Z40625

Z45993

Z40609

CTS217

CTS3327

FT8762

Z38475

CTS8093

FGC6373

FGC6372

FGC6384

BY45234

BY26014^^

Z40614

Z46276

FGC30021

Z31548

FT262409

Z31553

FT117379

CTS4093

CTS6223

BY166058

Z40687

Z35641

Z40688

P143

M89

F1329

M578

L15

Y27277

H系統

C系統

G系統

アイスマン

F3393

CTS11043

M8

CTS9336

CTS6678

Z7972

V20

V182

F1370

K281

Z16458

B477

M38

M217

F1067

Z1312

F2613

CTS4021

CTS2657

CTS11990

Z31664

Y112121

MF1792

Z31665

CTS3579

MF2816

Y86025

Y87983

Y89130

MF2828

I系統

クロマニョン人

CTS5368

IJ系統

J系統

L255

F1614

M172

M410

M9(P128)

LT系統

M12

M526

M2308

F549

M214

M175

YSC0000186

PF5850

N系統

V1651

M1254

P337

P284

P226

R系統

Y482

M173

L146

Q系統

L472

L722

M343

L275

Y6503

F2905

TAT

Z4762

L729

Z1956

Y149447

CTS4202

Y3037

F1360

L666

F1101

F1154

Y23741

Z19795

F710

P43

CTS1350

F1998

Y71703

Y61463

Y24250

S27742

Y173843

Y174089

MF1633

Y155075

MF41795

F2320

F265

M268

M176 (P49)

F855

CTS9259

F1204(K10)

M122

F36^[2]

M324

P201

P164

M134

F450

M117

M133

AM08122

F8

A9459^^

F14494

CTS4658

CTS5308

岩出横穴人骨

M188

CTS3106

CTS445

CTS201

MF18110

FGC50672

FGC50643

FGC50649

FGC50558

BY63584

FGC50535

FGC50569

MF2683

L465

CTS2483

CTS10573

CTS879

FT318429

SK1670

MF9328

F18629

MF9361

SK1671

MF22416

MF21150

F18

F117

F2

F60

F2180

F26105

MF6914

MF16001

MF14442

MF18457

Y16154

Y27894

SK1686

Y46851

F4054

F15439

FGC5448

MF2463

MF2478

MF47835

FTC52891

MF9486

MF8073

47z (K7)

CTS1348

CTS11986

※以下弥生人の系統

CTS8379

ACT4054

Y130364

CTS2748

Z24599

CTS1351

BY146002

Y130014

CTS9852

K14

Z24594

CTS525

FT217340

FT350225

CTS11088

BY179281

BY178096

BY178807

Y126340

F2868

L682

CTS723

Y24057

F940

CTS7620

CTS4596

Y61286

Page90

BY162375

CTS1175

MF14346

A12446

PH40

FGC67537

FT41750

MF14220

FGC67568

Y72859

MF16242

MF14245

FT281275

(出典)"ISOGG Tree"(Ver.15.73), "Y-Full"(Ver.12.00), "FTDNA Big Y Tree"

