Akkermansia muciniphila
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Akkermansia muciniphila est une bactérie dégradant la mucine (d'où son nom) et appartenant à la famille des Verrucomicrobiaceae.
Akkermansia muciniphila
Domaine | Bacteria |
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Phylum | Verrucomicrobiota |
Classe | Verrucomicrobiia |
Ordre | Verrucomicrobiales |
Famille | Akkermansiaceae |
Genre | Akkermansia |
En médecine
Cette bactérie fait partie du microbiote du tube digestif humain[2]. Sa concentration diminue en cas de diabète de type 2 ou d'obésité[3].
Sur un modèle animal, l'administration de ce germe permettrait une meilleure équilibration du diabète[4] et freinerait la formation de plaques d'athérome[5]. D'après une étude suédoise la consommation de poissons gras favoriserait le développement de la bactérie[6],[7].
Une étude[8] de 2018, montre l'influence favorable de cette bactérie sur l'immunothérapie des tumeurs épithéliales avec du nivolumab. Une autre[9] lui attribue l'effet anti-épileptique du régime cétogène.
Description
Les bactéries de cette espèce sont des bactéries gram négatives strictement anaérobies[10] et capables de croître sur milieu sans vitamines[11]. Ces bactéries ont une forme plutôt ovale et sont non mobiles[10]. Elles ont une longueur de 0,6 à 1,0 µm. Elles peuvent être présentes sous forme de cellules seules, en paires, sous la forme de petites chaînes ou encore sous forme de petits agrégats[10].
La croissance de ces bactéries est possible de 20 °C à 40 °C et dans des zones de pH allant de pH 5.5 à pH 8.0 mais la croissance est optimale à 37 °C avec pH de 6.5. Elles sont capables de croître sur la mucine gastrique, sur infusion cœur-cerveau, sur milieu Columbia[10].
Taxonomie
Résumé
Contexte
Le nom correct complet (avec auteur) de ce taxon est Akkermansia muciniphila Derrien et al. 2004[1],[2]. Cette espèce est l'espèce type du genre Akkermansia décrit dans la même publication[12].
Étymologie
L'étymologie de cette espèce de bactérie est la suivante : mu.ci.ni’phi.la. N.L. neut. n. mucinum, mucine; Gr. masc. adj. philos, aimant; N.L. fem. adj. muciniphila, qui aime la mucine[1].
Souche type
La souche type de l'espèce Akkermansia muciniphila est la souche Muc déposée dans la banque de culture bactérienne ATCC sous le numéro ATCCBAA-835 et dans la collection de l'Institut Pasteur sous le numéro CIP 107961[12].
Phylogénie
Une analyse phylogénétique basée sur le séquençage du gène de l'ARNr 16S de la souche Muc a montré que l'espèce cultivable la plus proche est l'espèce Verrucomicrobium spinosum avec 92 % d'homologie[11]. La construction d'un dendrogramme basé sur ce séquençage a permis de déterminer que cette espèce fait partie de l'ordre Verrucomicrobiales, de la classe Verrucomicrobiae (nom désormais corrigé en Verrucomicrobiia) et du phylum Verrucomicrobia (maintenant renommé Verrucomicrobiota)[13]. La souche type de cette espèce A. muciniphila est proche des genres Verrucomicrobium et Prosthecobacter mais suffisamment différente pour faire partie d'un nouveau genre appelé Akkermansia[13].
Notes et références
Bibliographie
Liens externes
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