ハプログループR (Y染色体)

ハプログループR (Y染色体)（ハプログループR (Yせんしょくたい)英: Haplogroup R-M207 (Y-DNA)）とは、分子人類学で用いられる、人類の父系を示すY染色体のハプログループ（型集団）の分類で、一塩基多型が「M45」を祖型とし「M207」以下の系統に位置すると定義されるもの^[2][3][4]である。

R (Y染色体) 系統
系統祖	{{{major-haplo}}}
発生時期	約19,000～27,000年前[1]
発生地（推定）	中央アジア
親階層	P
子階層	M207
高頻度民族・地域	在来分布：ユーラシア大陸西部、北アメリカ北東部 南北アメリカ（16世紀以降ヨーロッパからの移住）

起源

Y染色体のハプログループRは、中央アジアからコーカサス地方にかけてのいずれかで、約19,000から27,000年前にハプログループK2の子系統であるハプログループPから誕生した。^{[1] [5]}ハプログループRはその後、環境の変化などに伴って移動を開始し、中央アジアやヨーロッパで最も一般的に分布している系統である。またインド、エジプトやカメルーンでも分布が確認されている。ハプログループRは、早期に分岐したと考えられる姉妹グループR1系統（R-M173）とR2系統（R-M479）があるが、その大多数がR1系統（R-M173）の下流に属している^[6]。

分布

R*

ブルショー人、パシュトゥーン人で10%、カラシュ人で6%みられる^[7]。シベリアの24,000年前のマルタ・ビュレット文化の人骨から発見されている^[8]。

R1

ハプログループR1aとR1bの分布頻度。ピンクがR1a、赤がR1b

R1系統（R-M173）は、最終氷河期の後に拡散を開始したと考えられ、ヨーロッパや中央アジア等、西ユーラシアでは非常に一般的に分布している。また、大航海時代以降、南北アメリカ大陸やオセアニア地域にも多数進出し、現在においては東ユーラシア系であるハプログループOと並んで地球上で最も多く見られる系統となっている。
R1系統（R-M173）の下流に属するサブグループとしては、ハプログループR1a（R-M420）や、ハプログループR1b（R-M343）に大別される。

R1a

ハプログループR1aの分布

ハプログループR1aはインド北部から中央アジアや東ヨーロッパに高頻度に分布していることから、インド・ヨーロッパ語族のサテム語の担い手と考えられる^[9]。

R1b

ハプログループR1bの分布図

ハプログループR1bは西ヨーロッパと南ヨーロッパに顕著に分布している系統であり、バスク人やケルト系民族に80%以上の高頻度に見られる^{[10][11][12][13]}。印欧語族ケントゥム語の担い手と考えられる^[9]。大航海時代以降の人種の流動に伴って、南北のアメリカ大陸やオーストラリア大陸にも分布の範囲を拡大した。またバシキール人にも86%の高頻度である^[14]。この流れとは別に、古代にもアフリカ内陸部へ移動したR1b系統の一集団があったと見られ、ハプログループR-V88に定義づけられる分岐系統がチャド語派の言語を話すカメルーンの先住民族の間において高濃度で発見されている^[15][16][17]。

アメリカ大陸

北米先住民に見られるR1系統に関しては、コロンブスの大陸発見以降の植民地化によるヨーロッパ人との混血によるものか、有史以前にヨーロッパからの移住した何らかの集団があったものなのか、あるいはシベリア経由でやってきた先住民に由来するものかははっきりと結論が出ていない。北アメリカにおけるR1の分布はミトコンドリアDNAハプログループXと似ていることも興味深い事実である。
かつてはハプログループQが大多数であったアメリカ大陸も、ヨーロッパ人由来の西洋社会となっている今日においては、ハプログループRが最多である。

R2

ハプログループR2はインドの南部ほど、かつ下位カーストほど高頻度でみられるが、トライブでは逆に低頻度となっている^[18]。

系統樹

• R*
• R1（M173）
  • R1*
  • R1a（M420）
  • R1b（M343）
• R2（M124）

Y染色体アダム (Y-MRCA)

A0

A1

A1a

A1b

A1b1

BT

B

CT

DE

CF

D

E

C

F

G

H

IJK

IJ

K

I

J

K1

K2

L

T

MS

NO

P

K2*

N

O

Q

R

脚注

[脚注の使い方]

