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Les Thermomicrobiota sont un embranchement (ou phylum, ou encore division) du règne des Bacteria. Son nom provient de Thermomicrobium qui est le genre type de cet embranchement.
En 2022 selon la LPSN (2 décembre 2022)[2] cet embranchement ne comporte qu'une seule classe, les Thermomicrobia Garrity & Holt 2002.
L'étymologie du phylum Thermomicrobiota est la suivante : Ther.mo.mi.cro.bi.o’ta N.L. neut. n. Thermomicrobium, genre type du phylum; N.L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe utilisé pour définir un phylum; N.L. neut. pl. n. Thermomicrobiota, le phylum des Thermomicrobium[1],[3].