Geoffroy suit les cours de Joseph Pitton de Tournefort (1656-1708). Entre 1704 et 1705, il accomplit dans le Midi de la France un voyage dont il rapporte une riche collection de plantes et de graines. En 1708, il reprend la pharmacie de son père après la mort de ce dernier. En 1731, il est nommé inspecteur de la pharmacie de l'Hôtel-Dieu et échevin.
Il devient élève botaniste à l'Académie des sciences le , associé botaniste le , puis associé chimiste le , enfin pensionnaire chimiste le . Le , il est nommé Fellow de la Société royale de Londres. Il fait paraître un grand nombre de mémoires dans les Recueils de l’Académie des sciences.
Étienne Louis Geoffroy (1725-1810), son neveu, établit en 1753 le Catalogue raisonné des minéraux, coquilles et autres curiosités naturelles contenues dans le cabinet de feu M. Geoffroy.
Étienne Geoffroy ( -Paris, 5 avril 1670), maître apothicaire, marié à le 6 février 1639 à Marie Fremin, fille de François Fremin, maître chirurgien à Paris, et de Marguerite Roussel[2],
«Observations sur les Huiles essentielles, avec quelques conjectures sur la cause des couleurs des feuilles & des fleurs des Plantes», dans Mémoires de l'Académie royale des Sciences pour l'année 1707 (1730), p.517-526. ()
«Observations Sur la Vegetation des Truffes», dans Mémoires de l'Académie royale des Sciences pour l'année 1711 (1730), p.23-35. ()
«Observations Sur la Structure & l'Usage des principales parties des Fleurs», dans Mémoires de l'Académie royale des Sciences pour l'année 1711 (1730), p.207-230. ()
«Suite des observations sur les Bézoards», dans Mémoires de l'Académie royale des Sciences pour l'année 1712 (1731), p.199-208. ()
«Observations Des différens degrés de chaleur que l'Esprit de Vin communique à l'Eau par son mêlange», dans Mémoires de l'Académie royale des Sciences pour l'année 1713 (1739), p.51-52. ()
«Observations sur l'Huile d'Aspic, et sur son choix», dans Mémoires de l'Académie royale des Sciences pour l'année 1715 (1741), p.236-241. ()
«Observations sur la nature et la composition du sel ammoniac», dans Mémoires de l'Académie royale des Sciences pour l'année 1720 (1722), p.189-207. ()
«Suite des observations sur la fabrique du sel ammoniac, avec sa décomposition pour en tirer le sel volatil, que l'on nomme vulgairement sel d'Angleterre», dans Mémoires de l'Académie royale des Sciences pour l'année 1723 (1753), p.210-222. ()
«Observations Sur un Métal qui résulte de l'Alliage du Cuivre & du Zinc», dans Mémoires de l'Académie royale des Sciences pour l'année 1725 (1727), p.57-66. ()
«Observations sur le Meslange de Quelques Huiles Essentielles avec l'Esprit De Vin», dans Mémoires de l'Académie royale des Sciences pour l'année 1727 (1729), p.114-120. ()
«Suite d'Observations sur les huiles essentielles, leur altération & la maniere de rectifier celles de certains fruits, avec un examen des changemens qui arrivent à l'huile d'anis», dans Mémoires de l'Académie royale des Sciences pour l'année 1728 (1753), p.88-99. ()
«Examen du Vinaigre Concentré par la Gelée», dans Mémoires de l'Académie royale des Sciences pour l'année 1729 (1731), p.68-78. ()
«Examen Chymique des Viandes qu'on employe ordinairement dans les Bouillons; par lequel on peut connoître la quantité d'Extrait qu'elles fournissent, & déterminer ce que chaque Bouillon doit contenir de suc nourrissant», dans Mémoires de l'Académie royale des Sciences pour l'année 1730 (1732), p.217-232. ()
Part of a Letter from Monsieur Claud. Joseph Geoffroy, F.R.S. to David Hartley, M.A. F.R.S. Containing His Method of Making Soap-Lees and Hard Soap, for Medicinal Uses, dans Philosophical Transactions, Vol. 42 (1742), p.71-77.
Paul Dorveaux, Apothicaires membres de l'Académie royale des Sciences. VII - Claude-Joseph Geoffroy, dans Revue d'histoire de la pharmacie, 1932, Volume 20, no79, p.113-122(lire en ligne)
Maurice Bouvet, Les apothicaires, échevins de Paris, dans Revue d'histoire de la pharmacie, 1952, Volume 40, no135, p.433-446(lire en ligne)