1. ISOGG Y-DNA Haplogroup Tree
2. Myres (2010). A major Y-chromosome haplogroup R1b Holocene era founder effect in Central and Western Europe. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmB/articles/PMC3039512/.
3. Lell, Jeffrey T.; Sukernik, Rem I.; Starikovskaya, Yelena B.; Su, Bing; Jin, Li; Schurr, Theodore G.; Underhill, Peter A.; Wallace, Douglas C. (2002). “The Dual Origin and Siberian Affinities of Native American”. The American Journal of Human Genetics 70: 192. doi:10.1086/338457. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0002929707612932.
4. “SUPPLEMENTARY INFORMATION” (PDF) (英語). 2013年12月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。2015年5月16日閲覧。 doi:10.1038/nature12736
5. Karafet, TM; Mendez, FL; Meilerman, MB; Underhill, PA; Zegura, SL; Hammer, MF (May 2008). “New binary polymorphisms reshape and increase resolution of the human Y chromosomal haplogroup tree”. Genome Res. 18: 830–8. doi:10.1101/gr.7172008. PMC 2336805. PMID 18385274. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2336805/.
6. Malhi (2008). Distribution of Y Chromosomes Among Native North Americans: A Study of Athapaskan Population History. オリジナルの2010年6月17日時点におけるアーカイブ。. https://web.archive.org/web/20100617184224/http://usmex.ucsd.edu/assets/022/10143.pdf.
7. Firasat et al.(2007)　Y-chromosomal evidence for a limited Greek contribution to the Pathan population of Pakistan　European Journal of Human Genetics 15, 121–126
8. Raghavan, Maanasa; Pontus Skoglund; Kelly E. Graf; Mait Metspalu; Anders Albrechtsen; Ida Moltke; Simon Rasmussen; Thomas W. Stafford Jr; Ludovic Orlando; Ene Metspalu; Monika Karmin; Kristiina Tambets; Siiri Rootsi; Reedik Mägi; Paula F. Campos; Elena Balanovska; Oleg Balanovsky; Elza Khusnutdinova; Sergey Litvinov; Ludmila P. Osipova; Sardana A. Fedorova; Mikhail I. Voevoda; Michael DeGiorgio; Thomas Sicheritz-Ponten; Søren Brunak; et al. (2 January 2014). "Upper Palaeolithic Siberian genome reveals dual ancestry of Native Americans". Nature. 505 (7481): 87–91. PMC 4105016 Freely accessible. PMID 24256729. doi:10.1038/nature12736.
9. Eupedia
10. Helgason A, Sigureth ardóttir S, Nicholson J, Sykes B, Hill E, Bradley D et al. (2000). "Estimating Scandinavian and Gaelic ancestry in the male settlers of Iceland". Am. J. Hum. Genet. 67 (3): 697–717. doi:10.1086/303046. PMC 1287529. PMID 10931763
11. Ornella Semino et al 2000, The Genetic Legacy of Paleolithic Homo sapiens sapiens in Extant Europeans: A Y Chromosome Perspective
12. Wilson J, Weiss D, Richards M, Thomas M, Bradman N, Goldstein D (2001). "Genetic evidence for different male and female roles during cultural transitions in the British Isles". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98 (9): 5078–83. Bibcode:2001PNAS...98.5078W. doi:10.1073/pnas.071036898. JSTOR 3055567. PMC 33166. PMID 11287634
13. Adams S, King T, Bosch E, Jobling M (2006). "The case of the unreliable SNP: recurrent back-mutation of Y-chromosomal marker P25 through gene conversion". Forensic Sci. Int. 159 (1): 14–20. doi:10.1016/j.forsciint.2005.06.003. PMID 16026953
14. Lobov. Y chromosome analysis in subpopulations of Bashkirs from Russia
15. Kivisild T., Rootsi S, Metspalu M, Mastana S, Kaldma K, Parik J, Metspalu E, Adojaan M et al. (2003). “The Genetic Heritage of the Earliest Settlers Persists Both in Indian Tribal and Caste Populations”. American Journal of Human Genetics 72 (2): 313–332. doi:10.1086/346068. PMC 379225. PMID 12536373. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC379225/.
16. Wells. The Eurasian Heartland: A continental perspective on Y-chromosome diversity. http://www.pnas.org/content/98/18/10244.full.
17. Underhill, Peter A; Myres, Natalie M; Rootsi, Siiri; Metspalu, Mait; Zhivotovsky, Lev A; King, Roy J; Lin, Alice A; Chow, Cheryl-Emiliane T et al. (2009). “Separating the post-Glacial coancestry of European and Asian Y chromosomes within haplogroup R1a”. European Journal of Human Genetics 18 (4): 479–84. doi:10.1038/ejhg.2009.194. PMC 2987245. PMID 19888303. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2987245/.
18. en:Y-DNA haplogroups in South Asian populations

