HMGA1

A HMGA1 (High-mobility group protein HMG-I/HMG-Y, proteína do grupo de alta mobilidade HMG-I/HMG-Y) é unha proteína que en humanos está codificada polo xene HMGA1 situado no cromosoma 6.^[1][2]

HMGA1
Identificadores
Símbolo	HMGA1
Símbolos alt.	HMG-R, HMGA1A, HMGIY, high mobility group AT-hook 1
Entrez	3159
RefSeq	NP_002122.1
UniProt	P17096
Outros datos
Locus	Cr. 6 :(34.24 – 34.25 Mb)

Función

Este xene codifica unha proteína non histónica da cromatina implicada en moitos procesos celulares, incluíndo a regulación da transcrición de xenes inducibles, replicación do ADN, organización da heterocromatina, integración de retrovirus en cromosomas, e a progresión metastática de células cancerosas.

As proteínas HMGA1 son bastante pequenas (~10-12 kDa); son moléculas básicas, e constan de tres ganchos AT coa secuencia motivo central RGRP (Arg-Gly-Arg-Pro), un novo dominio con enlaces cruzados localizado entre o segundo e terceiro gancho AT, e unha cola ácida C-terminal característica da familia de proteínas HMG, a cal comprende as proteínas HMGA, HMGB e HMGN.

As proteínas de fusión HMGA1-GFP son moi dinámicas in vivo (determinado usando a análise FRAP), pero en contraste tamén mostran afinidade nanomolar para o ADN rico en AT in vitro (determinado bioquimicamente), que podería explicarse debido a unha ampla modificación postraducional in vivo. A HMGA1 únese preferencialmente ao suco menor das rexións ricas en AT do ADN bicatenario usando os seus ganchos AT. Ten pouca estrutura secundaria en solución pero adopta distintas conformacións cando está unida a substratos como o ADN e outras proteínas. As proteínas HMGA1 teñen unha gran cantidade de diversas modificacións postraducionais e están localizadas principalmente no núcleo, especialmente na heterocromatina, pero tamén na mitocondria e a citoplasma.

Recentemente, as proteínas HMGA1, HMGA1a e HMGA1b, poden crear enlaces cruzados coas febras de ADN in vitro e poden inducir agrupamentos da cromatina in vivo, o que suxire un papel estrutural da proteína HMGA1 na organización da heterocromatina.^[3]

Atopáronse polo menos sete variantes de transcrición codificadas en dúas isoformas diferentes (HMGA1a, HMGA1b) para este xene.^[4] Discútese se a variante de empalme HMGA1c con só dous ganchos AT e sen cola ácida se é un verdadeiro membro da familia HMGA.

Os ratos que carecen das variantes de HMGA1, é dicir, ratos Hmga1-/-, son diabéticos, e mostran hipertrofia cardíaca e expresan baixos niveis do receptor de insulina.^[5]

Interaccións

HMGA1 presenta interaccións con CEBPB^[6] e o factor de transcrición Sp1.^[6]

Notas

1. Friedmann M, Holth LT, Zoghbi HY, Reeves R (Sep 1993). "Organization, inducible-expression and chromosome localization of the human HMG-I(Y) nonhistone protein gene". Nucleic Acids Research 21 (18): 4259–67. PMC 310059. PMID 8414980. doi:10.1093/nar/21.18.4259.
2. Reeves R, Beckerbauer L (May 2001). "HMGI/Y proteins: flexible regulators of transcription and chromatin structure". Biochimica et Biophysica Acta 1519 (1-2): 13–29. PMID 11406267. doi:10.1016/S0167-4781(01)00215-9.
3. Vogel B, Löschberger A, Sauer M, Hock R (Sep 2011). "Cross-linking of DNA through HMGA1 suggests a DNA scaffold". Nucleic Acids Research 39 (16): 7124–33. PMC 3167630. PMID 21596776. doi:10.1093/nar/gkr396.
4. "Entrez Gene: HMGA1 high mobility group AT-hook 1".
5. Semple RK (2009). "From bending DNA to diabetes: the curious case of HMGA1". Journal of Biology 8 (7): 64. PMC 2736670. PMID 19664187. doi:10.1186/jbiol164. Arquivado dende o orixinal o 17 de outubro de 2015. Consultado o 18 de outubro de 2016.
6. Foti D, Iuliano R, Chiefari E, Brunetti A (Apr 2003). "A nucleoprotein complex containing Sp1, C/EBP beta, and HMGI-Y controls human insulin receptor gene transcription". Molecular and Cellular Biology 23 (8): 2720–32. PMC 152545. PMID 12665574. doi:10.1128/MCB.23.8.2720-2732.2003.

