ハプログループO (Y染色体)

ハプログループO (Y染色体)（ハプログループO (Yせんしょくたい)、英: Haplogroup O (Y-DNA)）とは分子人類学において人類の父系を示すY染色体ハプログループ（型集団）の分類で、ハプログループNOの子型で「M175」以下の系統に位置すると定義されるものである。東アジア及び東南アジアで最も一般的に見られる系統であり、西ユーラシア系のハプログループRと並んで現代人類において最も帰属人口の多いY染色体であると考えられている。

Y染色体 O 系統
系統祖	O-M175
発生時期	36,800年前[1]、39,980年前[2]、41,750（95% CI 46,041 ↔ 30,597）年前[3]、44,700年前[4]
発生地（推定）	中国
現存下位系統の 分岐開始年代（下限値）	30,500年前[1]、32,460年前[5]、33,943（95% CI 37,631 ↔ 25,124）年前[3]、35,000年前[4]
親階層	NO
分岐指標	M175, P186, P191, P196
子階層	O1、O2
高頻度民族・地域	東アジア、東南アジア

概要

ハプログループOに関連する民族移動

Y染色体のハプログループOは、おおよそ４万年前^{[注 1]}にハプログループNと血筋が分かれた。

現存のハプログループO（即ちO1-F265とO2-M122）の最も近い共通祖先は、約３万年～３．５万年前^{[注 2]}に生きたとされる。

華北平原や長江流域などの豊かな地域を中心に多岐に渡るサブグループを産み出し、これらの地域から東アジアや東南アジアからポリネシアに至るまで広範囲に拡散したと考えられている^[7]。

「大渓文化」の遺跡人骨から検出されたＹ染色体ハプログループは、現在は中国南部から東南アジア北部の山岳地帯に分布する「モン・ミエン語族（ミャオ・ヤオ語族）」の民族に多い「O2a2a1a2　M7（旧O3系）」が主体（５/７）で、「Ｏ２＊（旧Ｏ３＊）」と「O1b1a1a M95（旧O2a系）」がそれぞれその一部（１/７）であった。 「大渓文化」は「屈家嶺文化」へ継承された。

大きくO1とO2に大別される^[8]。約3万年前頃までには、O1a-M119, O1b1-K18, O1b2-M176, O2a-M324, O2b-F742 という五つの古い系統に分かれていたと推定されている^[1][9][4]。

一塩基多型分岐図

A0000

A000-T

PR2921

A00

A0

A1a

L1090

P305

V221

A1b1

サン族

PF1608

BY22527.2

M42

M168

YAP

CTS3946

M174

P143

M216

G系統

M89

F1329

M578

L15

M9 (P128)

M526

M2308

F549

M214

H系統

LT系統

YSC0000186

IJ系統

I系統

J系統

M231

Y6503

F2905

Z1956

TAT

Z4762

L729

F1360

L666

M175

M122

F36

M324

L465

CTS2483

CTS10573

CTS879

FT318429

SK1670

MF9328

F18629

MF9361

SK1671

MF22416

MF21150

F18

F117

F2

F60

F2180

F26105

MF6914

MF16001

MF14442

MF18457

Y16154

Y27894

SK1686

Y46851

F4054

F15439

FGC5448

MF2463

MF2478

MF47835

FTC52891

MF9486

MF8073

(出典)"Y-Full"(Ver.12.00), "FTDNA Big Y Tree"

下位系統

• O1
  • O1a：中国東部及び南部、台湾先住民、海南島の先住民であるリー族、フィリピン、インドネシアの幾つかの島（ニアス島、ムンタワイ諸島等）に多い^[10]。オーストロネシア語族、タイ・カダイ語族と関連がある^[11]。
  • O1b
    • O1b1：東南アジア、中国南部（リー族、タイ族、プイ族等）及びインド東部の一部（カシ族、ムンダ系民族、ミゾ・クキ・チン等)に多い。オーストロアジア語族と関連。
    • O1b2：日本及び朝鮮半島に多い。
• O2
  • O2a：中国北部及び朝鮮半島からインド北東部及びミャンマーの山岳部にかけて特に多い。シナ・チベット語族、モン・ミエン語族との関連が想定される。
  • O2b(旧O3*)：中国、韓国、日本、ベトナム、ラオス、タイ、マレーシア、シンガポール、インドネシア（スマトラ島、バリ島、ボルネオ島、スンバ島等）、フィリピン、マリアナ諸島、カザフスタン、スリナム等で稀にみられる^[12][13]。現代中国では全国の男性人口の約1.15%を占める^[14]。瑤族 3.3%、漢民族 2%、回族 1%、白族 0.5%^[要出典]。日本ではO-M122(xP201, JST002611)が1.51%（2390人中36人）の割合で観測された例があり、これらはO2b-F742もしくはO2a1a-F1876に属すだろうことが推定できる^[15]。長江中・下流地域が原郷で長江文明との関係が指摘されている^[要出典]。

