Lectina tipo C

Unha lectina tipo C (CLEC) é un tipo de dominio proteico de unión a carbohidratos de proteínas lectinas.^[2] A designación tipo C refírese ao seu requirimento de calcio para unirse.^[3] As proteínas que conteñen dominios de lectina tipo C teñen unha gama diversa de funcións incluíndo a adhesión célula a célula, resposta inmune a patóxenos e apoptose.^[4][5]

dominio de lectina tipo C
Estrutura pentamérica da lectina do veleno de crótalo, que é unha lectina que se une a galactosa.[1]
Identificadores
Símbolo	Lectin_C
Pfam	PF00059
InterPro	IPR001304
SMART	CLECT
PROSITE	PS50041
SCOPe	2msb / SUPFAM
CDD	cd00037
Estruturas proteicas dispoñibles: Pfam   estruturas / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum resumo de estruturas PDB 1jznB:20-133 1muqB:20-133 1gz2A:22-140 1v4lD:44-146 1c3aB:44-146 1umrD:44-146 1uosB:44-146 1u0nC:19-123 1fvuD:19-123 1u0oB:19-123 1ijkC:19-123 1ixxD:42-144 1x2wB:42-144 1x2tD:42-144 1bj3B:42-144 1j35B:42-144 1j34B:42-144 1ukmB:44-148 1v7pB:44-148 1sb2B:21-125 1uv0A:57-173 1qddA:53-164 1lit :53-164 2afpA:58-161 1tdqB:1931-2036 1t8cA:180-284 1t8dA:180-284 1kje :180-284 1hli :180-284 1hlj :203-307 1eggA:669-779 1egiA:669-779 1k9iG:273-379 1sl5A:273-379 1sl4A:273-379 1sl6C:285-391 1xphA:285-391 1k9jA:285-391 1xarB:285-391 1dv8A:171-279 1wmzB:20-137 1wmyA:20-137 2brsA:114-222 1h8uA:114-222 1wk1A:1207-1314 1r13A:144-248 1r14A:144-248 1gieA:144-248 1msbA:134-236 1kwyC:134-236 1bch2:134-236 1kwwA:134-236 1kwxC:134-236 1yttA:134-236 1kwuB:134-236 3kmb3:134-236 1afb2:134-236 1kwtC:134-236 1fihC:134-236 1bcj2:134-236 4kmb3:134-236 1kx0C:134-236 1fifA:134-236 1kx1A:134-236 1kmb3:134-236 2kmb2:134-236 1kwvC:134-236 1afa2:134-236 1kwzA:134-236 1rtm2:134-236 1afd3:134-236 1buuA:134-236 2msbB:134-236 1hup :144-246 1rdj2:140-242 1bv4D:140-242 1kzd1:140-242 1rdo2:140-242 1rdm1:140-242 1rdl2:140-242 1rdi2:140-242 1kze2:140-242 1rdn1:140-242 1rdk1:140-242 1kzc1:140-242 1kzb2:140-242 1kza2:140-242 1pw9A:270-375 1b08A:270-375 1pwbA:270-375 1htnA:87-199 1tn3 :87-199 1rjhA:87-199 1g1qA:49-160 1g1sB:49-160 1kjd :49-160 1g1rB:49-160 1kjb :46-157 1esl :29-140 1kja :29-140 1g1tA:29-140 1byfA:10-121 1tlgB:10-121 1qo3C:156-255 1ja3A:160-259 1p4lD:160-259 1p1zD:160-259 1e87A:102-196 1e8iA:102-196 1fm5A:102-196 1b6e :78-176 1ypuB:161-224 1yxkB:161-224 1ypoC:161-224 1yxjA:161-224 1ypqB:161-224 1hyrA:116-213 1kcgB:116-213 1mpuA:116-213 1hq8A:132-229

Clasificación

Drickamer et al. clasificaron as lectinas tipo C en 7 subgrupos (do I ao VII) baseándose na orde de varios dominios proteicos en cada proteína.^[6] Esta clasificación foi posteriormente actualizada en 2002, engadíndose a ela sete subgrupos adicionais (do VIII ao XIV).^[7] Máis recentemente, engadíronse tres subgrupos máis (do XV ao XVII).^[2]