Y染色体アダム
A(A00~A3(側系統))　アフリカ。コイサン人種(カポイド)、ナイロテック亜人種(ナイル人)、コイサン諸語、ナイル・サハラ語族と関連。
BT
B　アフリカ。ネグリロ人種(ピグミー)、ハヅァ族と関連。
CT
DE(YAP遺伝子)
D
- D1a1　チベット、チベット系民族に多い。
- D1a2a 主に日本で検出され、アイヌと沖縄本島南部（島尻）に特に多い。日本国外では、韓国で平均2%ほどの男性に見られるほか、ミクロネシア、ティモール島、中国（東北部、北京等）でも散発的に検出された例がある。縄文人に由来すると推定される。
E　アフリカ、中東。E1b1aはサハラ砂漠以南のアフリカ、メラノ・アフリカ人種(コンゴイド)、バントゥー系民族等のニジェール・コンゴ語族、E1b1bは北アフリカ、アラビア半島、エジプト民族(東部ハム人種)等、アフロ・アジア語族と関連。
C
- C1
- C1a1　日本固有。現代日本人の5%～6%ほどの男性に見られる。縄文人に由来すると推定されているが、縄文時代の人骨から検出された例は未だに発表されていない。青谷上寺地遺跡の弥生時代の人骨や高松茶臼山古墳に埋葬された人骨から検出された例はある。
- C1a2　ヨーロッパ、北アフリカ、アルメニア、ネパール、カビル人(ベルベル人又は北部ハム人種)などでわずかに見られる。クロマニョン人。
- C1b2　オセアニア。C1b2aはニューギニア島先住民(パプア人又はパプア亜人種)、C1b2bはオーストラリア先住民(アボリジニ又はオーストラリア人種)と関連。
- C2 カザフステップ、モンゴル高原、シベリア、極東ロシア、北アメリカで高頻度に見られカザフ人(ツラン人種又はトゥラン人種)、ブリヤート人、エヴェンキ等のアルタイ諸語、コリャーク人、ニヴフ等の古シベリア諸語(古層シベリア人種)、アパッチ族等のナ・デネ語族(北太平洋インディアン又はアリューシャン人種)と関連。中国華北、朝鮮半島では中頻度で見られる。中国華南、日本、ベトナム、タイ族などでも低頻度で見られる。
F
- F* 南アジアに見られる。F2 中国南西部のラフ族や彝族に見られる。その他ベトナム、タイ等東南アジアにも少し見られる。
G　コーカサスで多く、ヨーロッパでも少し見られる。ジョージア人(地中海人種)に見られる。
H　南アジア。ドラヴィダ人(ドラヴィダ人種又はメラノ・ヒンドゥ)、ロマに多い。ドラヴィダ語族と関連。
I　ヨーロッパで多く見られる。クロマニョン人。I1は北欧、北方人種、I2はバルカン半島、ディナール人種と関連。
J　中東、紅海・地中海沿岸。J1はアラビア半島、南東人種(アラブ人)、J2はアナトリア半島、アナトリア人種(アルメノイド)と関連。
K
- K*　ニューギニア島に多く見られるほか、オーストラリア大陸など。東南アジアでも少数だが見られる。
L　南アジア。ブルショー人に見られる。
T　南アジア、中東、東アフリカ、ヨーロッパ。ソマリ人(エチオピア人種)に見られる。
MS　海域東南アジア、オセアニア、特にニューギニア島で多く見られる。アエタ族(ネグリト人種)に多い。
NO
N　北ユーラシアに広く分布する、ウラル語族と関連。N1a1は主にウラル山脈以西、フィン人、エストニア人、サーミ人(ラップ人種)などのフィン・ウゴル語派、N1a2はウラル山脈以東、ネネツ人などのサモエード語派と関連。現代の中国、ベトナム、北朝鮮・韓国、日本などでも低頻度に見られるが、古代人骨から得られたデータを考慮すれば新石器時代から青銅器時代にかけて中国東部(山東省)及び北部(河北省^[3]、遼寧省、内蒙古自治区)に於いて主要なハプログループであった模様。
O
- O1
- O1a　中国東南部、台湾島（とりわけ台湾原住民）、海域東南アジア（フィリピン、マレーシア、インドネシア、シンガポール等）で多く、アドミラルティ諸島やマジュロなどでも10~30%程見られる。オーストロネシア語族と関連。インドシナ半島、中国のその他の地域、韓国、日本、北アジア、中央アジアでも低い頻度に見られる(英語版)。
- O1b　O1b1は中国南部、インドシナ半島、インドネシア、インド北東部、ニコバル人、ションペン人、ムンダ族に特に多い。オーストロアジア語族との関連が想定されているが、漢族や日本人に比較的多く見られる下位系統も現存している。O1b2は日本人、朝鮮民族に多く（約30%）、満州族、ナナイ、ダウール族、蒙古族、漢族等にも少数見られる。ベトナムやミクロネシアで散発的に観察された例もある。下本山岩陰遺跡や青谷上寺地遺跡で発見された弥生時代の人骨から検出されたことがある。O1b1とO1b2の最も近い共通祖先は三万年以上前にも遡ると推定されている。
- O2　中国大陸、朝鮮半島、台湾島、漢民族、朝鮮民族、タイ人、ビルマ族、ヤオ族、シェ族、キン族に多い。日本人にも15%~20%程見られる。シナ・チベット語族、ミャオ・ヤオ語族と関連。石川県金沢市観法寺町にある岩出横穴墓から出土した古墳人一体の遺骨に見られたハプログループO2a2b1a1a1a4a1-CTS5308は東アジア全体で比較的多く見られるO-M117のサブクレードではあるが、O-CTS5308は特にチベット人に多く見られるタイプである。
P
Q　アメリカ大陸。エスキモー人種を含めたアメリカ先住民(アメリンド人種)に非常に多い。ケット人などシベリアの一部でも見られる。
R
- R1a　東ヨーロッパ、北インド、中央アジアに多く、西ユーラシア全域で見られる。東ヨーロッパ人種、インド・アフガン人種(インド・アーリア人、イラン系民族)、インド・ヨーロッパ語族サテム語と関連。
- R1b　西ヨーロッパに特に多く、ヨーロッパ全域で一般的に見られる。アルプス人種、特にケルト人やバスク人に多い。インド・ヨーロッパ語族ケントゥム語と関連。