脚注

注釈

1. Karmin et al. (2015)によれば、41,900年（95% CI 40,175年–43,591年）前。Poznik, Xue & Mendez (2016)によれば、44,700年前、23mofang (October 2023)によれば39,980年前^[6]、YFull (2022)によれば、36,800年（95% CI 34,300年–39,300年）前。
2. Karmin et al. (2015)によれば、34,042年（95% CI 32,387年–35,708年）前。Poznik, Xue & Mendez (2016)によれば、35,000年前。23mofang (2022 April 22)によれば、32,890年前、YFull (2022)によれば、30,500（95% CI 28,700年–32,400年）前

出典

1. “O YTree”. YFull. Haplogroup YTree v10.00.00 (11 January 2022). 11 January 2022時点のオリジナルよりアーカイブ。2022年2月12日閲覧。
2. https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/NO
3. Monika Karmin, Rodrigo Flores, Lauri Saag, et al. (2022), "Episodes of Diversification and Isolation in Island Southeast Asian and Near Oceanian Male Lineages." Mol. Biol. Evol. 39(3): msac045 doi:10.1093/molbev/msac045. cf. Figure S4: Dated phylogenetic tree of haplogroup (hg) O-M175及びTable S5: Coalescence ages within hg O and other lineages included in the analyses presented on Supplemental Figure S4.
4. The 1000 Genomes Project Consortium; Poznik, G David; Xue, Yali; Mendez, Fernando L; Willems, Thomas F; Massaia, Andrea; Wilson Sayres, Melissa A; Ayub, Qasim et al. (2016-06). “Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences” (英語). Nature Genetics 48 (6): 593–599. doi:10.1038/ng.3559. ISSN 1061-4036. PMC 4884158. PMID 27111036. http://www.nature.com/articles/ng.3559.
5. https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/O-F175
6. Phylogenetic tree of haplogroup NO at 23mofang
7. Yan, Shi; Wang, Chuan-Chao; Li, Hui; Li, Shi-Lin; Jin, Li (2011-09). “An updated tree of Y-chromosome Haplogroup O and revised phylogenetic positions of mutations P164 and PK4” (英語). European Journal of Human Genetics 19 (9): 1013–1015. doi:10.1038/ejhg.2011.64. ISSN 1476-5438. PMC 3179364. PMID 21505448. https://www.nature.com/articles/ejhg201164.
8. Yan, Shi; Wang, Chuan-Chao; Zheng, Hong-Xiang; Wang, Wei; Qin, Zhen-Dong; Wei, Lan-Hai; Wang, Yi; Pan, Xue-Dong et al. (2014-08-29). Su, Bing. ed. “Y Chromosomes of 40% Chinese Descend from Three Neolithic Super-Grandfathers” (英語). PLoS ONE 9 (8): e105691. doi:10.1371/journal.pone.0105691. ISSN 1932-6203. PMC 4149484. PMID 25170956. https://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0105691.
9. Karmin, Monika; Saag, Lauri; Vicente, Mário; Sayres, Melissa A. Wilson; Järve, Mari; Talas, Ulvi Gerst; Rootsi, Siiri; Ilumäe, Anne-Mai et al. (2015-04). “A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture” (英語). Genome Research 25 (4): 459–466. doi:10.1101/gr.186684.114. ISSN 1088-9051. PMC 4381518. PMID 25770088. http://genome.cshlp.org/lookup/doi/10.1101/gr.186684.114.
10. Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael P. H.; Gratrix, Fiona; Oppenheimer, Stephen; Underhill, Peter; Pascali, Vincenzo L. et al. (2001-02-01). “A Predominantly Indigenous Paternal Heritage for the Austronesian-Speaking Peoples of Insular Southeast Asia and Oceania” (English). The American Journal of Human Genetics 68 (2): 432–443. doi:10.1086/318205. ISSN 0002-9297. PMC 1235276. PMID 11170891. https://www.cell.com/ajhg/abstract/S0002-9297(07)64095-6.
11. 崎谷満『DNA・考古・言語の学際研究が示す新・日本列島史: 日本人集団・日本語の成立史』勉誠出版、2009年8月。ISBN 978-4-585-05394-1。OCLC 429025925。
12. https://discover.familytreedna.com/y-dna/O-CTS1754/frequency?view=table
13. Kayser, M.; Choi, Y.; van Oven, M.; Mona, S.; Brauer, S.; Trent, R. J.; Suarkia, D.; Schiefenhovel, W. et al. (2008-04-03). “The Impact of the Austronesian Expansion: Evidence from mtDNA and Y Chromosome Diversity in the Admiralty Islands of Melanesia” (英語). Molecular Biology and Evolution 25 (7): 1362–1374. doi:10.1093/molbev/msn078. ISSN 0737-4038. https://academic.oup.com/mbe/article-lookup/doi/10.1093/molbev/msn078.
14. https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/O-F742/detail
15. Youichi Sato, Toshikatsu Shinka, Ashraf A. Ewis, Aiko Yamauchi, Teruaki Iwamoto, and Yutaka Nakahori, "Overview of genetic variation in the Y chromosome of modern Japanese males." Anthropological Science Vol. 122(3), 131–136, 2014. DOI: 10.1537/ase.140709

Y染色体アダム (Y-MRCA)

A0

A1

A1a

A1b

A1b1

BT

B

CT

DE

CF

D

E

C

F

G

H

IJK

IJ

K

I

J

K1

K2

L

T

MS

NO

P

K2*

N

O

Q

R