genre de bactéries De Wikipédia, l'encyclopédie libre
Le genreBurkholderia (auparavant faisant partie du genre Pseudomonas) regroupe un ensemble de bactéries qui colonisent une très large variété de niches écologiques, c'est quasiment un genre ubiquiste. Ce sont des bactéries à coloration Gram négatives, mobiles, aérobies obligatoires formant des bâtonnets, et qui sont pour certaines espèces pathogènes pour l'homme, les animaux et les plantes. Néanmoins le genre comporte également des espèces importantes pour l'écologie de l'environnement.
Les sept premières espèces du genre Burkholderia ont d'abord été classées dans le genre Pseudomonas avant d'être caractérisées comme un genre à part entière en 1992 et transférées dans ce nouveau genre avec l'espèce Burkholderia cepacia comme espèce type[2]. Le nom du genre Burkholderia a ensuite été validé en 1993 d'où cette date d'autorité[1].
Ce genre comprend des espèces connues pour être pathogène pour l'humain, les animaux et les plantes mais comprend aussi des espèces qui peuvent être importantes pour l'écologie et l'environnement. Par exemple, Burkholderia xenovorans (auparavant nommée Pseudomonas cepacia, puis Burkholderia cepacia et Burkholderia fungorum) est étudiée pour ses aptitudes de dégradation des liaisons organochlorées des pesticides et du polychlorobiphényle (PCB).
Ainsi certaines espèces de Burkholderia sont étudiées pour leurs capacités à réhabiliter le sol des friches industrielles chimiques, tandis que d'autres espèces du même genre présentent un intérêt dans les cultures pour leurs rôles au niveau de la rhizosphère.
De par leurs résistances aux antibiotiques et les taux de mortalité qu'elles engendrent, les espèces Burkholderia mallei et Burkholderia pseudomallei peuvent être classées parmi les armes biologiques potentielles.
Étymologie
L'étymologie du genre Burkholderia est la suivante: Burk.hol.de’ria N.L. neut. pl. n. suff. -ia, suffixe utilisé pour désigner une classe; N.L. fem. n. Burkholderia, ce nom de genre a été proposé 1992 (avec Errata 1993) par Eiko Yabuuchi et collègues d'après le nom du phytopathologueWalter H. Burkholder, qui, au milieu du XXesiècle à l'université Cornell, étudia et décrit de nombreuses bactéries phytopathogènes[3],[4].
Espèces valides
Selon la LPSN(12 décembre 2022)[5], les espèces du genre Burkholderia publiées de manière valides sont les suivantes:
Burkholderia aenigmatica Depoorter et al. 2020
Burkholderia ambifaria Coenye et al. 2001
Burkholderia anthina Vandamme et al. 2002
Burkholderia arboris Vanlaere et al. 2008
Burkholderia caribensis Achouak et al. 1999
Burkholderia caryophylli (Burkholder 1942) Yabuuchi et al. 1993
Burkholderia pyrrocinia (Imanaka et al. 1965) Vandamme et al. 1997
Burkholderia sacchari Brämer et al. 2001
Burkholderia singaporensis
Burkholderia sordidicola Lim et al. 2003
Burkholderia stabilis Vandamme et al. 2000
Burkholderia terricola Goris et al. 2003
Burkholderia thailandensis Brett et al. 1998
Burkholderia tropica Reis et al. 2004
Burkholderia tuberum Vandamme et al. 2003
Burkholderia ubonensis corrig. Yabuuchi et al. 2000
Burkholderia unamae Caballero-Mellado et al. 2004
Burkholderia vietnamiensis Gillis et al. 1995
Burkholderia xenovorans Goris et al. 2004
Espèces non validées
Plusieurs espèces n'ont pas été publiées de manière valide ou sont en attente de validation, selon la LPSN(12 décembre 2022)[5], on trouve dans ces cas précis, les espèces suivantes:
Burkholderia agricolaris Shu et al. 2018
Candidatus Burkholderia alatipes Lemaire et al. 2011
Burkholderia alba Lee et al. 2018
Candidatus Burkholderia amboniana Lemaire et al. 2011
Candidatus Burkholderia andongensis Lemaire et al. 2011
Candidatus Burkholderia anthocleistifolia Lemaire et al. 2011
Burkholderia australis Paungfoo-Lonhienne et al. 2014
Candidatus Burkholderia bidentata Lemaire et al. 2011
Candidatus Burkholderia bifaria Lemaire et al. 2011
Candidatus Burkholderia brachyantha Lemaire et al. 2011
Candidatus Burkholderia brachyanthoides Lemaire et al. 2011
Burkholderia brasilensis Baldani et al. 1997
Candidatus Burkholderia brevipaniculata Lemaire et al. 2011
Espèces synonymes
Toujours selon la LPSN(12 décembre 2022)[5], plusieurs espèces de ce genre sont considérées comme des synonymes et dont le nom ne doit plus être utilisé, à savoir:
Burkholderia acidipaludis est un synonyme de l'espèce Paraburkholderia acidipaludis (Aizawa et al. 2010) Sawana et al. 2017
Burkholderia alpina est un synonyme de l'espèce Pararobbsia alpina (Weber and King 2017) Lin et al. 2020
Burkholderia andropogonis est un synonyme de l'espèce Robbsia andropogonis (Smith 1911) Lopes-Santos et al. 2017
Burkholderia arationis est un synonyme de l'espèce Caballeronia arationis (Peeters et al. 2016) Dobritsa et al. 2017
Burkholderia arvi est un synonyme de l'espèce Caballeronia arvi (Peeters et al. 2016) Dobritsa et al. 2017
Burkholderia aspalathi est un synonyme de l'espèce Paraburkholderia aspalathi (Mavengere et al. 2014) Sawana et al. 2017
Burkholderia bannensis est un synonyme de l'espèce Paraburkholderia bannensis (Aizawa et al. 2011) Sawana et al. 2015
Burkholderia bryophila est un synonyme de l'espèce Paraburkholderia bryophila (Vandamme et al. 2007) Sawana et al. 2015
Burkholderia caballeronis est un synonyme de l'espèce Paraburkholderia caballeronis (Martínez-Aguilar et al. 2014) Sawana et al. 2017
Burkholderia caledonica est un synonyme de l'espèce Paraburkholderia caledonica (Coenye et al. 2001) Sawana et al. 2015
Les espèces suivantes sont connues pour leurs pathogènicités vis-à-vis de l'homme et ou d'autres animaux:
(en) Anonymous, «Validation of the Publication of New Names and New Combinations Previously Effectively Published Outside the IJSB.», Int J Syst Bacteriol, vol.43, no2, , p.398-399 (DOI10.1099/00207713-43-2-398)
(en) Eiko Yabuuchi, Yoshimasa Kosako, Hiroshi Oyaizu, Ikuya Yano, Hisako Hotta, Yasuhiro Hashimoto, Takayuki Ezaki et Michio Arakawa, «Proposal of Burkholderia gen. nov. and Transfer of Seven Species of the Genus Pseudomonas Homology Group II to the New Genus, with the Type Species Burkholderia cepacia (Palleroni and Holmes 1981) comb. nov.», Microbiology and Immunology, vol.36, no12, , p.1251-1275 (DOI10.1111/j.1348-0421.1992.tb02129.x)
