Nommés à partir du genre typeZoopage, l'ordre des Zoopagales a été proposé par Richard Keith Benjamin(d) en 1979[6], la sous-division des Zoopagomycotina par Gerald Leonard Benny(d) en 2007[7], la classe des Zoopagomycetes par Alexander Borissowitsch Doweld(d) en 2014[8] et la division des Zoopagomycota par Andrii Pylypovych Gryganskyi(d), Matthew Edward Smith(d), Joseph W. Spatafora(d) et Jason E. Stajich(d) en 2016[9]. Une étude de 2019 montre que les Zoopagales sont monophylétiques et que l'état ancestral de ce clade était soit le mycoparasitisme, soit la prédation (les champignons prédateurs étant définis comme se nourrissant de plus d'un individu au cours d'une étape de leur cycle de vie, tandis que les champignons parasites sont définis comme exploitant un seul individu au cours d'une étape de leur cycle)[1].
(en) Richard Keith Benjamin, The Whole Fungus: The Sexual-asexual Synthesis: Proceedings of the Second International Mycological Conference, Held at the Environmental Sciences Centre of the University of Calgary, Kananaskis, Alberta, Canada, National Museum of Natural Sciences, National Museums of Canada and the Kananaskis Foundation, (ISBN978-0-660-00146-3, lire en ligne)
(en) David Scott Hibbett, Manfred Binder, Joseph F. Bischoff, Meredith Blackwell, Paul F. Cannon, Ove E. Eriksson, Sabine Huhndorf, Timothy James, Paul M Kirk, Robert Lücking, H Thorsten Lumbsch, François Lutzoni, P Brandon Matheny, David J. McLaughlin, Martha J. Powell, Scott Redhead, Conrad L Schoch, Joseph W. Spatafora, Joost A. Stalpers, Rytas Vilgalys, M. Catherine Aime, André Aptroot, Robert Bauer, Dominik Begerow, Gerald L Benny, Lisa A Castlebury, Pedro W Crous, Yu-Cheng Dai, Walter Gams, David M Geiser, Gareth W. Griffith, Cécile Gueidan, David L Hawksworth, Geir Hestmark, Kentaro Hosaka, Richard A. Humber, Kevin D Hyde, Joseph E. Ironside, Urmas Kõljalg, Cletus P Kurtzman, Karl-Henrik Larsson, Robert Lichtwardt, Joyce Longcore, Jolanta Miądlikowska, Andrew Miller, Jean-Marc Moncalvo, Sharon Mozley-Standridge, Franz Oberwinkler, Erast Parmasto, Valérie Reeb, Jack D Rogers, Claude Roux, Leif Ryvarden, José Paulo Sampaio, Arthur Schüssler, Junta Sugiyama, R Greg Thorn, Leif Tibell, Wendy A Untereiner, Christopher Walker, Zheng Wang, Alex Weir, Michael Weiss, Merlin M White, Katarina Winka, Yi-Jian Yao et Ning Zhang, «A higher-level phylogenetic classification of the Fungi», Mycological Research, Cambridge University Press, vol.111, noPt 5, , p.509-547 (ISSN0953-7562 et 1469-8102, PMID17572334, DOI10.1016/J.MYCRES.2007.03.004, lire en ligne)..
(en) Joseph W Spatafora, Ying Chang, Gerald L Benny, Katy Lazarus, Matthew Edward Smith, Mary L Berbee, Gregory Bonito, Nicolas Corradi, Igor V. Grigoriev, Andrii Gryganskyi, Timothy Y James, Kerry O'Donnell, Robert W Roberson, Thomas N Taylor, Jessie Uehling, Rytas J. Vilgalys, Merlin M White et Jason E. Stajich, «A phylum-level phylogenetic classification of zygomycete fungi based on genome-scale data», Mycologia, Mycological Society of America (d), NYBG et Taylor & Francis, vol.108, no5, , p.1028-1046 (ISSN0027-5514 et 1557-2536, OCLC1640733, PMID27738200, PMCID6078412, DOI10.3852/16-042)..
(en) P.M. Kirk, P.F. Cannon, D.W. Minter et J.A. Stalpers, Dictionary of the Fungi, Wallingford CABI, , 760p. (ISBN978-0-85199-826-8, lire en ligne), p.346