Véxase tamén

Outros artigos

• Proteínas do grupo de alta mobilidade
• HMGA
• HMGA2
• gancho AT

Bibliografía

• Hui H, Perfetti R (Feb 2002). "Pancreas duodenum homeobox-1 regulates pancreas development during embryogenesis and islet cell function in adulthood". European Journal of Endocrinology / European Federation of Endocrine Societies 146 (2): 129–41. PMID 11834421. doi:10.1530/eje.0.1460129.
• Van Maele B, Debyser Z (2005). "HIV-1 integration: an interplay between HIV-1 integrase, cellular and viral proteins". AIDS Reviews 7 (1): 26–43. PMID 15875659.
• Van Maele B, Busschots K, Vandekerckhove L, Christ F, Debyser Z (Feb 2006). "Cellular co-factors of HIV-1 integration". Trends in Biochemical Sciences 31 (2): 98–105. PMID 16403635. doi:10.1016/j.tibs.2005.12.002.
• Reeves R, Nissen MS (May 1990). "The A.T-DNA-binding domain of mammalian high mobility group I chromosomal proteins. A novel peptide motif for recognizing DNA structure". The Journal of Biological Chemistry 265 (15): 8573–82. PMID 1692833.
• Nissen MS, Langan TA, Reeves R (Oct 1991). "Phosphorylation by cdc2 kinase modulates DNA binding activity of high mobility group I nonhistone chromatin protein". The Journal of Biological Chemistry 266 (30): 19945–52. PMID 1939057.
• Eckner R, Birnstiel ML (Aug 1989). "Cloning of cDNAs coding for human HMG I and HMG Y proteins: both are capable of binding to the octamer sequence motif". Nucleic Acids Research 17 (15): 5947–59. PMC 318252. PMID 2505228. doi:10.1093/nar/17.15.5947.
• Johnson KR, Lehn DA, Reeves R (May 1989). "Alternative processing of mRNAs encoding mammalian chromosomal high-mobility-group proteins HMG-I and HMG-Y". Molecular and Cellular Biology 9 (5): 2114–23. PMC 363005. PMID 2701943. doi:10.1128/mcb.9.5.2114.
• Palvimo J, Linnala-Kankkunen A (Oct 1989). "Identification of sites on chromosomal protein HMG-I phosphorylated by casein kinase II". FEBS Letters 257 (1): 101–4. PMID 2806554. doi:10.1016/0014-5793(89)81796-X.
• Karlson JR, Mørk E, Holtlund J, Laland SG, Lund T (Feb 1989). "The amino acid sequence of the chromosomal protein HMG-Y, its relation to HMG-I and possible domains for the preferential binding of the proteins to stretches of A-T base pairs". Biochemical and Biophysical Research Communications 158 (3): 646–51. PMID 2920035. doi:10.1016/0006-291X(89)92770-8.
• Lund T, Dahl KH, Mørk E, Holtlund J, Laland SG (Jul 1987). "The human chromosomal protein HMG I contains two identical palindrome amino acid sequences". Biochemical and Biophysical Research Communications 146 (2): 725–30. PMID 3619901. doi:10.1016/0006-291X(87)90589-4.
• Leger H, Sock E, Renner K, Grummt F, Wegner M (Jul 1995). "Functional interaction between the POU domain protein Tst-1/Oct-6 and the high-mobility-group protein HMG-I/Y". Molecular and Cellular Biology 15 (7): 3738–47. PMC 230612. PMID 7791781. doi:10.1128/mcb.15.7.3738.
• John S, Reeves RB, Lin JX, Child R, Leiden JM, Thompson CB, Leonard WJ (Mar 1995). "Regulation of cell-type-specific interleukin-2 receptor alpha-chain gene expression: potential role of physical interactions between Elf-1, HMG-I(Y), and NF-kappa B family proteins". Molecular and Cellular Biology 15 (3): 1786–96. PMC 230403. PMID 7862168. doi:10.1128/mcb.15.3.1786.
• Farnet CM, Bushman FD (Feb 1997). "HIV-1 cDNA integration: requirement of HMG I(Y) protein for function of preintegration complexes in vitro". Cell 88 (4): 483–92. PMID 9038339. doi:10.1016/S0092-8674(00)81888-7.
• Miller MD, Farnet CM, Bushman FD (Jul 1997). "Human immunodeficiency virus type 1 preintegration complexes: studies of organization and composition". Journal of Virology 71 (7): 5382–90. PMC 191777. PMID 9188609.
• Huth JR, Bewley CA, Nissen MS, Evans JN, Reeves R, Gronenborn AM, Clore GM (Aug 1997). "The solution structure of an HMG-I(Y)-DNA complex defines a new architectural minor groove binding motif". Nature Structural Biology 4 (8): 657–65. PMID 9253416. doi:10.1038/nsb0897-657.
• Currie RA (Dec 1997). "Functional interaction between the DNA binding subunit trimerization domain of NF-Y and the high mobility group protein HMG-I(Y)". The Journal of Biological Chemistry 272 (49): 30880–8. PMID 9388234. doi:10.1074/jbc.272.49.30880.
• Chin MT, Pellacani A, Wang H, Lin SS, Jain MK, Perrella MA, Lee ME (Apr 1998). "Enhancement of serum-response factor-dependent transcription and DNA binding by the architectural transcription factor HMG-I(Y)". The Journal of Biological Chemistry 273 (16): 9755–60. PMID 9545312. doi:10.1074/jbc.273.16.9755.
• Chiappetta G, Tallini G, De Biasio MC, Manfioletti G, Martinez-Tello FJ, Pentimalli F, de Nigris F, Mastro A, Botti G, Fedele M, Berger N, Santoro M, Giancotti V, Fusco A (Sep 1998). "Detection of high mobility group I HMGI(Y) protein in the diagnosis of thyroid tumors: HMGI(Y) expression represents a potential diagnostic indicator of carcinoma". Cancer Research 58 (18): 4193–8. PMID 9751634.
• Vogel B, Löschberger A, Sauer M, Hock R (Sep 2011). "Cross-linking of DNA through HMGA1 suggests a DNA scaffold". Nucleic Acids Research 39 (16): 7124–33. PMC 3167630. PMID 21596776. doi:10.1093/nar/gkr396.

Ligazóns externas

• HMGA1 protein, human Medical Subject Headings (MeSH) na Biblioteca Nacional de Medicina dos EUA.