Candidatus
terme de nomenclature bactériologique / De Wikipedia, l'encyclopédie encyclopedia
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Dans la nomenclature bactérienne, Candidatus[1] est un élément du nom taxonomique attribué à une espèce de bactérie impossible à maintenir en culture dans une collection bactériologique. Ce terme correspond à un statut taxonomique provisoire pour les organismes qui sont encore à cultiver. Exemple "Candidatus Phytoplasma allocasuarinae", qui peut s'abréger en "Ca. Phytoplasma allocasuarinae"[2]. Le statut Candidatus peut être utilisé quand une espèce ou un genre est bien caractérisé, mais pas encore cultivé. Dans ce cas, on ne peut pas utiliser les méthodes traditionnelles d'identification des bactéries, méthodes qui se basent sur des caractéristiques phénotypiques et physiologiques, mais beaucoup d'informations permettant une identification fiable des différentes souches bactériennes peuvent être obtenues par l'analyse phylogénétique de séquences de l'ARN ribosomique 16S ou même du génome presque complet par la métagénomique[3].
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