ハプログループEの分布図
ハプログループDの分布図
ハプログループNの分布図
ハプログループOの分布図
ハプログループC2の分布図
ハプログループQの分布図
ハプログループJの分布図
Y染色体ハプログループ移動の想定図

崎谷満は人類のY染色体ハプログループが出アフリカ後にイラン付近を起点にして南ルート、北ルート、西ルートの3ルートで拡散したとしている^[4]^[5]。なお、見かけによって人類を分類する人種と父系先祖からのみ遺伝されるY染色体は根本的に異なる概念であり、混同することは甚だしく不合理である。

非出アフリカ…A、B、E
南ルート…C1a1、C1b2、D1、F*、K*、MS、H、L
北ルート…C2、NO、P
西ルート…C1a2、I、J、G、T

一方で2020年に発表されたハラストらの系統発生学的手法による古代および現代の非アフリカ人Y染色体のサンプルを用いた分析によると、7万年-5万5千年前に起きた基層となるD系統、C系統、F系統の遺伝子を持つ集団の出アフリカに続いて、新しい移民を除く全ての非アフリカ人男性のY染色体の系統は5万5千年-5万年前に東アジア/東南アジアから拡散したことを示しているとし、この基層となった系統は速やかにユーラシア全体にわたって拡散し、後に東南アジアで多様な系統に分岐し、それから約5万5千年-5万年前に西に向かって拡散し、先住民のY染色体系統と置き換わったとしている^[6]。

[1]
van Driem, George. 2018. "The East Asian linguistic phylum: A reconstruction based on language and genes Archived 2021-01-10 at the Wayback Machine.", Journal of the Asiatic Society, LX (4): 1-38.
[2]
F36の分岐指標はFTDNAにあるが、Y Fullにはない。
[3]
Ye Zhang, Jiawei Li, Yongbin Zhao, Xiyan Wu, Hongjie Li, Lu Yao, Hong Zhu, and Hui Zhou, "Genetic diversity of two Neolithic populations provides evidence of farming expansions in North China." Journal of Human Genetics (2017) 62, 199–204; doi:10.1038/jhg.2016.107.
[4]
崎谷満（2009）『新日本人の起源』勉誠出版
[5]
崎谷満（2009）『DNA・考古・言語の学際研究が示す　新・日本列島史』勉誠出版
[6]
“A Southeast Asian origin for present-day non-African human Y chromosomes”. Human Genetics 140 (2): 299–307. (February 2021). doi:10.1007/s00439-020-02204-9. PMC 7864842. PMID 32666166.