Disciple de François Furet[2], présenté par l'historien André Larané comme «l’un des meilleurs connaisseurs contemporains» de la Révolution et de l'Empire[3], il est notamment connu pour avoir publié une «monumentale» biographie de Napoléon[4],[5],[6],[7],[8]. Il a déclaré que: «Notre époque ne connaît plus d’hommes providentiels»[9]
La Politique de la Terreur: essai sur la violence révolutionnaire (1789-1794), Paris, Fayard 2000, réédition Gallimard, coll.«Tel», numéro 323, , 376p. (ISBN2-213-60575-0 et 2-07-076727-2, présentation en ligne), compte rendu de lecture de Claude Mazauric[11]
Les Derniers Jours des rois, Paris, Perrin/Le Figaro Histoire, 2014
avec Pierre Branda, 1814. La campagne de France, Perrin, 380 p., 2016
avec Thierry Lentz, La Fin des Empires, Paris, Perrin, 2016
avec Lorraine de Meaux, Couples illustres de l'histoire de France, Perrin/Le Figaro Histoire, 2017
avec François-Guillaume Lorrain, Les Grandes Décisions de l'histoire de France, Perrin/Le Point, 408 p., 2018
avec François-Guillaume Lorrain, Révolutions françaises, du Moyen Âge à nos jours, Perrin/Le Point, 356 p., 2020
Contributions
Le Journal de la France et des Français, chronologie politique, culturelle et religieuse de Clovis à 2000 (collectif), Paris, Gallimard, coll.«Quarto», 2 volumes, 2001
«Censitaire», «Capacitaire», «Première République», «Révolution française», in Pascal Perrineau et Dominique Reynié (dir.), Dictionnaire du vote, Paris, PUF, 2001
«La Ire République», «La démocratie», «Condorcet», in Vincent Duclert et Christophe Prochasson (dir.), Dictionnaire critique de la République, Paris, Flammarion, 2002
«La Terreur», in Jean-Pierre Poussou (dir.), Le Bouleversement de l’ordre du monde. Révoltes et révolutions en Europe et aux Amériques à la fin du XVIIIesiècle, Paris, SEDES, p. 225-252, 2004
Préfaces
Loris Chavanette (éd.), Waterloo. Acteurs, historiens, écrivains (préface: p. 7-24), Paris, Gallimard, coll.«Folio classique», 896 p., 2015, [présentation en ligne]
Napoléon, Entre l'éternité, l'océan et la nuit - Correspondance; Robert Laffont, coll. "Bouquins" (ISBN9782221188903)
Melvin Edelstein, «Compte rendu: Patrice Gueniffey, Le Nombre et la Raison: La Révolution française et les élections», Annales historiques de la révolution française, Persée.fr, , p.161-164 (lire en ligne).
Claude Mazauric, «Compte rendu, Patrice Gueniffey, La Politique de la Terreur. Essai sur la violence révolutionnaire (1789-1794)», Annales historiques de la Révolution française, Persée.fr, année 2001, p.118-121 (lire en ligne).