PARN

Le PARN (pour « Poly(A)-specific ribonuclease ») est une enzyme de type ribonucléase dont le gène est le PARN situé sur le chromosome 16 humain.

PARN
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 2A1R, 2A1S, 3CTR
Identifiants
Aliases	PARN
IDs externes	OMIM: 604212 MGI: 1921358 HomoloGene: 31098 GeneCards: PARN
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 16 humain[1] Locus 16p13.12 Début 14,435,700 bp[1] Fin 14,632,728 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 16 (souris)[2] Locus 16|16 A1 Début 13,355,824 bp[2] Fin 13,486,034 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans tendon calcanéen corps calleux testicule tonsille epithelium of colon gonade cellule de la moelle osseuse muscle lisse îlot de Langerhans vessie Fortement exprimé dans valve aortique aorte ascendante corpuscule rénal medullary collecting duct Cellule de Paneth saccule Ectoderme otic vesicle otic placode ligne primitive Plus de données d'expression de référence BioGPS Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology Fonction moléculaire liaison ion métal mRNA 3'-UTR binding liaison protéique Fixation d'acide nucléique activité nucléase exonuclease activity activité hydrolase protein kinase binding cation binding liaison ARN poly(A)-specific ribonuclease activity telomerase RNA binding 3'-5'-exoribonuclease activity Composant cellulaire cytoplasme cytosol nucléole noyau Processus biologique mRNA catabolic process female gamete generation regulation of mRNA stability édition du ARN dégradation des ARNm non-sens nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic telomerase RNA stabilization positive regulation of telomere maintenance via telomerase positive regulation of telomerase activity regulation of telomerase RNA localization to Cajal body ncRNA deadenylation box H/ACA RNA 3'-end processing miRNA catabolic process polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 5073 74108 Ensembl ENSG00000140694 ENSG00000274829 ENSMUSG00000022685 UniProt O95453 Q8VDG3 RefSeq (mRNA) NM_001134477 NM_001242992 NM_002582 NM_028761 NM_001358452 NM_001358453 RefSeq (protéine) NP_001127949 NP_001229921 NP_002573 NP_083037 NP_001345381 NP_001345382 Localisation (UCSC) Chr 16: 14.44 – 14.63 Mb Chr 16: 13.36 – 13.49 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
Voir/Editer Humain Voir/Editer Souris

Rôle

Il s'agit d'une exoribonucléase dégradant l'extrémité 3' de l'ARN comportant une courte chaîne d'adénosines (d'où le terme « poly(A) »).

Cet enzyme est ubiquitaire chez les eucaryotes^[5].

En médecine

Une mutation du gène est responsable d'une dyskératose congénitale^[6].

Notes et références

1. ENSG00000274829 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000140694, ENSG00000274829 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022685 - Ensembl, May 2017
3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
5. Vlachakis D, Pavlopoulou A, Tsiliki G, Komiotis D, Stathopoulos C, Balatsos NA, Kossida S, An integrated in silico approach to design specific inhibitors targeting human poly(A)-specific ribonuclease, PLoS One, 2012;7:e51113
6. Tummala H, Walne A, Collopy L et al. Poly(A)-specific ribonuclease deficiency impacts telomere biology and causes dyskeratosis congenita, J Clin Invest, 2015;125:2151-2160

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