Grupo	Nome	Dominios asociados
I	Lecticanas	EGF, dominios Sushi Ig e Link
II	Asialoglicoproteína e receptores DC	Ningún
III	Colectinas	Ningún
IV	Selectinas	dominios Sushi e EGF
V	receptores da célula NK	Ningún
VI	receptores endocíticos multi CTLD	dominios FnII e Ricin
VII	grupo Reg	Ningún
VIII	Condrolectina, Layilina	Ningún
IX	Tetranectina	Ningún
X	Policistina	dominios WSC, REJ, PKD
XI	Atractina (ATRN)	dominios PSI, EGF e CUB
XII	Proteína básica maior eosinófila (EMBP)	Ningún
XIII	DGCR2	Ningún
XIV	Trombomodulina, CD93, CD248	dominio EGF
XV	Bimlec	Ningún
XVI	SEEC	dominios SCP e EGF
XVII	CBCP/Frem1/QBRICK	dominios de repeticións CSPG e CalX-beta

Entre os CLEC están os seguintes:

• CLEC1A, CLEC1B
• CLEC2A, CLEC2B, CD69 (CLEC2C), CLEC2D, CLEC2L
• CLEC3A, CLEC3B
• CLEC4A, CLEC4C, CLEC4D, CLEC4E, CLEC4F, CLEC4G, ASGR1 (CLEC4H1), ASGR2 (CLEC4H2), FCER2 (CLEC4J), CD207 (CLEC4K), CD209 (CLEC4L), CLEC4M
• CLEC5A
• CLEC6A
• CLEC7A
• OLR1 (CLEC8A)
• CLEC9A
• CLEC10A
• CLEC11A
• CLEC12A, CLEC12B
• CD302 (CLEC13A), LY75 (CLEC13B), PLA2R1 (CLEC13C), MRC1 (CLEC13D), MRC2 (CLEC13E)
• CLEC14A
• CLEC16A
• CLEC17A

Os "receptores de tipo lectina da célula NK" están moi estreitamente relacionados con este grupo:^[8]

• KLRA1
• KLRB1 (CLEC5B)
• KLRC1, KLRC2, KLRC3, KLRC4
• KLRD1
• KLRF1 (CLEC5C)
• KLRG1 (CLEC15A), KLRG2 (CLEC15B)
• KLRK1

Outras proteínas que conteñen este dominio son:

• AGC1; ATRNL1
• BCAN
• CD248; CD72; CD93; CHODL; CL-K1-Ia; CL-K1-Ib; CL-K1-Ic; CLECSF5; COLEC10; COLEC11; COLEC12; CSPG3
• FCER2; FREM1; HBXBP;
• LAYN; LOC348174; LOC728276
• MAFA; MBL2; MGC34761; MICL; MRC1L1
• OLR1
• PAP; PKD1; PKD1L2; PLA2R1; PRG2; PRG3
• REG1A; REG1B; REG3A; REG3G; REG4
• SELE; SELL; SELP; SFTPA1; SFTPA2; SFTPA2B; SFTPD; SRCL
• THBD
• VCAN

Notas

1. Walker JR, Nagar B, Young NM, Hirama T, Rini JM (April 2004). "X-ray crystal structure of a galactose-specific C-type lectin possessing a novel decameric quaternary structure". Biochemistry 43 (13): 3783–92. PMID 15049685. doi:10.1021/bi035871a.
2. Zelensky AN, Gready JE (December 2005). "The C-type lectin-like domain superfamily". FEBS J. 272 (24): 6179–217. PMID 16336259. doi:10.1111/j.1742-4658.2005.05031.x.
3. C-Type Lectin Medical Subject Headings (MeSH) na Biblioteca Nacional de Medicina dos EUA.
4. Drickamer K (October 1999). "C-type lectin-like domains". Curr. Opin. Struct. Biol. 9 (5): 585–90. PMID 10508765. doi:10.1016/S0959-440X(99)00009-3.
5. Cambi A, Figdor C (May 2009). "Necrosis: C-type lectins sense cell death". Curr. Biol. 19 (9): R375–8. PMID 19439262. doi:10.1016/j.cub.2009.03.032.
6. Drickamer K (1993). "Evolution of Ca(2+)-dependent animal lectins". Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. Progress in Nucleic Acid Research and Molecular Biology 45: 207–32. ISBN 978-0-12-540045-9. PMID 8341801. doi:10.1016/S0079-6603(08)60870-3.
7. Drickamer K, Fadden AJ (2002). "Genomic analysis of C-type lectins". Biochem. Soc. Symp. (69): 59–72. PMID 12655774.
8. NK Cell Lectin-Like Receptors Medical Subject Headings (MeSH) na Biblioteca Nacional de Medicina dos EUA.

Véxase tamén

Ligazóns externas

• Functional Glycomics Gateway, unha colaboración entre o Consortium for Functional Glycomics e o Nature Publishing Group