Le nom de genre Mycobacterium vient du grec μύκης (múkēs) «champignon» et du latin bactērium parce que le bacille de Koch, cultivé sur un milieu liquide, forme sur la surface un voile dont l'aspect rappelle une moisissure[1].
Classification de Runyon
La taxonomie du genre Mycobacterium reposait sur la classification de Runyon (1954) fondée sur la vitesse de croissance et la pigmentation (4 groupes présentés dans le tableau suivant).
Mais dans la pratique courante, on distingue les mycobactéries tuberculeuses du complexe Mycobacterium tuberculosis comprenant les espèces déterminant la tuberculose humaine (M. tuberculosis), bovine (M. bovis) ou celle observée le plus souvent en Afrique noire (M. africanum).
Espèces pathogènes pour l'homme du groupe tuberculosis
En 2018 R.S. Gupta et al. ont proposé une importante refonte du genre Mycobacterium en s'appuyant sur des techniques de phylogénétique moléculaire[2]. En analysant le génome des 150 espèces de Mycobactéries séquencées au moment de l'étude, à travers la comparaison de trois séries de protéines conservées parmi elles et sur la base d'autres données concordantes, cette équipe a démontré l'hétérogénéité de l'ancien genre unique Mycobacterium. Un grand nombre d'espèces en ont été exclues et reclassées dans quatre nouveaux genres créés pour l'occasion: Mycolicibacter, Mycolicibacillus, Mycolicibacterium et Mycobacteroides. Le genre Mycobacterium a été conservé mais avec un nombre d'espèces plus restreint.
En , Gupta amende la description de l'ordre des Mycobactériales en y incluant la famille des Mycobacteriaceae[3],[4].
Gupta RS et al. «Phylogenomics and Comparative Genomic Studies Robustly Support Division of the Genus Mycobacterium into an Emended Genus Mycobacterium and Four Novel Genera» Front Microbiol. 2018;9:67. Accès libre.
Riojas MA et al. «Phylogenomic analysis of the species of the Mycobacterium tuberculosis complex demonstrates that Mycobacterium africanum, Mycobacterium bovis, Mycobacterium caprae, Mycobacterium microti and Mycobacterium pinnipedii are later heterotypic synonyms of Mycobacterium tuberculosis» Int J Syst Evol Microbiol. 2018 Jan;68(1):324-332.
