פרשנות המקרא היהודית שלאחר חז"ל נחלקת לשתי תקופות עיקריות - פרשנות ימי הביניים, שראשיתה אצל רס"ג, מנחם ודונש בסוף האלף הראשון לספירת הנוצרים וסיומה אצל רלב"ג בתחילת המאה ה-14. מאז, במשך תקופה של כמעט 600 שנה לא נכתבו כמעט ספרי פרשנות על מילות התנ"ך עצמן אלא סגנון ספרי הפרשנות היה בהבאת פירושי התנ"ך הקדומים כמו רמב"ן ורש"י ובירור הנכון מביניהם על ידי שאלות והסברים שונים, כמו כלי יקר, דבק טוב, אור החיים ומשכיל לדוד. כמו כן היו ספרים שנכתבו על פירוש אחר (בדרך כלל רש"י), אך בפועל ביארו כפי הנראה להם תוך השוואה לפירוש רש"י.
יצירת הפרשנות היהודית לתנ"ך התחדשה כבתחילה בתחילת המאה ה-18 בעקבות תנועת ההשכלה והתגובות השונות לה. מאז הקמת מדינת ישראל התגבר מאוד העיסוק בתנ"ך, יצאו לאור מספר כתבי עת על התנ"ך (למשל, מגדים) ונכתבו פירושים רבים על התנ"ך ועיונים בו ובפרשניו, כמו עיוניה של נחמה ליבוביץ והמפעל הגדול של "דעת מקרא".
- רבי אליהו מזרחי (רא"ם), טורקיה, 1455? - 1526
- רבי משה אלשיך (ה'אלשיך'), צפת, 1507–1600
- המהר"ל מפראג] (חיבורו: "גור אריה"), 1512–1609
- רבי מרדכי יפה (חיבורו: "לבוש האורה"), פולין, 1530–1612
- רבי שלמה אפרים מלונטשיץ (חיבורו: "כלי יקר"), פולין, 1550? - 1619
- רבי ידידיה שלמה רפאל מנורצי (חיבורו: "מנחת שי"), (תחילת המאה ה-17)
- רבי שבתי בס (חיבורו: "שפתי חכמים"), 1641–1718
- רבי דוד אלטשולר ובנו רבי הלל אלטשולר (חיבוריהם: "מצודת דוד" ו"מצודת ציון", המכונים "המצודות"), (המאה ה-17 - ה-18)
- רבי חיים בן עטר (חיבורו: "אור החיים"), מרוקו, 1703? - 1750?
- רבי דוד פארדו (חיבורו: "משכיל לדוד"), איטליה, 1718–1792
- משה מנדלסון, גרמניה, (1729 - 1786)
- החתם סופר, סלובקיה, 1762–1839
- הרב יעקב צבי מֶקְלֶנְבּוּרג (הכתב והקבלה) 1785-1865
- שמואל דוד לוצאטו (שד"ל), 1800–1865
- רבי שמשון רפאל הירש (רש"ר הירש), גרמניה, 1808-1888
- רבי מאיר ליבוש (מלבי"ם), 1809–1879
- רבי נפתלי צבי יהודה ברלין (נצי"ב) (חיבוריו: "העמק דבר", "הרחב דבר"), 1817–1893
- רבי אליהו בן אמוזג (חיבורו: "אם למקרא"), איטליה, 1823–1900
- רבי דוד צבי הופמן (רד"צ הופמן) 1843–1921
- רבי מאיר שמחה הכהן מדווינסק (חיבורו: משך חכמה), 1843–1926
- בנו יעקב, גרמניה, 1862–1945
הפרשנות בארץ ישראל
- שמואל לייב גורדון, 1867–1933
- משה צבי סגל, 1876–1968
- משה דוד קאסוטו, 1883–1951
- הרב מנחם מנדל כשר (חומש תורה שלמה), 1895–1983
- נפתלי הרץ טור-סיני, 1886–1973
- יחזקאל קויפמן, 1889–1963
- נחמה ליבוביץ (ה"מורה"), 1905–1997
- אליה שמואל הרטום, 1887–1965
- אשר ויזר
- סדרת דעת מקרא, עם פירושיהם של עמוס חכם, יהודה קיל ועוד, בהוצאת מוסד הרב קוק.
- סדרת עולם התנ"ך, פירוש מדעי חדשני, בהוצאת דוידזון - עתי.
- הרב עדין אבן ישראל שטיינזלץ (התנ"ך המבואר), 1937–2020
- סדרת מקרא לישראל, פירוש מדעי חדשני, בהוצאת מאגנס.
- סדרת פירוש ישראלי חדש, ע"י יאיר זקוביץ ואביגדור שנאן
- שרה יפת, דור דור ופרשניו: אסופת מחקרים בפרשנות המקרא, מוסד ביאליק, 2008
- הרב פרופ' עזרא ציון מלמד, מפרשי המקרא, דרכיהם ושיטותיהם, הוצאת מאגנס, ה'תשל"ה, מהדורה שנייה ה'תשל"ח.
- הרב פרופ' עזרא ציון מלמד, מחקרים במקרא בתרגומיו ובמפרשיו, הוצאת מאגנס, ה'תשמ"ד. ISBN 9652235156
- משה גרינברג, פרשנות המקרא היהודית- פרקי מבוא, מוסד ביאליק,
- שרה קמין[1], בין יהודים לנוצרים בפרשנות המקרא, ירושלים: הוצאת מאגנס, ה'תשס"ט.
- פרופ' גרשון ברין, קוים לאפיון הפרשנות הביזנטית, בתוך: ד"ר לאה מזור, על מקרא הוראה וחינוך
- יהודה איזנברג, פרשנות המקרא - אוסף חיבורים פרשניים ומאמרים בנושא, באתר "דעת"
- יחיאל צבי מושקוביץ, פרשנות המקרא בימינו, באתר "דעת"
- פיליפ טריה, מתיה קם, פרשנות המקרא הקדומה, באתר "תרבות•il"
- פיליפ טריה, מתיה קם, פרשנות המקרא בימי הביניים, באתר "תרבות•il"
- רביב, רבקה, "לשאלת היחס למדרשי האגדה בפרשנות ימי הביניים", טללי אורות י"א (תשס"ד), עמ' 41–52
- סקירת תולדותם ופועלם של מפרשי המקרא באתר בני ציון - בונים קומה בתנ"ך
- מידע על פרשני המקרא בקטלוג הספרייה הלאומית