参考文献

• The History and Geography of Human Genes. Princeton University Press. (1994). ISBN 0-691-08750-4
• Karafet, T. M.; Mendez, F. L.; Meilerman, M. B.; Underhill, Peter A.; Zegura, S. L.; Hammer, M. F. (May 2008). “New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree”. Genome Research 18 (5): 830–8. doi:10.1101/gr.7172008. PMC 2336805. PMID 18385274. http://www.genome.org/cgi/content/abstract/gr.7172008v1.. Published online April 2, 2008. See also Supplementary Material.
• Semino; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; Arbuzova, S; Beckman, LE; De Benedictis, G; Francalacci, P et al. (2000). “The Genetic Legacy of Paleolithic Homo sapiens sapiens in Extant Europeans” (PDF). Science 290 (5494): 1155–9. doi:10.1126/science.290.5494.1155. PMID 11073453. オリジナルの2003年11月25日時点におけるアーカイブ。. https://web.archive.org/web/20031125151213/http://hpgl.stanford.edu/publications/Science_2000_v290_p1155.pdf.
• Wells; Yuldasheva, N; Ruzibakiev, R; Underhill, PA; Evseeva, I; Blue-Smith, J; Jin, L; Su, B et al. (2001). “The Eurasian Heartland: A continental perspective on Y-chromosome diversity” (PDF). PNAS 98 (18): 10244–9. doi:10.1073/pnas.171305098. PMC 56946. PMID 11526236. http://www.pnas.org/cgi/reprint/98/18/10244.pdf.
• Passarino; Cavalleri, GL; Lin, AA; Cavalli-Sforza, LL; Børresen-Dale, AL; Underhill, PA (2002). “Different genetic components in the Norwegian population revealed by the analysis of mtDNA and Y chromosome polymorphisms”. Eur. J. Hum. Genet. 10 (9): 521–9. doi:10.1038/sj.ejhg.5200834. PMID 12173029. http://www.nature.com/ejhg/journal/v10/n9/full/5200834a.html.
• Behar; Thomas, MG; Skorecki, K; Hammer, MF; Bulygina, E; Rosengarten, D; Jones, AL; Held, K et al. (2003). “Multiple Origins of Ashkenazi Levites: Y Chromosome Evidence for Both Near Eastern and European Ancestries” (– ^{Scholar search}). Am. J. Hum. Genet. 73 (4): 768–779. doi:10.1086/378506. PMC 1180600. PMID 13680527. オリジナルの2012年12月11日時点におけるアーカイブ。. https://archive.is/20121211143714/http://www.journals.uchicago.edu/AJHG/journal/issues/v73n4/40097/40097.html.
• Anjana Saha, Swarkar Sharma, Audesh Bhat, Awadesh Pandit, Ramesh Bamezai (2005). “Genetic affinity among five different population groups in India reflecting a Y-chromosome gene flow”. J Hum Genet 50 (1): 49–51. doi:10.1007/s10038-004-0219-3. PMID 15611834.
• Sengupta; Zhivotovsky, LA; King, R; Mehdi, SQ; Edmonds, CA; Chow, CE; Lin, AA; Mitra, M et al. (2005). “Polarity and Temporality of High-Resolution Y-Chromosome Distributions in India Identify Both Indigenous and Exogenous Expansions and Reveal Minor Genetic Influence of Central Asian Pastoralists”. Am. J. Hum. Genet. 78 (2): 202–21. doi:10.1086/499411. PMC 1380230. PMID 16400607. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1380230/.
• Cinnioglu (2004). Excavating Y-chromosome haplotype strata in Anatolia. オリジナルの2006年6月19日時点におけるアーカイブ。. https://web.archive.org/web/20060619105314/http://hpgl.stanford.edu/publications/HG_2004_v114_p127-148.pdf.
• Underhill, Peter A; Myres, NM; Rootsi, S; Metspalu, M; Zhivotovsky, LA; King, RJ; Lin, AA; Chow, CE et al. (2009). “Separating the post-Glacial coancestry of European and Asian Y chromosomes within haplogroup R1a”. European Journal of Human Genetics 18 (4): 479–84. doi:10.1038/ejhg.2009.194. PMC 2987245. PMID 19888303. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2987245/.
• Kayser, M; Brauer, S; Weiss, G; Schiefenhövel, W; Underhill, P; Shen, P; Oefner, P; Tommaseo-Ponzetta, M et al. (2003). “Reduced Y-Chromosome, but Not Mitochondrial DNA, Diversity in Human Populations from West New Guinea”. American Journal of Human Genetics 72 (2): 281–302. doi:10.1086/346065. PMC 379223. PMID 12532283. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC379223/.
• Firasat, Sadaf; Khaliq, Shagufta; Mohyuddin, Aisha; Papaioannou, Myrto; Tyler-Smith, Chris; Underhill, Peter A; Ayub, Qasim (2007). “Y-chromosomal evidence for a limited Greek contribution to the Pathan population of Pakistan”. European Journal of Human Genetics 15 (1): 121–126. doi:10.1038/sj.ejhg.5201726. PMC 2588664. PMID 17047675. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2588664/.
• Krahn, Thomas. “FTDNA Draft Y-DNA Tree (AKA YTree)”. Family Tree DNA. 2015年8月15日時点のオリジナルよりアーカイブ。2012年12月7日閲覧。

関連項目

Y染色体アダム Y染色体ハプログループ ハプログループ 一塩基多型 (SNP)

ジェノグラフィック・プロジェクト スペンサー・ウェルズ インド・ヨーロッパ語族 コーカソイド

外部リンク

• Yahoo group Y-DNA Haplogroup R
• Family Tree DNA R2-M124-WTY (Walk Through the Y) Project^{[リンク切れ]}
• Family Tree DNA R-Arabia Y-DNA Project^{[リンク切れ]}

Y染色体アダム (Y-MRCA)

A0

A1

A1a

A1b

A1b1

BT

B

CT

DE

CF

D

E

C

F

G

H

IJK

IJ

K

I

J

K1

K2

L

T

MS

NO

P

K2*

N

O

Q

R